专利名称：Y-str的应用的制作方法人类基因组包括由22对常染色体和I对性染色体组成的核基因组和细胞质里以线粒体DNA组成的质 基因组。人类的遗传信息绝大部分是从父母双方遗传而来，在每一代都会经历基因重组的过程，但基因组中有两段DNA是例外，代表母系遗传的线粒体DNA和代表父系遗传的Y染色体，它们只从父母的一方遗传，很少发生重组。这样就如实的记录了不同时期的遗传突变情况，是很好的历史记录者。这是人类起源进化，民族遗传差异，个体遗传关系等方面研究的重要工具。在基因组序列里面，到处可以找到很多不同的遗传多态性标记，如RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism,限制性内切酶片段长度多态性)、STR(short tandem repeat,短串联重复序列、微卫星 DNA)、SNP (single nucleotidepolymorphism,单核苷酸多态性)。作为第二代遗传标记的STR，因个体间DNA片段长度或DNA序列差异而成高度多态性，STR由2-6个碱基对构成核心序列，串联重复排列。STR具有重复序列短，突变率高，扩增效率好，分型准确等特点，已广泛应用于医学个体识别和亲子鉴定等领域。STR根据其序列结构可分为两类简单STR和复杂STR。简单STR是有单一的核心重复序列；复杂的STR序列中含有两种以上不同的核心重复序列。一种核心序列的重复可能被另外一种重复序列所打断、对于简单STR，不同个体间的差异主要来源于单一核心序列重复次数的差别；对于复杂STR，差异主要来源于最长的核心重复序列重复次数的差另1J。1921年，Painter利用光学显微镜首次发现了人类细胞存在男性特有的Y染色体，Y染色体上含约519万KB的核苷酸，其中95%为非重组区域(NRY :NonrecombiningPortion of the Y Chromosome),目前在Y染色体上被克隆出来的基因有200多个。处于Y染色体非重组区的遗传多态位点，构成了整个基因组范围内信息量最大而且最稳定的单倍型，它在男性基因组中的恒定位置使其可以反映男性个人之间独特的遗传进化关系，是进行人类亲缘关系网络构建的最有力工具。Y染色体的遗传多态性的研究优势有①只在父亲和儿子间传递，严格的父系遗传；②人类Y_DNA大约60M碱基对，信息量大，其中95%为非重组区域(NRY)，不受重组干扰，突变成为Y_DNA改变的唯一因素，使得按年代先后发生的各种稳定的单倍型得以保存和进化，能够构建出很清楚的Y_DNA的谱系树；③对遗传漂变较敏感，Y染色体有效群体大小较小，NRY具有较低的群体内多态性和较高的群体间变异，易产生人群特异性的单倍型。并其分布方式具有极高的地理特异性；④Y染色体NRY发生回复、平行突变的概率非常低，增加了 Y_DNA谱系树的可靠性；⑤SNP突变率相对稳定，能够很好的区分群体间亲缘关系，STR的突变率高，能够很好区分近代人群个体之间的亲缘关系。利用Y染色体上稳定遗传的SNP，可以构建出个体之间或者家族之间明确的遗传渊源。SNP有稳定的突变速率(大约10_9)，统计出不同单倍型的Y染色体之间的突变差异数，将差异数除以速率，经过换算就可以估计两条Y染色体之间的分化时间。由于SNP的突变率实在太低，只能在时间大尺度上区分人群之间的遗传亲缘关系，STR的突变率比SNP的高很多。STR的突变是双向的，拷贝数可以增加或者减少。所以同一个祖先不同个体的同一 STR位点，可能有不同的突变方向和重复数。数个不同的STR也可以构成单倍型。根据现在通用的single-step突变模型，其假设为一个STR每次突变都只增加或者减少一个重复单元，且群体有着恒定的有效群体大小。t = Ne ln(l-V/Ne u)其中Ne是有效群体大小，u为突变率，In是自然对数，V是观察到的群体中的某一 STR数值的方差，计算得到的t 是经历的时代数，再乘以每代的年数就可以估算到时间。比如Heyer et al通过家系研究得到Y-STR的突变率为2. 1*10_3每个位点每代，Holtkemper U，et al通过家系研究得到 Y-STR的突变率大约为4. 0*10_3每个位点每代，根据大多数文献报道Y-STR的突变率约为 3. 4*10_3每个位点每代。只要检测到的Y-STR数量足够多，几乎每个人都可以构成独特的单倍型。这样就能够清晰的构建近代人群个体间的亲缘关系网络。现在的问题在于目前常用的 STR 位点比较少，常用的有 DYS19、DYS388、DYS389I、DYS389II、DYS390、DYS391、DYS392、 DYS393、DYS425、DYS426、DYS434、DYS435、DYS436、DYS437、DYS438、DYS439，并且这些 Y-STR 的普遍突变率偏低，很难深入全面地反映人群中个体之间的遗传亲缘关系，筛选并获得大量高突变率的Y-STR用于人类起源、进化、族群、个体之间的遗传关系研究非常重要。
本发明要解决目前Y-STR位点少、突变率低、难以深入全面地反映人群中个体之间遗传亲缘关系的技术问题，提供筛选出的高突变率的36个新Y-STR位点的应用，用于有效地进行个体鉴定。此外，还需要提供一种用于个体鉴定的检测试剂盒和检测方法。为了解决上述技术问题，本发明通过如下技术方案实现在本发明的一个方面，提供了一种Y-STR的应用，用于个体鉴定，所述Y-STR选自 DYGl DYG36中的任意一个或任意两个以上组合。所述个体鉴定包括法医鉴定、亲子鉴定、迷失儿童判认、或海外华侨归国寻根。在本发明的另一方面，还提供了一种Y-STR的应用，用于姓氏的起源、中国现代人类起源及迁徙路线的分析，所述Y-STR选自DYGl DYG36中的任意一个或任意两个以上组合 o在本发明的另一方面，还提供了一种用于个体鉴定的检测试剂盒，包含DYGl DYG36中至少一个Y-STR的特异性引物对。优选的，所述检测试剂盒包含DYGl DYG36所示Y-STR的特异性引物对。在本发明的另一方面，还提供了一种个体鉴定的检测方法，包括以下步骤扩增DYGl DYG36中至少一个Y-STR的序列。 优选的，所述检测方法扩增DYGl DYG36所示Y-STR的序列。优选的，所述扩增为PCR扩增。 本发明的主要优点如下I.筛选出的36个Y-STR新位点，丰富了 Y染色体分子研究的工具。2.新发现的36个Y-STR位点有很高区分度，有的达到0. 85，所有位点的整体区分度达0. 997，比之前常用的十多个Y-STR的区分度有明显提高，在实际的个体鉴定检测中，分辨率也明显提高。其将有效应用于法医鉴定，亲子鉴定，迷失儿童判认，海外华侨归国寻根，姓氏的起源，中国现代人类起源及迁徙路线等实际问题。
下面结合附图和
对本发明作进一步详细的说明。图I是本发明实施例I的36个Y-STR的区分度图。



本发明公开一种Y-STR的应用，用于个体鉴定，所述Y-STR选自DYG1～DYG36中的任意一个或任意两个以上组合。本发明还公开了一种用于个体鉴定的检测试剂盒和检测方法。本发明将筛选出的高突变率的36个新Y-STR位点有效应用于个体鉴定，分辨率和精确度显著提高。