想在深圳办个做自动化设备的公司，请问是注册成个体工商户好呢还是注册成一般纳税人好呢？

首先，要纠正题主概念上面的混淆。

个体工商户有小规模纳税人和一般纳税人。小规模纳税人和一般纳税人只是针对于增值税这个税种而言。

如果题主想问的问题是注册个体工商户还是注册有限责任公司，哪个更好。

个体工商户是承担无限连带责任，而有限责任公司是以注册资本为限承担有限责任。从承担责任上来讲，还是选择有限责任公司更好。

个体工商户的经营所得是缴纳个人所得税。经营所得个人所得税税率表如下:

有限责任公司的经营所得是交企业所得税。企业所得税的税率是25%。

但是小微企业企业所得税有税收优惠政策。年度应纳税所得额小于或者等于300万，符合小型微利企业税收优惠政策。

适用税率20%

其中不超过100万的部分，减按25%计征。（实际税率:20%*25%=5%）

其中超过100万不超过300万的部分减按50%计征。

（实际税率:20%*50%=10%）

现在我们结合个体工商户个税计算税率表和企业所得税计算方法，来比较谁交的税更多。

当应纳税所得额不超过3万的时候，实际税率都是5%。没有谁比谁多交税。

当超过3万，不超过100万的时候，个体工商户个税的税率是10%到20%到30%到35%。而企业所得税的实际税率是5%。

很明显，当应纳税所得额是一样的时候，个体工商户会多交很多税。

当应纳税所得额超过100万，不超过300万的时候。个体工商户的个税税率是35%，而企业所得税实际税率是10%。

很明显，当应纳税所得额是一样的时候，个体工商户会多交很多税。

当应纳税所得额超过300万的时候，个体工商户的个税税率是35%，而企业所得税的税率是25%。

很明显，当应纳税所得额是一样的时候，个体工商户会多交很多税。

综上所述，个体工商户会比有限责任公司多交很多税。

如果是我来做选择的话，我肯定会注册有限责任公司。

当然，我以上讲的是个体工商户的查账征收。如果业务少，个体工商户也可能是核定征收。核定征收又包括定额征收和定率征收。比如一些很小的店就是核定征收。

如果题主想问的问题是注册小规模纳税人好，还是注册一般纳税人更好。

小规模纳税人和一般纳税人只是针对于增值税这个税种而言。所以区别就在于增值税的处理方式不同。

如果是小规模纳税人，取得增值税专用发票不能够抵扣销项税额，只能入成本费用。如果是一般纳税人，取得增值税专用发票可以抵扣销项税额。

对于小规模纳税人来讲还有一个税收优惠政策，那就是季度应税销售额不超过30万，免增值税。需要注意的是，只免普通发票的税，专用发票的税不免。

如果题主的公司是卖设备的，价值很高。那么这个税收优惠政策可能就用不到。

如果是这样的话，还是注册一般纳税人更好。

综上所述，我只是提出一些建议，具体的决定自己拿。