用于诊断和预测疾病的含三甲胺的化合物制作方法
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专利名称:用于诊断和预测疾病的含三甲胺的化合物的制作方法图10显示了在能用于本发明的与某些胆碱有关的含三甲胺化合物的化学式。发明详述本发明提供了用于确定受试者(特别是人类受试者)是否患有疾病诸如心血管病、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD (非酒精性脂肪肝病)或NASH(非酒精性脂肪肝炎)等或具有(在例如接下来的1年、2年和或/3年,或更长的时间内)患上此类疾病风险的标记物及方法。本申请还涉及该标记物的用途,及用于监测上述疾病或病症在受试者中的状态、或者治疗剂或介入治疗对患有这种疾病的受试者的效果。在一个实施方案中,本发明提供了用于表征受试者(特别是人类受试者)患有心血管病(尤其是动脉粥样硬化心血管病)的风险的方法和标记物。所述心血管病的实例包括心力衰竭、主动脉夹层和主动脉瘤。在另一个实施方案中,本发明提供了用于表征受试者患上心血管病风险的方法。在另一个实施方案中,本发明提供了用于表征受试者在接下来的1年、2年或3年内遭受心血管(CVD)事件风险的方法。本发明的方法能有效地对那些需要进行高度冲击CVD疗法或介入治疗的受试者和不需要进行以抑制或防止CVD或CVD并发症为目的的治疗或介入治疗的受试者进行鉴定。本文使用的术语“心血管病”(CVD)或“心血管病症”是用于划分侵袭心脏、心脏瓣膜和体内血管(如静脉和动脉),包括但不限于以下疾病和病况动脉硬化、动脉粥样硬化、 心肌梗死、急性冠状动脉综合症(acute coronary syndrome)、心绞痛、充血性心力衰竭、主动脉瘤、主动脉夹层、髂动脉瘤或股动脉瘤、肺栓塞、原发性高血压、心房颤动、中风、短暂性脑缺血发作、收缩功能不全、舒张功能不全、心肌炎、房性心动过速、心室颤动、心内膜炎、动脉病、血管炎、动脉粥样硬化斑块、易损斑块、急性冠状动脉综合症、急性脑缺血发作、心脏性猝死、外周血管疾病、冠心病(CAD)、外周动脉疾病(PAD)和脑血管疾病。本文使用的术语“动脉粥样硬化心血管病”或“病症”指的是这样一类心血管病子集它们以动脉粥样硬化作为特定类型心血管病的组成或前体,并且包括且不限于CAD、 PAD、脑血管疾病。动脉粥样硬化是一种在动脉血管壁处发生的慢性的炎症性应答。它包括粥样斑块的形成,这会导致动脉变窄(“狭窄症”)并最终引起动脉开口的局部或完全闭合和/或斑块破裂。因此,动脉粥样硬化疾病或病症包括粥样斑块形成和破裂的结果,该结果包括但不限于动脉狭窄症或变窄、心力衰竭、包括主动脉瘤的动脉瘤形成、主动脉夹层和缺血性事件例如心肌梗死和中风。本文使用的心血管事件指的是心血管病给受试者造成不良病况的表现形式,例如心脏性猝死或急性冠状动脉综合症,包括但不限于心肌梗死、稳定心绞痛、动脉瘤或中风。 本文中的术语“心血管事件”可以与术语心血管并发症互换使用。而心血管事件可以是急性病况,还可以表示先前检测的病况恶化至呈现出严重威胁受试者健康的点,例如早前发现的动脉瘤扩大或高血压升高至威胁生命的水平。本文使用的术语“诊断”可以包括确定疾病在受试者中的类型,以及确定对疾病的严重性和可能结果,或者确定疾病的发作和/或恢复前景(预后)。“诊断”还能包括在合理疗法背景下的诊断,其中,所述诊断能指导治疗(包括治疗的起始选择、治疗的更改(如剂量和/或施用方案或生活方式改正建议方面的调整))等的进行。术语“个体”、“宿主”、“受试者,,和“患者,,在本文能互换使用,它们通常指代哺乳动物,包括但不限于灵长类(包括猿猴和人类)、马科动物(包括马)、犬科动物(如狗)、猫科动物、家养牲畜(如有蹄动物,像猪类(swine)、小猪(pig)、山羊、绵羊等),以及家养宠物和动物园饲养的动物。在一些实施方案中,该受试者特别指人类受试者。在进一步描述本发明前,应该理解本发明不限于所描述的具体实施方案,而应当可以有所不同。还应该理解的是,本文使用术语的目的仅为对具体实施方案进行描述,而不是进行限制,因此本发明的范围仅由随附权利要求书确定。当列举出数值范围时,应该理解在该范围上限和下限之间的每个中间数值(除非上下文另外明确说明,精确到下限单位的十分之一)和在该所述范围内的任何其它所述数值或中间数值都包括在本发明内。这些较小范围的上限和下限可以独立地包含在所述较小范围内,并且也包含在本发明内,这取决于所述范围内被明确排除的限制。当所述范围包括一个或两个限值时,排除了那些所包括的限值中的一个或两个之外的范围也包含在本发明中。除非另有定义,否则本文使用的所有技术性和科学性术语具有本发明所属领域的普通技术人员通常所理解的意义。虽然所有与本文所描述相似或相等的方法和材料都可以用于实践或测试本发明,但现在仅对优选的方法和材料进行描述。通过引用将本文提到的所有出版物并入本文,从而对与所引用出版物中有关的方法和/或材料进行披露和描述。必须指出的是,除非上下文明确另有说明,否则本文和随附权利要求书中使用的单数形式的“一个(a)”、“和”、以及“该(the)”包括复数形式的指代物。故举例来说,提到 “一个样品”时包括多个这种样品,但提到特定酶(如精氨酸酶)时包括提到一种或多种精氨酸酶多肽及本领域技术人员已知的等价物,等等。除非另有说明,否则应当将在说明书和权利要求书中使用的表示成分数量、特性(如分子量)、反应条件等的所有数字被理解成在所有情况下都由术语“约”修饰。因此,除非另有说明,否则在下文说明书和权利要求书中提到的数字特征是约数,并且随着本发明实施方案中寻求的期望特性而有不同。尽管限定了本发明较宽范围的数值范围和参数是约数,但对具体实施例中列举的数值则报道得尽可能的精确。但是,任何数值不可避免地因其各自度量存在中的误差而具有一定误差。在一个实施方案中,本发明的方法包括确定生物学样品(例如,来自受试者的体液)中的与胆碱有关的含三甲胺化合物的水平。与胆碱有关的含三甲胺化合物包括甜菜碱、三甲胺N-氧化物(ΤΜΑΝ0)、胆碱、乙酰胆碱、卡巴胆碱乙酰肉碱(cartachol acetylcarnitine)、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、 甘油磷酸胆碱和磷脂酰胆碱。在另外的实施方案中,本发明的方法包括确定ΤΜΑΝ0、胆碱和甜菜碱这三种化合物中的一种或多种的水平。在另外的实施方案中,本发明的方法包括确定生物学样品中的TMANO水平。在另外的实施方案中,本发明的方法包括确定来自受试者的生物学样品中的胆碱、甜菜碱或上述二者的水平。在一些实施方案中,将来自受试者的生物学样品中的三甲胺N-氧化物(TMANO)、 胆碱、甜菜碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、 甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱或它们的任意组合的水平与相应的对照值相比,或者将其与对获自参考队列的可比生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、甜菜碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、 肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱或它们的任意组合进行测量而得到的数值相比。本文使用的相应数值指的是使用给定化合物的适当对照,例如确定TMANO的参考人群水平用作对照值来比较从受试者中测得的TMANO水平。可选择地, 可以将从来自受试者的生物学样品中获得的ΤΜΑΝ0、胆碱、甜菜碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱(也被称为卵磷脂)或它们的任意组合的水平与来自受试者生物学样品的内标水平相比。如本领域技术人员公知的是,内标可以是与目标分析物相似的多种化合物,例如由重同位素标记的标准。 内标是这样的化合物能将已知量的内标加入样品中,进而协助确定分析物在样品中的量。 例如,能用于确定胆碱的量的内标包括重同位素标记的胆碱,或结构上相关的化合物,例如乙酰基-β-甲基胆碱和丁酰胆碱。在一些实施方案中,所述生物学样品为尿液或血液,或源自血液的液体,例如血清或血浆。在一个实施方案中,通过利用诊断CVD的标准方案进行测定的比较结果表征了受试者患有CVD的风险。实施了进一步的实施方案来表征目前患有动脉粥样硬化CVD的风险。 此外,受试者的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱(顺式和反式)、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-Ν6-三甲基-赖氨酸、Ν6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平与对照值之间的差别程度也能有效地对风险程度进行表征,从而确定哪些受试者能从特定的治疗或介入治疗中最大地获益。更具体来说,在差别和风险程度之间存在有正相关由此较大的水平差对应着较大的风险。在另一个实施方案中,比较结果表征受试者将来患上CVD、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH的风险。如本文实施例2中阐述的,与胆碱有关的含三甲胺化合物具有鉴定受试者将患上CVD可能性的预后作用。不受理论限制的情况下,在胆碱新陈代谢、参与胆碱新陈代谢的肠内菌群和患上CVD、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或 NASH、和/或遭受重大心血管事件、和/或遭受心血管病、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、 NAFLD或NASH的重大并发症之间存在联系。糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症的重大并发症包括动脉粥样硬化性心脏病、微血管病变、视网膜病、肾病、神经病变和血脂异常。NAFLD和 /或NASH的重大并发症包括肝癌、肝硬化、肝功能衰竭、肝性脑病。举例来说,受试者内的与胆碱有关的含三甲胺化合物的量与对照值的比较结果可以用于表征受试者在接下来的3年内遭受心血管事件的风险,或者在一些实施方案中为2 年,或在一些实施方案中为1年(或者它们的任意期间内)。还可以用本发明的方法来确定出现胸痛症状的受试者是否在近期内有遭受心血管事件(如心肌梗死、再梗死、血管再生需要和/或死亡)的风险。本文中的术语“近期”表示的是当受试者出现胸痛症状之后的 1天、三个月、6个月或1年的时间内。本文还提供了对受试者中的CVD、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH 随时间的状态进行监测的方法。实施了进一步的实施方案来对动脉粥样硬化CVD随时间的状态进行检测。在一个实施方案中,该方法包括确定在起始时间得自受试者的生物学样品和随后时间内获自受试者的相应的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的水平。与起始时间的相比,在随后时间内获得的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和 /或甜菜碱水平升高就意味着受试者患有CVD、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或 NASH的风险增加。受试者中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的水平降低就意味着受试者患有CVD、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH的风险减小。对于那些已经遭受过心血管事件(如心肌梗死或缺血性中风)的受试者,该方法有效地评估该受试者遭受随后的心血管事件的风险。这些受试者中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、 肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱水平的升高意味着该受试者遭受随后不良心血管事件的风险增加。受试者中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、 N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的水平降低就表示该受试者遭受随后不良心血管事件的风险减小。本发明的方法还可涉及对受试者有关心血管病或心血管事件方面进行检查、监测或诊断。例如,本发明的方法可涉及鉴定具有患上心力衰竭或主动脉病症(如主动脉瘤或主动脉夹层)风险的患者。心力衰竭是心血管病的一种类型,它是这样的一种病况其中由于心脏结构或功能上存在问题而损害了心脏供应足够血流以满足身体需要的能力,以受损的心室收缩或舒张功能或二者兼有为特征。心力衰竭表现的症状可能仅为单独较差的组织灌流(如疲劳、 运动耐量差和/或混乱),或者同时表现出较差的组织灌流和血管床阻断(如呼吸困难、肾功能下降、心肾综合症、胸腔积液、肺水肿、颈静脉扩张、肝脏充血和/或外周性水肿)的症状。充血性心力衰竭代表了心力衰竭的一种类型,与高输出心力衰竭相比,其心输出量较低,身体对氧气和营养物的需求增加,且这一需求超出了心脏供给能力。心力衰竭可能是一种或多种诱因造成的。主要诱因为动脉粥样硬化继发病,其中一种或多种缺血性事件(如心脏病发作)导致心脏发生缺血性损伤和功能降低。由于造成心功能不全的原因继发于缺血性损伤,因此这一类型的心力衰竭指的是缺血性心力衰竭。 缺血性心力衰竭(有时被称为缺血性心脏病)也能因会造成缺血性损伤的其它心血管病况 (例如限制了血流的动脉粥样硬化)引起。心力衰竭还可以由缺血之外的诱因引发,故将这种类型的心力衰竭称为非缺血性心力衰竭。非缺血性心力衰竭的实例包括因病毒感染引起的心肌炎、心肌组织淀粉样变、心律不齐、遗传缺陷外显、因酗酒、滥用药物或酗烟造成的损伤、其它对心肌组织造成损伤的原因,如细菌或寄生虫感染或缺乏维生素。主动脉夹层是在主动脉壁上发生的撕裂,它使得血液在主动脉壁层之间流动并迫使层发生分离。在主动脉夹层中,血液穿透内膜(主动脉血管最里面的层)进入了中膜。高压力将血管中层组织从层平面上剥离出来,并造成血管中层内部的2/3和外部1/3 发生分离。该现象能在主动脉长度方向上前后延伸较长距离。将延伸朝髂分支(顺着血流)发生的夹层称为顺行性夹层(anterograde dissection),并将那些延伸朝主动脉根部 (逆着血流)发生的夹层称为逆行性夹层(retrograde dissection)。通常在主动脉瓣上发生IOOmm内的起始撕裂,故逆行性夹层能轻易地对心包膜造成损害,从而导致半心畸形 (hemocardium)。主动脉夹层是即使在采用最佳治疗方案后依然可以快速导致死亡的医疗紧急事故。主动脉夹层的症状是本领域技术人员公知的,包括突然发作的重度疼痛,感觉像从内部发生撕裂,或具有如刀割般或尖锐刺痛感觉。某些个体描述疼痛随着该夹层沿主动脉向下延伸而迁移。虽然这种疼痛可能与心肌梗死的疼痛发生混淆,但主动脉夹层通常不会伴随有其它心肌梗死的症状,包括心力衰竭、和ECG(脑皮层电图)改变。遭受主动脉夹层的个体通常不会出现发汗症状(大汗)。患有慢性夹层的个体可能不会出现疼痛症状。 通常会发现主动脉瓣关闭不全的现象。能主动脉夹层中观察到的其它不太常见的症状包括充血性心力衰竭(7% )、昏厥(9% )、脑血管意外(3-6% )、缺血性外周神经病变、截瘫、心脏停搏和猝死。优选地,在诊断显像测试中对内膜瓣进行可视化诊断,例如用碘造影物质对胸腔进行的CT扫描和经食管超声心动图。另一方面,主动脉瘤是一种以主动脉发生肿胀为特征的心血管病症,它通常因局部主动脉壁内潜藏的薄弱问题而导致。通过主动脉瘤在主动脉上发生的位置对其进行分类。腹部主动脉瘤(下文称为AAA)是最常见的主动脉瘤类型,一般在发生破裂前无临床症状。虽然其它因素也影响了 AAA的形成,但它主要是由于动脉粥样硬化引起的。AAA可以无限期地保持无临床症状。因此,尽管一些AAA在破裂前的直径可以肿胀到15cm以上,但当尺寸达到5cm时就有非常大的发生破裂的风险。因为术前术后死亡率较高,仅有10-25%的患者在破裂后存活。主动脉瘤的症状可以包括焦虑或压力感、恶心和呕吐、皮肤湿冷;快速心室率。 但完整的主动脉瘤却不会产生症状。随着肿瘤的长大,可能产生例如腹痛和背痛的症状。对神经根部的压缩可能导致腿部的疼痛或麻木。未经治疗的动脉瘤会变得越来越大,而对特定个体的扩张率是不可预测的。在一些情况下,排列在大部分主动脉瘤上的血块可能破裂并导致栓塞。优选使用医学成像法来确诊主动脉瘤。本发明还提供了表征受试者对旨在稳定或削弱CVD(如动脉粥样硬化CVD)、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH的治疗进行应答的方法。该方法包括确定在治疗前得自受试者的生物学样品中与胆碱有关的含三甲胺化合物(如ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/ 或甜菜碱)的水平,和确定在治疗时或治疗后得自受试者的对应的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、 胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的水平。在治疗时或治疗后从样品中获得的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平比在治疗前从样品中获得的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平低时,指示对接受治疗的受试者进行的针对心血管病、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH的治疗具有积极效果。在另一个实施方案中,本发明涉及含有用于对获自测试受试者的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、 甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱的水平进行评估的试剂的试剂盒。在某些实施方案,所述试剂盒还包括印刷好的材料,例如操作本发明方法的说明,或能有效地用于评估测试受试者的CVD、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH风险的信息。上述信息的实例包括但不限于临界值、在具体临界值下的灵敏性,以及其它关于在分析结果基础上对风险进行表征的印刷好的材料。在一些实施方案中,所述试剂盒可以包括对照剂,例如已知量的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、 甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱。在一些实施方案中,将测试受试者的生物学样品中的与胆碱有关的含三甲胺的化合物(如ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、 3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、 甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱)的水平与对照值相比,所述对照值来源于对照受试者的可比生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、 4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱水平。在替代实施方案中,然后可以将测试受试者的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱的水平与基于该受试者的生物学样品中的其它生物分子水平的内标相比。ΤΜΑΝ0、胆碱、 巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱水平高于对照值或在对照值的较高范围内的测试受试者比那些 ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、和/或甜菜碱水平处于对照值内或低于对照值或者在对照值较低范围内的测试受试者具有更高的风险患有或患上心血管病(如充血性心力衰竭、主动脉瘤等)、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH。此外,受试者的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱水平与对照值之间的差别程度也能有效地表征风险程度,从而确定哪些受试者能从特定的治疗中最大地获益。在某些实施方案中,通过结合第一风险值与一个或多个附加风险值(additional risk value)得到最终风险值而测定出受试者的CVD、糖尿病、糖尿病前期、糖耐量降低、空腹糖调解受损、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH风险特征,所述第一风险值是通过比较受试者生物学样品中的与胆碱有关的含三甲胺化合物(如ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、 Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/ 或甜菜碱)水平与对照人群的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平而得到的。得到附加风险值的步骤包括但不限于确定受试者的血压、评估受试者对压力测试的应答、确定受试者个体样品中的髓过氧化物酶、高瓜氨酸、硝基酪氨酸、C-反应蛋白、纤维蛋白原和PAI-1、 高半胱氨酸、非对称性二甲基精氨酸、脑钠肽、低密度脂蛋白或胆固醇水平,或者对受试者的动脉粥样硬化斑块负荷进行评估。在一个实施方案中,使用本发明的方法来评估受试者患有心血管病,特别是动脉粥样硬化心血管病的风险。冠心病是心血管病的一种类型。确定人类受试者是否患有冠心病或具有遭受冠心病并发症的医疗过程包括但不限于冠状动脉血管造影术、冠状血管内超声(IVUQ、压力测试(成像或不成像)、颈动脉内膜中层增厚的评估、进行或不进行虚拟组织学技术的颈动脉超声研究、冠状动脉电子束计算机断层扫描(EBTC)、心脏计算机断层扫描(CT)、CT血管造影法、心脏核磁共振成像(MRI)和磁共振血流成像(MRA)。因为心血管病通常不局限在受试者脉管系统的一个区域内,所以被诊断成患有冠心病或具有患上冠心病风险的受试者还被认为具有患上或患有其它类型的CVD,例如脑血管疾病、主动脉-髂动脉疾病和外周动脉疾病。具有患心血管病风险的受试者可能会发生异常压力测试或异常心导管检查术的风险。具有患CVD风险的受试者还具有展现出增加的颈动脉内膜中层厚度增加以及冠状动脉钙化的风险,可以通过非侵入式成像技术对这些特征进行评估。具有患 CVD风险的受试者可能发生动脉粥样硬化(atheroscleorotic)斑块负荷升高,可以通过血管内超声检查到该特征。在另一个实施方案中,本发明的方法用于评估受试者将来患上心血管病、糖尿病、 抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH的风险。在一个实施方案中,受试者为外表健康的个体。在另一个实施方案中,受试者患有心血管病、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD 或NASH的风险在增加。还可以将本发明方法的实施方案用于评估测试受试者在接下来的3年、2年或1年内遭受心血管事件的风险。在另一个实施方案中,用本发明的方法来确定出现胸痛症状的受试者是否具有遭受心脏病发作或其它心血管事件(如近期内的心肌梗死、再梗死、血管再生需要或死亡)的风险。上文中使用的术语“近期”指的是1年之内。因此,具有近期风险的受试者可能具有在出现胸痛症状后的接下来的1天、3个月或6年内遭受心血管事件的风险。本发明还提供了用于监测已被诊断为患有CVD的受试者中CVD随时间的状态的方法。在上下文中,该方法还能有效地监测动脉粥样硬化在患CVD受试者中的进化或退化风险。在一个实施方案中,该方法包括确定在起始时间得自受试者的生物学样品和在随后时间得自受试者的相应的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、 4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平。与起始时间的相比,在随后时间获得的生物学样品中的与胆碱有关的含三甲胺的化合物(如ΤΜΑΝ0、 胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱)水平升高就意味着受试者的CVD已进化或者退化。ΤΜΑΝ0、 胆碱.巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱、和/或甜菜碱水平下降则说明CVD得到了改善或发生了退化。对那些已经遭受心血管事件(如心肌梗死或缺血性中风)的受试者来说,该方法还能用于评估受试者发生随后的心血管事件的风险。受试者中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平随着时间发生增加就说明该受试者遭受随后的不良心血管事件的风险升高。受试者内的ΤΜΑΝ0、 胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱发生降低就说明该受试者遭受随后的不良心血管事件的风险减小。在另一个实施方案中,本发明提供了在对疑似患有或被诊断出患有心血管病的受试者中评价治疗的方法。该方法包括确定在治疗前来自受试者的生物样品中一种或多种与胆碱有关的含三甲胺化合物(如ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、和/或甜菜碱)的水平,和确定在治疗中或治疗后来自受试者的对应的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、 胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的水平。在治疗时或治疗后获得样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、 N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平比治疗前获得的样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、 肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平低时,指示对接受治疗的受试者进行的针对心血管病的治疗具有积极效果。生物学样品生物学样品包括但不必须限于诸如与血液有关的样品的体液(如全血、血清、血浆和其它血源性样品)、尿液、脑脊髓液(cerebral spinal fluid)、支气管肺泡灌洗液等。 其它生物学样品的实例为组织样品。可以对ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平进行定量或定性评估,通常进行定量评估。可以在活体内或者在活体外对与胆碱有关的含三甲胺化合物的水平进行测定。生物学样品可以是新鲜的或储存的(如,储存在血库中的血液或血液级分)。生物学样品可以是为了进行本发明的分析而特意收集的体液,或者是因其它目的而获取的体液,它可以作为本发明分析的子样品。在一个实施方案中,生物学样品为全血。可以采用标准临床操作从受试者中获得全血。在另一个实施方案中,生物学样品为血浆。可以通过对抗凝血进行离心分离来从全血样品中获得血浆。该操作能产生由白细胞组分组成的血沉棕黄层和血浆上清液。在另一个实施方案中,生物学样品为血清。可以通过对不含有抗凝血剂的收集在试管中的全血样品进行离心分离来获得血清。允许在进行离心分离前使血液结块。离心分离后得到的黄红色流体就是血清。在另一个实施方案中,样品为尿液。必要时,可以对所述样品进行预处理通过在合适的缓冲溶液中进行稀释、肝素化、浓缩(如有必要)或以多种方法进行分级,包括但不限于超速离心、用快速液相色谱 (FPLC)进行分级、或用含蛋白的载脂蛋白B与硫酸葡聚糖进行沉淀,或其它的方法。可以使用任意数量的具有生理PH的标准缓冲水溶液,如磷酸盐、Tris (三羟甲基氨基甲烷)等。受试者受试者是待测以对其CVD (如充血性心力衰竭、主动脉瘤或主动脉夹层)、糖尿病、 抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH风险进行表征的任何人类或其它动物。在某些实施方案中,所述受试者发生不良心血管事件的风险没有升高。遭受心血管事件的风险升高的受试者包括那些具有心血管病家族病史、血脂升高、吸烟者、早期急性心血管事件等群体 (参见例如 Harrison’ s Principles of Experimental Medicine,第 15 版,McGraw-Hill 有限公司,纽约——下文以“Harrison’ s”表示)。 在某些实施方案中,受试者外表上看起来是健康的。本文使用的“外表健康”表示这样的受试者他们没有任何CVD、糖尿病、抗胰岛素性、代谢综合症、NAFLD或NASH的迹象或症状,事先也未被诊断出具有表示存在动脉粥样硬化的迹象或症状,例如心绞痛、心血管事件史,如心肌梗死或中风、或通过诊断成像法获得动脉粥样硬化的证据,包括但不限于冠状动脉血管造影术。外表健康的受试者也不具有任何患上心力衰竭或主动脉病症的迹象或症状。在其它实施方案中,受试者已经表现出心血管病的症状。例如,该受试者可以表现出心力衰竭或主动脉病症的症状,例如主动脉夹层或主动脉瘤。对于已经遭受心血管病的受试者来说,可以使用与胆碱有关的含三甲胺化合物的水平来预测发生更多的心血管事件的可能性或者所患心血管病的结果。在某些实施方案中,受试者为不吸烟的人。“不吸烟的人”指的是这样的个体他们在评估过程中不是吸烟者。这包括从未吸烟的个体和吸烟但在过去一年内未抽吸过烟草产品的个体。在一些实施方案中,受试者为吸烟者。在某些实施方案中,受试者为非高血脂性受试者。“非高血脂性”指的是这样的受试者其是非高胆固醇血症(nonhypercholesterolemic)和/或非高甘油三酯血症 (nonhypertriglyceridemic)受试者。“非高胆固醇血症”受试者是不符合目前针对高胆固醇血症受试者所建立的标准的群体。“非高甘油三酯血症”受试者是指不符合目前针对高甘油三酯血症受试者所建立的标准的群体(参见例如Harrison’ s Principles ofExperimental Medicine,第 15 版,McGraw-Hill 有限公司,纽约-下文以“Harrison,s,,表示)。高胆固醇血症受试者和高甘油三酯血症受试者都与早发冠心病的发病率的提高有关。高胆固醇血症受试者的LDL水平为> 160mg/dL的,或者LDL水平为> 130mg/dL 且具有至少两个选自由男性、早发冠心病家族病史、吸烟(每天超过10支)、高血压、低 HDL( < 35mg/dL)、糖尿病、高胰岛素血症、腹部肥胖、高脂蛋白(a),以及脑血管疾病或闭合性外周血管疾病的个人病史所组成的组中的风险因子。非高甘油三酯血症受试者的甘油三酯(TG)水平为> 250mg/dL。因此,将非高血脂性受试者定义为胆固醇和甘油三酯水平都低于上述高胆固醇血症和高甘油三酸酯血症受试者的下限。用于测量与胆碱有关的含三甲胺化合物水平的方法可以使用各种合适的分析方法(包括本领域公知的方法)来对与胆碱有关的含三甲胺化合的水平进行测量。例如,可以用分析设备对受试者中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱(反式和顺式)、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和甜菜碱的水平进行测量,所述分析设备是这样一种仪器它具有能够鉴定小有机分子的检测器,例如与胆碱有关的含三甲胺化合物。所述分析设备可以是光谱设备, 例如质谱仪、紫外线光谱仪或核磁共振波谱仪。光谱仪是利用光谱技术来对介质例如生物学样品(如体液)中的给定品种的浓度或数量进行评估的设备。用于测量与胆碱有关的含三甲胺化合物的水平的分析设备可以是便携式装置或固定式装置。在用于检测与胆碱有关的含三甲胺化合物的装置之外,所述分析设备还可以包括附加装置,从而能在进行分析前对分析物进行物理分离。例如,如果所述分析物检测器为质谱仪,则该分析设备还可以包括高效液相色谱(HPLC)或气谱,从而能在用质谱监测与胆碱有关的含三甲胺化合物之间对其进行提纯。如本文中所指出的,可以使用建立在质谱基础上的方法来评估生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、 甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的水平。质谱仪包括电离源(如电喷雾),和根据其质荷比(m/z)用于分离在电离源处形成的离子的分析仪,和用于带电离子的检测器。在串联式质谱中包括了两个或更多个分析仪。该方法是本领域中的标准方法,并且包括与例如电喷雾电离(ESI)和串联式质谱联机的HPLC。也可以用其他的光谱分析法来检测与胆碱有关的含三甲胺化合物。例如,可以使用多种检测器通过HPLC来测量与胆碱有关的含三甲胺化合物,包括但不限于UV或Vis (衍生形式)、质谱或GC/MS。可以用于鉴定与胆碱有关的含三甲胺化合物的方法为核磁共振法 (WR)。匪R的实例包括质子匪R和C-13NMR。测出与胆碱有关的含三甲胺化合物的水平之后,可以将其以多种方式展现出来。 例如,与胆碱有关的含三甲胺化合物的水平可以在显示器上以数值或比例条(如条状图) 通过图表表现,或者通过本领域技术人员知道的其他任何显示方法表现。图示法能直观地表示所评价的生物学样品中的与胆碱有关的含三甲胺化合物(如ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱或甜菜碱)的量。此外,在一些实施方案中,还可以将分析设备构造成能显示受试者体液中的 TMANO水平与来自参照队列的可比体液中的TMANO水平的基础上的对照值的比较结果。对照值在一些实施方案中,可以将来自测试受试者的生物学样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、 N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平与对照值相比。对照值是分析物的浓度,它反映了分析物的已知量或代表量。例如,可以在获得自参照队列的可比样品中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y-丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱水平的基础上获得对照值。在某些实施方案中,参照队列是一般性群体。在某些实施方案中,参照队列为从人类受试者中挑选出来的群体。在某些实施方案中,参照队列包括这样的个体他们事先没有任何能证实存在动脉粥样硬化的迹象或症状,例如心绞痛、心血管事件(如心肌梗死或中风)病史、通过诊断成像法(包括但不限于冠状动脉血管造影术)发现的动脉粥样硬化的证据。在某些实施方案中,参照群组包括这样的个体他们在医务人员的检查中表现出无疾病(如心血管病)症状。在另一个实施方案中,参照队列可以是这样的个体他们是不吸烟的人(即,不抽吸纸烟或类似物品(例如雪茄)的个体)。不吸烟队列的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、 甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的正常范围可以与吸烟群体和一般群体具有的正常范围不同。因此,选择对照值时需要考虑测试受试者所述的类型。本领域技术人员可以根据常规实验来选择合适的类型。优选藉由用于表征获自测试受试者的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、 肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的水平的相同单位来测量对照值。因此,如果TMANO水平是绝对值时(例如,每毫升血液中的ΤΜΑΝ0、 胆碱和/或甜菜碱的量),对照值也是建立在一般群体或选定群体的人类受试者的个体的每毫升血液中的ΤΜΑΝ0、胆碱、巴豆甜菜碱、Y - 丁基甜菜碱、肉碱、4-三甲基丁醛铵、脱氢肉碱、3-羟基-N6-三甲基-赖氨酸、N6-三甲基-赖氨酸、三甲基丙酮铵、脱羧肉碱、磷酸胆碱、甜菜醛、甘油磷酸胆碱、磷脂酰胆碱和/或甜菜碱的单位的基础上。对照值可以具有多种形式。该对照值可以是单个临界值,如中位数(median)或平均值(mean)。可以基于对比组来确立对照值,例如在一个确定组内的风险是另一个
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