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Tgm5基因突变检测特异性引物和液相芯片制作方法

  • 专利名称
    Tgm5基因突变检测特异性引物和液相芯片制作方法
  • 发明者
    许嘉森, 吴诗扬
  • 公开日
    2013年12月18日
  • 申请日期
    2012年5月31日
  • 优先权日
    2012年5月31日
  • 申请人
    益善生物技术股份有限公司
  • 文档编号
    C12N15/11GK103451273SQ201210179355
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种TGM5基因突变检测液相芯片,其特征在于,包括有 (A).针对TGM5基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为针对T116C位点的SEQ ID N0.7及SEQ ID N0.8,针对A212G位点的SEQID N0.9 及 SEQ ID N0.10,和 / 或针对 A117G 位点的 SEQ ID N0.11 及 SEQ ID N0.12 ;所述tag 序列选自 SEQID N0.1 -SEQ ID N0.6 ; (B).有ant1-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述ant1-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述ant1-tag序列选自SEQ ID NO).13-SEQ ID N0.18,且所述ant1-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对; (C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物2.根据权利要求1所述的TGM5基因突变检测液相芯片,其特征在于,所述扩增引物为针对 T116C 位点的 SEQ ID N0.19 及 SEQ ID N0.20,针对 A212G 位点的 SEQ ID NO).21 及SEQ IDNO).22,和 / 或针对 A117G 位点的 SEQ ID NO).23 及 SEQ ID N0.243.根据权利要求1或2所述的TGM5基因突变检测液相芯片,其特征在于,所述ASPE引物为针对T116C位点的由SEQ ID N0.1和SEQ ID N0.7组成的序列及由SEQ ID N0.2和SEQ ID N0.8组成的序列,针对A212G位点的由SEQ ID NO).3和SEQ ID N0.9组成的序列及由SEQ ID NO).4和SEQ ID N0.10组成的序列,和/或针对Al 17G位点的由SEQ ID N0.5和SEQ ID NO).11组成的序列及由SEQ ID N0.6和SEQ ID N0.12组成的序列4.根据权利要求1所述的TGM5基因突变检测液相芯片,其特征在于,所述间隔臂为5-10 个 T5.用于TGM5基因突变检测的特异性引物,其特征在于,所述特异性引物序列为针对 T116C 位点的 SEQ ID N0.7 及 SEQ ID N0.8,针对 A212G 位点的 SEQ ID N0.9 及 SEQ IDN0.10,和 / 或针对 A117G 位点的 SEQ ID NO).11 及 SEQ ID NO).12 ?
  • 技术领域
    [0001]本发明属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种TGM5基因突变检测特异性引物和液相芯片
  • 专利摘要
    本发明公开了一种TGM5基因突变检测液相芯片和特异性引物,该液相芯片主要包括有每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物所述特异性引物序列为针对T116C位点的SEQ?ID?NO.7及SEQ?ID?NO.8,针对A212G位点的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10,和/或针对A117G位点的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12;有anti-tag序列包被的微球;扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100%,实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。
  • 专利说明
    TGM5基因突变检测特异性引物和液相芯片
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
Tgm5基因突变检测特异性引物和液相芯片的制作方法[0002]TGM5称谷氨酸胺转移酶(Transglutaminase 5)。位于15号染色体15ql5.2的长臂上,更准确的说,TGM5基因的碱基在15号染色体上位于43524792到43559054碱基对之间,包含13个外显子和12个内含子。TGM5基因是转谷氨酰胺酶家族的成员,可以促进谷氨酰胺和赖氨酸残基之间形成蛋白的交叉连接,从而使蛋白质组装的稳定化,这种反应对钙存在依赖性,在这个基因的突变与肢端脱皮综合征有关。[0003]目前,TGM5基因突变检测方法主要有=Illumina光纤微珠芯片技术,虽然Illumina光纤微珠芯片技术是高灵敏度和精确性的高通量检测系统,但是自动化程度低,手工操作比较多,难以满足实际应用的需要。[0004]本发明目标检测的TGM5基因突变位点,如表所示:[0005]
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