已经作废了的发票，但第二联搞丢了，那该怎样处理留存联？

根据《国家税务总局关于修订的通知》第二十八条 规定：一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》（附件5），经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。

由于在寄出的途中丢失了，应当属于丢失前未认证增值税专用发票，因此，购买方（客户）凭销售方（贵公司）提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方（贵公司)所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方(客户）主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。扩展资料：关于增值税发票丢失，根据以下五种不同的情况有相应的处理方法：

1、一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，这种情况的增值税发票丢失：如果丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证；

2、如果丢失前未认证的，这种情况的增值税发票丢失：购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关同意后，可作为增值进项税额的抵扣凭证。

3、一般纳税人丢已开具专用发票的抵扣联，这种情况的增值税发票丢失怎么办。如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票联复印件留存备查。

4、如果丢失前未认证的，可使用专用发票的发票联到主管机关认证，专用发票的发票联复印件留存备查。

5、一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联，这种情况的增值税发票丢失怎么办。可以将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。