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沙眼衣原体、解脲脲原体、细小脲原体和淋球菌的检测试剂盒制作方法

  • 专利名称
    沙眼衣原体、解脲脲原体、细小脲原体和淋球菌的检测试剂盒制作方法
  • 发明者
    刘涛, 吴大治, 夏懿
  • 公开日
    2013年7月3日
  • 申请日期
    2011年12月27日
  • 优先权日
    2011年12月27日
  • 申请人
    上海复星医学科技发展有限公司, 上海复星医药(集团)股份有限公司
  • 文档编号
    C12Q1/04GK103184272SQ201110448520
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种沙眼衣原体、解脲脲原体、细小脲原体和淋球菌的检测方法和试剂盒,其特征在于包括固体形式存在的IOx PCR反应物(由引物混合物、tris-cl、KcUMgCl2、热启动聚合酶、UNG酶和冻干保护剂组成)、阳性对照品和含有生物素标记探针的尼龙膜;其特殊之处在于 a特殊的三段式引物,其三段式引物设计及后继的扩增为独创的MAP(多重单链PCR扩增)技术,其序列为 SEQ ID N0.USEQ ID N0.2、SEQ IDN0.3、SEQ ID N0.4、SEQ ID N0.5、SEQ ID N0.6、SEQ ID N0.7、SEQID N0.8、SEQ ID N0.9、SEQ ID N0.10、SEQ ID N0.1USEQID N0.12、SEQ ID N0.13、SEQ ID N0.14、SEQ ID N0.15、SEQ ID N0.16 ; b特殊的探针,所选取的4个探针具有良好的特异性和保守性,即可以区分不同的病原体,又可以检出特定的病原体,分别为SEQ ID N0.17,SEQ IDN0.18,SEQ ID N0.19,SEQID N0.20 ; c特殊的存储条件本试剂盒为PCR反应物提供了固体形式的存储方式; d反应条件通过优化,大致分为两个阶段,其中第一阶段为富集阶段,本阶段使用浓度极低的3个引物和一个过量的正向引物,反应温度一般为50°C左右,扩增阶段低浓度引物将被消耗完,随后第二阶段仅有正向引物工作,随着扩增的进行,将产生大量的单链目的核苷酸序列; e对于每个位点,本试剂盒提供了 2对引物或2对以上引物进行靶序列富集,这样使其特异性和敏感性大大增强; f本试剂盒包括了预处理的标记探针的尼龙膜2.权利要求1所述试剂盒,其引物设计为三段式,由P1,P2和P3构成,其中Pl为模板特异性的或者人工合成非模板特异性寡聚核苷酸,P2为一段特殊碱基,P3为模板特异性序列3.权利要求2所述引物,其P1,P2,P3组合方式是可变的,一般为pl,p2,p3顺序组合,也可以是p2,pi, p3组合,p2也可以镶嵌于pi序列中4.权利要求1中的试剂盒,其冻干保护剂成分由海藻糖,甘油和粘合剂组成5.权利要求1中的试剂盒,标记生物素的探针预先固定在尼龙膜上6.权利要求1中的试剂盒,其PCR产物的检测方法为反向线点杂交、page胶电泳、荧光per检测、斑点杂交,反向斑点杂交、液相杂交平台、毛细管电泳
  • 技术领域
    本发明涉及分子领域,具体是一种淋球菌、沙眼衣原体及解脲脲原体和细小脲原体检测试剂盒
  • 背景技术
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:沙眼衣原体、解脲脲原体、细小脲原体和淋球菌的检测试剂盒的制作方法: 淋球菌、沙眼衣原体、解脲脲原体和细小脲原体是一类由性接触为主要传播途径的病原体,它们可分别引发淋病和非淋球菌性尿道炎。淋病是目前世界上发病较多的性病之一,每年以20% 30%速度递增,由于滥用抗生素及反复感染,导致淋病的临床表现缺乏特异性,尤其女性,感染初期的60% 70%呈现无症状过程,如不及时诊断治疗,既可成为潜在传染源,也有学者认为盆腔炎也是由此菌引物,从而损伤输卵管及卵巢,引起宫外孕和不育症等,故实验室检查对临床确诊及治疗有重大意义沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis, CT)感染为美国最常见的性传播疾病(STD),每年有4 5百万病例发生,每年花费可达40亿美元。据世界卫生组织(WHO)估计,每年有9,200万新的CT感染病例发生。在发展中国家其发生率也呈逐年上升趋势。CT可引起沙眼、泌尿生殖道感染、尿道炎、附睾炎及不孕不育等。支原体感染男女泌尿生殖道的发病率成逐年上升趋势,女性下生殖道是支原体感染好发的部位,上行还可以子宫腔和输卵管腔从而引起炎症和并发症。吴志芬等对无锡市1600例男女生殖道感染者进行支原体检测,其中解脲脲原体的感染率为42.3%,表明支原体的感染率高,已构成流行。近年来解脲支原体的致病机理和流行病学研究得到了充分的重视。最近的研究表明,解脲支原体应该分为两个独立的种,即细小脲原体(Ureaplasmaparvum.原解脲支原体生物一群)和解脲脲原体(Ureaplasma urealyticum),生殖道分离到的解脲支原体以细小脲原体为主。解脲支原体(Ureaplasma urealyticum,简称UU)和沙眼衣原体是常见的性传播疾病病原体,在临床非淋菌性尿道炎(简称NGU)病人中,二者常常呈共同感染状态;在性传播疾病中解脲脲原体与非淋菌性尿道炎、附睾炎有关;与前列腺炎、女性尿道症状、肾盂肾炎、盆腔炎有明显相关性或提示有病原学作用。淋病奈瑟菌的实验室诊断主要依靠细菌培养,该法准确可靠,但往往需要2 3天才能得到结果,且常因标本采集方法和运送方式不正确,而使淋病奈瑟菌死亡造成培养失败,使培养阳性率偏低。涂片法操作简单,但缺乏特异性,而且受采集、涂片、染色、镜检等操作过程中的主观因素影响造成漏检。核酸检测法快速、灵敏度和特异度高,是近年来发展的有效方法,但成本较高。衣原体的实验室诊断主要有细胞培养技术、直接涂片镜检技术、抗原抗体免疫技术、聚合酶链反应、连接酶链反应和糖元试验。直接涂片镜检、免疫胶体金法为临床常用的方法;自动酶联免疫法(VIDAS),仪器昂贵,检测成本较高;PCR通过方法学及试剂的改进,有望成为临床首选使用方法;LCR为目前已知较理想的方法,但其仅器昂贵,难以在基层推广;细胞培养技术为衣原体实验室诊断的黄金标准,但在医院由于费时等原因难以推广。支原体的实验室诊断包括分离培养法、免疫学方法和分子生物学方法。在标本中分离培养出支原体对支原体感染的诊断有决定性的意义。但该法灵敏度低,时间长,不利于早期快速诊断。ELISA法敏感性和特异性高,重复性好,简便、快速,可以测定抗体或抗原,有广阔的应用前景。PCR法存在假阳性和假阴性,但此法快速、简便、特异且敏感,众多的优点使其在临床上可能得到广泛应用。采用多重不对称PCR方法结合反向线点杂交技术可以大大提高杂交的效率,而且操作方便。因此,研制和开发一种可利用导流杂交技术快速、简便、特异、敏感检测淋球菌、沙眼衣原体、解脲脲原体和细小脲原体的产品具有重要的意义
:本发明提供一种淋球菌、沙眼衣原体、解脲脲原体和细小脲原体的检测方法和试剂盒,包括:(I) 一种特殊设计的引物,该引物使用MAP方法(正在申请中)设计,每条引物有PU P2和P3这样3个功能区构成,这种设计方法保证了引物有较宽泛的退火温度范围,使多重PCR扩增条件不兼容的情况大幅改善,提高了成功率,本弓I物在试剂盒内以IOx混合物形式存在。(2)本试剂盒提供了可以特异的鉴别4个病原体的引物序列和探针。(3) 一种特殊的扩增策略,称为多重不对称PCR(MAP),该扩增方法可以产生大量单链核酸序列。(4) 一个预制的低密度尼龙膜基因芯片,其上带有氨基酸臂修饰的特异性探针序列,每种探针可以检测特异的病原体。(5)固体形式存在的PCR反应物,其配方为:UNG酶、热启动聚合酶、Tris-Hcl、KCl、dNTPs (AGCU)、]\%(:12、甘油、01^0、海藻糖、粘合剂。(6)阳性模板参考品和阴性参考品。(7)本发明使用反向线点杂交(RLB)方法进行核酸检测,优化了反向线点杂交的程序,节约了部分时间。试剂盒方法:I)引物设计:引物设计使用发表在NCBI上不同病原体核酸序列的保守区域设计P3段引物,然后设计P2段和Pl段引物,其中用字母n代替hypoxanthine碱基,hypoxanthine碱基可以和四种碱基配对;对于每种病原体的引物序列群,其内引物5’端标记有生物素。 引物序列表:可检测病原体引物名引物序列号引物序列沙眼衣原体MOFlSEQ ID N0.1 GtcaannnnGgattcctgtaacaacaagtcagg本发明提供了一种沙眼衣原体、解脲脲原体、细小脲原体和淋球菌的检测方法和试剂盒,其特征在于使用了MAP方法设计引物,每条引物由3段构成,此设计能使引物的退火温度变得宽泛;对于每个病原体设计了4个引物,扩增反应包括富集阶段和扩增阶段,扩增时仅有内引物标记生物素并且过量;提供了固体形式存在的PCR反应物,预制的生物素标记探针的尼龙膜和阳性对照品。


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