早鸽—汇聚行业精英
  • 联系客服
  • 帮助中心
  • 投诉举报
  • 关注微信
400-006-1351
您的问题早鸽都有答案
3000+专业顾问
搜索
咨询

用于特异地检测抗性生物的培养基制作方法

  • 专利名称
    用于特异地检测抗性生物的培养基制作方法
  • 发明者
    C·罗歇-达尔贝特, G·扎姆巴尔迪, J·佩里, N·巴尔, S·奥伦加, V·尚特佩德里
  • 公开日
    2012年7月25日
  • 申请日期
    2006年2月9日
  • 优先权日
    2005年2月10日
  • 申请人
    拜奥默里克斯公司
  • 文档编号
    C12Q1/34GK102605040SQ201210074560
  • 关键字
  • 权利要求
    1.培养基用于区分生物样品中的至少3组微生物的用途,所述生物样品包含 第一组革兰氏阳性细菌,属于第一个微生物分类群并包含针对治疗的至少一种抗性机制; 第二组革兰氏阳性细菌,属于不同于所述第一个分类群的第二个微生物分类群,但包含针对治疗的至少一种抗性机制,所述抗性机制与第一组的相同; 第三组革兰氏阳性细菌,其对所述治疗没有抗性,所述培养基包含a.至少第一种底物,其使得能够检测所述第一组微生物的至少第一种酶或代谢活性;b.至少一种标记,其使得能够区别所述第一组微生物和所述第二组微生物,所述标记是使得能够检测所述第二组微生物的至少一种酶或代谢活性的底物;c.至少一种抗微生物剂,其对所述第三组微生物具有活性2.根据权利要求I的培养基的用途,其中所述第一组和第二组的革兰氏阳性细菌为肠球菌3.培养基,其包含籲第一种底物,其使得能够检测α -葡糖苷酶的酶活性,籲第二种底物,其使得能够检测葡糖苷酶或半乳糖苷酶的酶活性, 至少一种抗生素,其优选地为万古霉素4.培养基,其包含籲第一种底物,其使得能够检测β -葡糖苷酶的酶活性,籲第二种底物,其使得能够在有色指示剂存在下检测甲基-葡糖苷的代谢, 抗生素,其是万古霉素5.根据权利要求4的培养基的用途,所述用途为用于区分 第一组肠球菌,其展现出针对万古霉素的获得性抗性; 第二组肠球菌,其展现出针对万古霉素的天然抗性; 第三组肠球菌,其对万古霉素没有抗性6.培养基,其包含 至少第一种底物,其使得能够检测α -葡糖苷的代谢; 至少第二种底物,其使得能够检测与α-葡糖苷的代谢不同的第二种活性; 至少一种抗生素,其是万古霉素7.根据权利要求6的培养基,其特征在于,所述至少第二种底物使得能够检测β-葡糖苷酶或半乳糖苷酶活性8.根据权利要求6的培养基,其特征在于,所述第一种底物优选是甲基-α-葡糖苷,所述第二种底物优选是5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷或6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,并且所述抗微生物剂优选是万古霉素9.根据权利要求6-8的培养基的用途,所述用途为用于区分 第一组微生物,包括粪肠球菌和屎肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第二组微生物,包括铅黄肠球菌和鹑鸡肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第三组微生物,其对万古霉素没有抗性10.根据权利要求6的培养基,其特征在于,所述第一种底物是5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-甲基- a -D-葡糖苷或5-溴-4-氯-3-吲哚基- a -D-葡糖苷,所述第二种底物是 6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷或茜素-β -D-半乳糖苷或5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷或5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷或6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷,并且所述抗微生物剂是万古霉素11.根据权利要求6或10的培养基的用途,所述用途为用于区分 第一组微生物,包括屎肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第二组微生物,包括粪肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第三组微生物,其对万古霉素没有抗性或表现出天然抗性12.根据权利要求6的培养基,其特征在于,所述第一种底物是5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-甲基- a -D-葡糖苷或5-溴-4-氯-3-吲哚基- a -D-葡糖苷,所述第二种底物是 6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷或5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,并且所述抗微生物剂是万古霉素13.根据权利要求6或12的培养基的用途,所述用途为用于区分 第一组微生物,包括粪肠球菌和屎肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第二组微生物,包括金黄色葡萄球菌,其处于中间状态或对万古霉素具有抗性; 第三组微生物,其对万古霉素没有抗性
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:用于特异地检测抗性生物的培养基的制作方法用于特异地检测抗性生物的培养基本申请是申请日为2006年2月9日、申请号为200680004645. 6、发明名称为“用于特异地检测抗性生物的培养基”的发明专利申请的分案申请。本发明领域是通过生物化学方法的微生物学分析的领域,并且特别是检测和鉴定微生物例如尤其是细菌或酵母的领域。细菌对抗生素的抗性是主要的公共卫生问题。感染性微生物对治疗的抗性与抗感染分子同时形成,并且目前代表了治疗中的主要障碍。这种抗性负责多种问题的根源,包括实验室检测的困难,有限的治疗选择和对临床结果的有害影响。特别地,在过去20年中致病性细菌抗性的快速且抑制不住的增加代表了医学中的主要流行问题之一。由这些生物引起的感染是住院时间延长的原因,并且与治疗失败后的高发病率和死亡率相关。在一个菌株中可以同时涉及几种抗性机制。它们一般分为3类抗生素不能渗透到细菌中,通过细菌的酶系统来使抗生素失活或排出,以及细菌靶和抗生素之间缺乏亲和力。就所涉及的物种和抗生素的数目而言,酶促失活是获得性抗性的最常见的机制。 因此,染色体C类头孢菌素酶目前构成革兰氏阴性菌中占优势的抗性机制之一,革兰氏阴性菌表达对头孢菌素类具有抗性的此类酶。类似地,β-内酰胺酶是由某些细菌表达的酶, 其能够水解β-内酰胺环(其是β-丙氨酸类家族的抗生素的基本结构)的C-N键,从而产生在微生物学上失活的产物。已开发了几种β_内酰胺酶抑制剂(BLI),例如克拉维酸 (CA)、三唑巴坦和舒巴坦,以增加抗微生物活性并扩展与之相关的β_丙氨酸类的谱系。由于这些抑制剂充当内酰胺酶的自杀底物,因而防止了抗生素的酶促降解并允许它们有效对抗最初有抗性的细菌。然而,由于菌株持续暴露于抗生素压力,所以细菌通过β -内酰胺酶的连续且动态的产生而表现出它们的适应能力,所述内酰胺酶在形成新分子的同时进行进化。因此,产生高水平染色体C类头抱菌素酶(c6phalosporinases chromosomiques de classe C haut niveau)的革兰氏阴性细菌(称为Case HN细菌),以及产生广谱β -内酰胺酶(β-lactamases a spectre etendu)的革兰氏阴性细菌(因而称为BLSE细菌),已成为日益增加的威胁,特别是因为所涉及的细菌种类数目日益增加。CaseHN和BLSE细菌不仅对基于第I代和第2代青霉素类和头孢菌素类的治疗有抗性,还对第3代头孢菌素类 (C3G)(头孢噻肟CTX、头孢他啶CAZ、头孢泊肟CPD、头孢曲松CR0)和单环内酰胺类(氨曲南ATM)有抗性。相反地,7α-甲氧基头孢菌素类(头霉素头孢西丁、头孢替坦)和碳青霉烯类(亚胺培南、美罗培南、厄他培南(ertapenem)) —般保持了其活性。BLSE被β-内酰胺酶抑制剂(BLI)抑制,这使得能够将它们与其他头孢菌素酶区别开。因此,这些细菌最常同时表现出针对几种治疗的抗性,这对于建立相关治疗和避免治疗失败造成了困难。因此,大肠杆菌(Escherichia coli)可以是Case HN和BLSE。 此外,因为BLSE阳性肠细菌有通过菌株的克隆传递或质粒结合转移而散布抗性的趋势, 所以它们代表了传染控制方面的问题。在大多数研究中,大肠杆菌和肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)仍是最常见的产生BLSE的物种。然而,几年以来,BLSE已大大扩展了它们的宿主物种的名单。因为,许多肠细菌和非发酵型革兰氏阴性杆菌(例如铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa))物种也已报道为BLSE的生产者。除了这些BLSE细菌外,还可以提及的是金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),它也是形成了许多抗性机制的致病性细菌,例如对于甲氧西林、青霉素、四环素、红霉素、万古霉素的抗性。屎肠球菌(Enterococcus faecium)是在医院环境中发现的另一种多重抗性的细菌,它可以抵抗青霉素、万古霉素和利奈唑胺。结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)通常对异烟肼和利福平具有抗性。其他病原体提供了某些抗性,例如沙门氏菌属(Salmonella)、弯曲杆菌属(Campylobacter)和链球菌属 (Streptococcus)。因此,从公共卫生观点看来,能够尽快地鉴定此类微生物和此类抗性机制是非常必要的。一般地,对治疗有抗性的微生物的寻找按照下列步骤进行I.获取可能包含所述微生物的生物样品;2.接种并孵育培养基(18-48小时)以诱导微生物的指数生长;3.在培养基上定位潜在重要的微生物的菌落;4.表征微生物物种;5.鉴定所分析的微生物的抗性机制、它们的生物学意义、和任选地还有合适的疗法。这一系列步骤涉及在获取可能包含所述微生物的样品和指出适合于患者的治疗之间的大量时间。此外,使用者通常必须人工地执行将微生物从第一种培养基转移至第二种培养基的步骤,这可以引起特别是污染问题,以及对操作者的健康造成危险。例如,为了检测在大肠杆菌和肺炎克雷伯氏菌菌株中广谱β-内酰胺酶(BLSE)的存在,可以使用如 Jacoby 和 Han 的出版物(J Clin Microbiol. 34(4) =908-11,1996)中所描述的扩散技术,然而这并不给出用于鉴定所测试的菌株的任何信息;可以确定该细菌是否是BLSE生产菌,但不能区分此类细菌是大肠杆菌还是肺炎克雷伯氏菌。代谢底物也可用于检测BLSE或Case HN的存在。在这方面,AES实验室提出了在组合了含有头孢噻肟的Drigalski培养基和含有头孢他啶的MacConkey培养基的双板 (bi boite )中的培养基。Drigalski和MacConkey培养基使得能够揭示乳糖的酸化作用,这是在非常大量的肠细菌种类中存在的代谢作用。然而,此类培养基仅仅使得能够区分抗性细菌和非抗性细菌,而并不使得能够区分表达BLSE的细菌和表达Case HN的细菌。这种培养基也不能鉴定特定的细菌种类,和不能例如将大肠杆菌和肺炎克雷伯氏菌区别开来。在检测除BLSE外的抗性机制的情况下,可以提及专利申请EP0954560,它涉及通过将万古霉素与生色培养基相组合来寻找万古霉素抗性肠球菌,所述生色培养基揭示两种酶活性(β -葡糖苷酶和吡咯烷酮基-芳基酰胺酶)。然而,这种生色培养基只使得能够确定所述万古霉素抗性菌株是否属于肠球菌属(Enterococcus),但并不使得能够鉴定所涉及的物种或抗性机制,特别是如果涉及获得性或野生型抗性。因此,表征微生物物种以及随后鉴定其对治疗的抗性是长时间和费力的。如果实验室给予临床医师阳性检出结果,而分离物事实上不含抗性微生物,那么这可以导致无用的和不适当的治疗。相反地,如果不传达后来被确认的阳性检出结果,则会使患者的隔离 (和可能地,合适的治疗)这样的布置延迟一天。这显示需要快速和可靠的确认测试。因此,本发明提出通过提供新型诊断工具来改善现有技术,所述诊断工具允许在所实施的疗法中获得时间、可靠性和针对性。我们的发明使得能够在单一步骤中鉴定样品中存在的微生物种类,并且确定它们的抗性机制以便提出适合于每个患者的治疗。本发明特别适合于辨别不同的微生物种类,它们具有针对不同治疗的不同抗性机制,但它们都可能存在于同一样品中。在更加深入本发明的公开内容之前,给出下列定义以便有助于理解本发明术语“培养基”意指包含微生物存活和/或生长所需的所有成分的介质。根据本发明的培养基可以包含可能的其他添加剂,例如蛋白胨、一种或多种生长因子、碳水化合物、 一种或多种选择齐U、缓冲液、一种或多种胶凝剂等。这种培养基可以是液体、凝胶的形式,其是现成可用的,即准备好用于接种在试管、烧瓶中或接种在培养皿上。在本发明的范围内,术语“微生物”包括革兰氏阳性或革兰氏阴性细菌,酵母,和更一般地,通常是单细胞的、肉眼看不见的、可以在实验室中繁殖并操作的生物。作为革兰氏阴性细菌,可以提及下列属的细菌假单胞菌属(Pseudomonas)、 埃希氏菌属(Escherichia)、沙门氏菌属(Salmonella)、志贺氏菌属(Shigella)、肠杆菌属(Enterobacter)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、沙雷氏菌属(Serratia)、变形菌属(Proteus)、弯曲杆菌属(Campylobacter)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、摩根氏菌属(Morganella)、弧菌属(Vibrio)、耶尔森氏菌属(Yersinia)、不动杆菌属 (Acinetobacter)、布兰汉氏球菌属(Branhamella)、奈瑟氏球菌属(Neisseria)、伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia)、朽1檬酸杆菌属(Citrobacter)、哈夫尼菌属(Hafnia)、爱德华氏菌属(Edwardsiella)、气单胞菌属(Aeromonas)、莫拉氏菌属(Moraxella)、巴斯德氏菌属 (Pasteurella)、普罗威登斯菌属(Providencia)和军团菌属(Legionella)。作为革兰氏阳性细菌,可以提及下列属的细菌肠球菌属(Enterococcus)、 链球菌属(Streptococcus)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、芽抱杆菌属(Bacillus)、 利斯特氏菌属(Listeria)、梭菌属(Clostridium)、加德纳氏菌属(Gardnerella)、库克菌属(Kocuria)、乳球菌属(Lactococcus)、明串珠菌属(Leuconostoc)、微球菌属 (Micrococcus)、分枝杆菌属(Mycobacteria)和棒状杆菌属(Corynebacteria)。作为酵母,可以提及下列属的酵母假丝酵母属(Candida)、隐球酵母属 (Cryptococcus)、糖酵母属(Saccharomyces)和丝抱酵母属(Trichosporon)。术语“生物样品”意指来源于生物学液体样本的临床样品,或来源于任何类型食物的食物样品。这种样品因此可以是液体或固体,并且可以以非限制性的方式提及临床样品, 其来自血液、血浆、尿、粪便,来自鼻、咽喉、皮肤、伤口、脑脊液的样本;食物样品,其来自水、 饮料例如牛奶、果汁,来自酸奶、肉、蛋、蔬菜、蛋黄酱、乳酪,来自鱼等;来源于预期用于动物的食物的食物样品,例如特别地,来源于动物用粗粉的样品。术语“抗性机制”意指任何类型的设置,其允许微生物致使治疗对所述微生物部分或完全无效,从而保证其存活。抗性机制一般分为3类抗生素不能渗透到细菌中,通过细菌的酶系统来使抗生素失活或排出,以及细菌靶和抗生素之间缺乏亲和力。指示性地,可以特别提及与属于广谱β -内酰胺酶组的酶的表达相关联的抗性机制;与属于高水平染色体C类头孢菌素酶组的酶的表达相关联的抗性机制;针对糖肽的抗性机制,优选由属于肠球菌属的细菌所形成的抗性机制。当微生物是金黄色葡萄球菌时,还可以提及针对甲氧西林、青霉素、四环素、红霉素、万古霉素的抗性机制。当微生物是屎肠球菌时,还可以提及针对青霉素、万古霉素和利奈唑胺的抗性机制。当微生物是酵母时,还可以提及针对两性霉素B或针对吡咯家族的抗真菌剂的抗性机制。最后,当微生物是结核分枝杆菌时,可以提及针对异烟肼和利福平的抗性机制。术语“治疗”意指能够防止或减少来源于患者的微生物生长的处理。这种治疗可以特别包括抗微生物剂化合物,例如抗生素,如青霉素类、常规的头孢菌素类、广谱头孢菌素类、单环内酰胺类、糖肽、氨基糖苷,或例如抗真菌剂,或抗性抑制剂化合物。应注意的是, 这种治疗还可包括患者的隔离,从而防止微生物在其他患者中的传播。使得能够检测酶或代谢活性的“底物”这一术语意指由于微生物的酶或代谢活性而能够直接或间接产生可检测信号的任何分子。当这种活性是酶活性时,则称为酶底物。术语“酶底物”意指任何底物,其可以被酶水解为允许直接或间接检测微生物的产物。这种底物特别包括对待揭示的酶活性特异的第一部分,和充当标记的第二部分,其在下文中称为标记部分。这种标记部分可以是生色的、发荧光的、发光的等。作为非常适合于固体支持物(过滤器、琼脂、电泳凝胶)的生色底物,可以特别提及基于吲哚酚及其衍生物的底物,和基于羟基喹啉或七叶亭及其衍生物的底物,其使得能够检测糖苷酶和酯酶活性。还可以提及基于硝基苯酚和硝基苯胺及衍生物的底物,在基于硝基苯酚的底物的情况下使得能够检测糖苷酶和酯酶活性,并且在基于硝基苯胺的底物的情况下使得能够检测肽酶活性。最后,可以提及基于萘酚和萘胺及其衍生物的底物,其使得能够经由萘酚检测糖苷酶和酯酶活性,和经由萘胺检测肽酶活性。特别地,但非限制性地,这种底物可以使得能够检测酶活性例如糖苷酶、肽酶、酯酶等的活性。酶底物还可以是其水解产物可被直接或间接检测的天然底物。作为天然底物,可以特别提及用于检测色氨酸酶或脱氨酶活性的色氨酸、用于检测脱氨酶活性的环状氨基酸(色氨酸、 苯丙氨酸、组氨酸、酪氨酸)、用于检测磷脂酶活性的磷脂酰肌醇,等等。当这种活性是代谢活性时,那么底物是代谢底物,例如碳源或氮源,其与在代谢产物之一存在时产生着色的指示剂相偶联。根据本发明的优选实施方案,所述第一种和/或第二种酶或代谢活性是酶活性, 其优选选自下列酶活性葡糖苷酶、脱氨酶、葡糖醛酸糖苷酶、半乳糖苷酶、 α -葡糖苷酶、α -半乳糖苷酶、氨基己糖苷酶、N-乙酰基-氨基己糖苷酶、磷酸酶、酯酶和氨肽酶。例如,为了检测大肠杆菌,优选使用葡糖醛酸糖苷酶或半乳糖苷酶或色氨酸酶或脱氨酶活性;为了检测变形菌,优选使用脱氨酶活性;为了检测肠球菌,优选使用 β-葡糖苷酶活性。对于白色假丝酵母(Candida albicans),优选氨基己糖苷酶;对于单核细胞增生利斯特氏菌(Listeria monocytogenes),优选磷脂酶;对于沙门氏菌,优选酯酶;对于铜绿假单胞菌,优选酯酶或β -丙氨酸氨肽酶;对于金黄色葡萄球菌,优选磷酸酶或α -葡糖苷酶。“用于区别两组微生物的标记”这一术语意指对于第一组和第二组不具有相同特性的化合物。因此,这种化合物可以是籲特异的底物; 抗性机制的抑制剂,其因而允许抑制展现出特定抗性的生物的生长,而无需辨别微生物的种类。在使用特异的底物的情况下,对于检测大肠杆菌,优选使用β -葡糖醛酸糖苷酶或β -半乳糖苷酶或色氨酸酶或脱氨酶活性;对于检测变形菌,优选使用脱氨酶活性;对于检测肠球菌,优选使用葡糖苷酶活性。对于白色假丝酵母,优选氨基己糖苷酶;对于单核细胞增生利斯特氏菌,优选磷脂酶;对于沙门氏菌,优选酯酶;对于铜绿假单胞菌,优选酯酶或β -丙氨酸氨肽酶;对于金黄色葡萄球菌,优选磷酸酶或α -葡糖苷酶。在使用抗性机制的抑制剂的情况下,优选使用 克拉维酸、三唑巴坦或舒巴坦,当第一组和/或第二组包含由β -内酰胺酶表达而引起的抗性机制时。那么,培养基中克拉维酸的浓度优选为O. 05-32mg/l,优选O. l_8mg/ I,更加优选 O. 25-6mg/l ; 氯唑西林或双氯西林,当第一组和/或第二组包含由头孢菌素酶表达而引起的抗性机制时。术语“分类群”意指一组具有分类单位的微生物。分类群可以是科、属、属的集合、 种、种的集合或亚种。指示性地,可以提及肠细菌、克雷伯氏菌属、埃希氏菌属、肠杆菌属、柠檬酸杆菌属、沙雷氏菌属、KESC(克雷伯氏菌属、肠杆菌属、沙雷氏菌属、朽1檬酸杆菌属)、变形菌族(Proteeae)、变形菌属、摩根氏菌属、假单胞菌属、葡萄球菌属、链球菌属、肠球菌属、 假丝酵母属、大肠杆菌、大肠杆菌0157: H7、肺炎克雷伯氏菌、弗氏朽1檬酸杆菌(Citrobacter freundii)、粪肠球菌(Enterococcus faecalis)、屎肠球菌、金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性的葡萄球菌、白色假丝酵母、光滑假丝酵母(Candida glabrata)、克鲁斯氏假丝酵母 (Candida krusei)、葡萄牙假丝酵母(Candida lusitaniae)。术语“抗微生物剂”意指能够防止或减缓微生物生长的任何化合物。这种化合物可以是抗生素或抗真菌剂。术语“抗生素”意指能够防止或减缓细菌生长的任何化合物。指示性地,可以特别提及头孢噻肟、头孢他啶、头孢曲松、头孢泊肟、氨曲南、万古霉素、妥布霉素和环丙沙星这些抗生素。术语“抗真菌剂”意指能够防止或减缓酵母或霉菌生长的任何化合物。指示性地, 可以特别提及两性霉素B、氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑、放线菌酮。根据本发明的优选实施方案, 当抗生素是头孢噻肟时,培养基中头孢噻肟的浓度优选为O. 25-8mg/l,优选1-2mg/l; 当抗生素是头孢他啶时,培养基中头孢他啶的浓度优选为O. 25_8mg/l,优选2-2.5mg/l ; 当抗生素是头孢曲松时,培养基中头孢曲松的浓度优选为O. 25-8mg/l,优选 1-2. 5mg/l ; 当抗生素是头孢泊肟时,培养基中头孢泊肟的浓度优选为O. l_32mg/l,优选 O. 75-10mg/l,更加优选 l-6mg/l ; 当抗生素是氨曲南时,培养基中氨曲南的浓度优选为O. l-8mg/l,优选 O. 75-1. 5mg/l ο根据本发明的一个特别实施方案,培养基包含至少两种抗生素的组合。优选地,至少两种抗生素的组合包括头孢噻肟和头孢他啶。不管本发明的实施方案如何,培养基还可包含着色剂。指示性地,作为着色剂可以提及Evans蓝、中性红、绵羊血、马血、遮光剂例如二氧化钛、硝基苯胺、孔雀绿、亮绿等。所有培养基还可包含下列物质,以便增加它们的灵敏性 至少一种抗微生物剂,其具有对抗革兰氏阳性细菌的活性,例如特别是利奈唑胺或万古霉素; 至少一种抗微生物剂,其具有对抗酵母的活性,例如特别是伏立康唑或两性霉素B ;在这方面,本发明涉及两种培养基的组合用于区分生物样品中的至少3组微生物的用途,所述生物样品包含 第一组微生物,属于第一个微生物分类群并包含针对第一种治疗的至少第一种抗性机制; 第二组微生物,属于第二个微生物分类群并包含针对第二种治疗的至少第二种抗性机制; 第三组微生物,其对所述第一种和第二种治疗没有抗性,所述两种培养基的组合包括a.至少第一种底物,其使得能够检测所述第一组微生物的至少第一种酶或代谢活b.至少两种标记,其使得能够区别所述第一组微生物和所述第二组微生物;c.至少一种抗微生物剂,其对所述第三组微生物具有活性。优选地,培养基包含使得能够区别所述第一组微生物和所述第二组微生物的至少两种标记,其中至少一种是所述第一种或所述第二种抗性机制的抑制剂。培养基还可包含使得能够区别所述第一组微生物和所述第二组微生物的至少两种标记,它们中每一种是所述第一种或所述第二种抗性机制的抑制剂。本发明的该第一个实施方案使得能够在同一个样品中区分第一组和第二组,其包括不同的微生物物种或不同的微生物分类群,所述两组中的每一组对不同治疗具有抗性。因此,本发明的这个实施方案使得能够,例如在同一个样品中区分包括大肠杆菌 BLSE的第一组和包括细菌KESC Case HN的第二组。在这种特定情况下,两种培养基的组合可以是下列 至少第一种底物,其使得能够鉴定大肠杆菌,例如葡糖醛酸糖苷酶底物, 如6-氯-3-吲哚基-β-D-葡糖苷酸,或者半乳糖苷酶底物,如5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷; 第一种鉴定标记,其是葡糖苷酶底物,例如5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,它使得能够鉴定细菌KESC ; 第二种鉴定标记,其是抗性机制的抑制剂,例如氯唑西林; 至少一种抗微生物剂,其是抗生素,例如头孢泊肟。如下称为两种培养基的组合,即第一种培养基可以包含籲第一种底物,其使得能够鉴定大肠杆菌,例如葡糖醛酸糖苷酶底物,如 6-氯-3-吲哚基-β-D-葡糖苷酸,或者半乳糖苷酶底物,如5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷; 第一种标记,其是抗性机制的抑制剂,例如氯唑西林; 抗微生物剂,其是抗生素,例如头孢泊肟,而第二种培养基包含籲第一种底物,其使得能够鉴定大肠杆菌,例如葡糖醛酸糖苷酶底物,如 6-氯-3-吲哚基-β-D-葡糖苷酸,或者半乳糖苷酶底物,如5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷; 第一种标记,其是葡糖苷酶底物,例如5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷, 它使得能够鉴定细菌KESC ; 抗微生物剂,其是抗生素,例如头孢他啶。另一种可替代方案可以使用第一种培养基,其包含籲第一种底物,其使得能够鉴定大肠杆菌,例如葡糖醛酸糖苷酶底物,如 6-氯-3-吲哚基-β-D-葡糖苷酸,或者半乳糖苷酶底物,如5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷; 第一种标记,其是葡糖苷酶底物,例如5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷, 它使得能够鉴定细菌KESC ; 抗微生物剂,其是抗生素,例如氨曲南,而第二种培养基包含籲第一种底物,其使得能够鉴定大肠杆菌,例如葡糖醛酸糖苷酶底物,如 6-氯-3-吲哚基-β-D-葡糖苷酸,或者半乳糖苷酶底物,如5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷; 第一种标记,其是抗性机制的抑制剂,例如克拉维酸; 抗微生物剂,其是抗生素,例如头孢他啶。本领域技术人员将选择每种培养基,以便系统性地获得根据本发明的组合。对所述第三组微生物具有活性的抗微生物剂存在于这两种培养基中。本领域技术人员将可以特别地使用双板,它使得能够容易地比较将在其上放置同一种生物样品的两种培养基。在这方面,本发明还涉及包括两种培养基的组合的双板,所述组合包括a.至少第一种底物,其使得能够检测所述第一组微生物的至少第一种酶或代谢活b.至少两种标记,其使得能够区别所述第一组微生物和所述第二组微生物;c.至少一种抗微生物剂,其对所述第三组微生物具有活性,所述抗微生物剂存在于所述双板的每一侧上。本发明的该第一个实施方案不限于区分3组微生物,而是还能够区分4、5或更多组微生物。那么,必需向培养基中加入另外的鉴定标记,以便区别不同的组。在这方面,本发明还涉及包括两种培养基的组合的双板,所述组合包括-对于第一种培养基籲第一种底物,其使得能够鉴定大肠杆菌,例如葡糖醛酸糖苷酶底物如 6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷酸,或半乳糖苷酶底物如5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷,或者使得能够鉴定变形菌族的底物,例如色氨酸; 第一种鉴定标记,其是葡糖苷酶底物,例如5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷; 第二种鉴定标记,其是抗性的抑制剂,例如氯唑西林; 至少一种抗微生物剂,其是抗生素,例如头孢泊肟;-对于第二种培养基籲第一种底物,其使得能够鉴定肠球菌,例如葡糖苷酶底物,如5-溴-4-氯-3-吲噪基_ β -D-匍糖昔; 第一种鉴定标记,其是另一种葡糖苷酶底物,例如甲基-α-葡糖苷; 至少一种抗微生物剂,其是抗生素,例如万古霉素。本发明还涉及培养基用于区分生物样品中的至少3组微生物的用途,所述生物样品包含 第一组微生物,属于第一个微生物分类群并包含针对治疗的至少一种抗性机制; 第二组微生物,属于不同于所述第一个分类群的第二个微生物分类群,但包含针对治疗的至少一种抗性机制,所述抗性机制与第一组的相同; 第三组微生物,其对所述治疗没有抗性,所述培养基包含a.至少第一种底物,其使得能够检测所述第一组微生物的至少第一种酶或代谢活b.至少一种标记,其使得能够区别所述第一组微生物和所述第二组微生物,所述标记是使得能够检测所述第二组微生物的至少一种酶或代谢活性的底物;c.至少一种抗微生物剂,其对所述第三组微生物具有活性。本发明的该第二个实施方案使得能够在同一个生物样品中区分第一组和第二组, 其包括不同的微生物物种或不同的微生物分类群,但所述两组中的每一组对同一种治疗具有抗性。在本发明的这个具体实施方案中,不必使用培养基的组合,因为包括如上定义的特征的单一培养基就足够了。因此,本发明的这个实施方案使得能够,例如在同一个样品中区分包括大肠杆菌 BLSE的第一组和包括细菌KESC BLSE的第二组。在这方面,本发明涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测β -葡糖苷酶的酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基- β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/l ; 第二种底物,其使得能够在有色指示剂存在下检测甲基-α -葡糖苷的代谢,所述有色指示剂优选中性红,浓度为2-100mg/l,优选4-50mg/l ; 抗微生物剂,其是抗生素,优选万古霉素,浓度为O. 5-128mg/l,优选2_32mg/l。当抗生素是万古霉素时,这种培养基优选用于区分 第一组肠球菌,其展现出针对万古霉素的获得性抗性; 第二组肠球菌,其展现出针对万古霉素的天然抗性; 第三组肠球菌,其对万古霉素没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测氨基己糖苷酶的酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-乙酰基- β -D-氨基葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/l ; 第二种底物,其使得能够检测β-葡糖苷酶活性,优选6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,浓度为 25-500mg/l,优选 40_200mg/l ; 抗微生物剂,其是抗真菌剂,优选两性霉素B(amphoB),浓度为O. 5_64mg/l,优选 l_16mg/l,更加优选 l-8mg/l。当抗真菌剂是两性霉素B时,这种培养基优选用于区分 第一组酵母,包括白色假丝酵母,其展现出两性霉素B抗性; 第二组酵母,包括热带假丝酵母(Candida tropicalis)和/或葡萄牙假丝酵母和/或乳酒假丝酵母(C. kefyr),其展现出两性霉素B抗性; 第三组酵母,其对两性霉素B没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测氨基己糖苷酶的酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-乙酰基- β -D-氨基葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/l ; 第二种底物,其使得能够检测磷酸酶活性,优选5-溴-6-氯-3-吲哚基-磷酸酯,浓度为 25-750mg/l,优选 40_200mg/l ; 抗微生物剂,其是抗真菌剂,优选两性霉素B,浓度为O. 5_64mg/l,优选l_16mg/ I,更加优选l_8mg/l。当抗真菌剂是两性霉素B时,这种培养基优选用于区分 第一组酵母,包括白色假丝酵母,其展现出两性霉素B抗性; 第二组酵母,包括热带假丝酵母和/或光滑假丝酵母和/或克鲁斯氏假丝酵母, 其展现出两性霉素B抗性; 第三组酵母,其对两性霉素B没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测所述第一组微生物的氨基己糖苷酶的酶活性, 优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-乙酰基- β -D-氨基葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选 40-150mg/l ; 第二种底物,其使得能够检测所述第二组微生物的β-葡糖苷酶活性,优选 6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_200mg/l ; 抗微生物剂,其是抗真菌剂,优选氟康唑,浓度为l_256mg/l,优选2_128mg/l, 更加优选8-64mg/l。当抗真菌剂是氟康唑时,这种培养基优选用于区分 第一组酵母,包括白色假丝酵母,其展现出氟康唑抗性; 第二组酵母,包括热带假丝酵母和/或葡萄牙假丝酵母和/或乳酒假丝酵母,其展现出氟康唑抗性; 第三组酵母,其对氟康唑没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测氨基己糖苷酶的酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-乙酰基- β -D-氨基葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/l ; 第二种底物,其使得能够检测磷酸酶活性,优选5-溴-6-氯-3-吲哚基-磷酸酯,浓度为 25-750mg/l,优选 40_200mg/l ; 抗微生物剂,其是抗真菌剂,优选氟康唑,浓度为l_256mg/l,优选2_128mg/l, 更加优选8-64mg/l。当抗真菌剂是氟康唑时,这种培养基优选用于区分 第一组酵母,包括白色假丝酵母,其展现出氟康唑抗性; 第二组酵母,包括热带假丝酵母和/或光滑假丝酵母和/或克鲁斯氏假丝酵母, 其展现出氟康唑抗性; 第三组酵母,其对氟康唑没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测β -葡糖醛酸糖苷酶的酶活性,优选6-氯-3-吲哚基- β -D-葡糖苷酸,浓度为25-750mg/l,优选40-300mg/l,或者检测β -半乳糖苷酶的酶活性,优选5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/ I ; 第二种底物,其使得能够检测β -葡糖苷酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_250mg/l,或者检测色氨酸酶或脱氨酶活性, 优选色氨酸,浓度为50-5000mg/l,优选250_2000mg/l ; 抗微生物剂,其是抗生素,优选头孢他啶。那么,培养基中头孢他啶的浓度优选为 O. 25-8mg/l,优选 2-2. 5mg/l。当抗生素是头孢他啶时,这种培养基优选用于区分 第一组细菌,大肠杆菌BLSE或Case NH ; 第二组细菌,KESC BLSE 或 Case NH ; 第三组细菌,其对β -丙氨酸类和/或头孢菌素类没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测β-葡糖醛酸糖苷酶或β-半乳糖苷酶的酶活性,优选6-氯-3-吲哚基- β -D-葡糖苷酸,浓度为25-750mg/l,优选40_300mg/l,或5-溴-6-氯-3-吲哚基- β -D-半乳糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/l ; 第二种底物,其使得能够检测β -葡糖苷酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_250mg/l,或者检测色氨酸酶或脱氨酶活性, 优选色氨酸,浓度为50-5000mg/l,优选250_2000mg/l ; 抗微生物剂,其是抗生素,优选头孢泊肟,浓度为O. 5_32mg/l,优选O. 75-10mg/ 1,更加优选l_6mg/l,和氯唑西林,浓度为10-2000mg/l,优选50_500mg/l。当抗生素是头孢泊肟时,这种培养基优选用于区分 第一组细菌,大肠杆菌BLSE ;
第二组细菌,KESC BLSE ; 第三组细菌,其对β -丙氨酸类没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测β -葡糖醛酸糖苷酶的酶活性,优选6-氯-3-吲哚基- β -D-葡糖苷酸,浓度为25-750mg/l,优选40-300mg/l,或者检测β -半乳糖苷酶的酶活性,优选5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/ I ; 第二种底物,其使得能够检测β -葡糖苷酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_250mg/l,或者检测色氨酸酶或脱氨酶活性, 优选色氨酸,浓度为50-5000mg/l,优选250_2000mg/l ; 包括抗微生物剂和抗性的抑制剂的组合。优选地,这种组合包括头孢曲松,浓度为O. 25-8mg/l,优选1-2. 5mg/l,和克拉维酸,浓度为O. 05_32mg/l,优选O. l_8mg/l,更加优选O. 25-6mg/l。这种培养基优选用于区分 第一组细菌,大肠杆菌CaseHN; 第二组细菌,KESC CaseHN ; 第三组细菌,其对头孢菌素类没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 第一种底物,其使得能够检测β -葡糖醛酸糖苷酶的酶活性,优选6-氯-3-吲哚基- β -D-葡糖苷酸,浓度为25-750mg/l,优选40-300mg/l,或者检测β -半乳糖苷酶的酶活性,优选5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_150mg/ I ; 第二种底物,其使得能够检测β -葡糖苷酶活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40-250mg/l,或者检测色氨酸酶或脱氨酶活性, 优选色氨酸,浓度为50-5000mg/l,优选250_2000mg/l ; 两种抗微生物剂,其优选是两种抗生素,优选头孢泊肟,浓度为O. l_32mg/l,优选O. 25-10mg/l,更加优选O. 5_4mg/l,和氨曲南,浓度为优选O. l_8mg/l,优选O. 5-1. 5mg/I。这种培养基优选用于区分 第一组细菌,大肠杆菌BLSE或Case NH ; 第二组细菌,KESC BLSE 或 Case NH ; 第三组细菌,其对β -丙氨酸类和/或头孢菌素类没有抗性。本发明还涉及培养基,其包含 至少第一种底物,其使得能够检测α -葡糖苷的代谢,优选甲基-α -葡糖苷,浓度为l_50g/l,优选5-20g/l,或者5-溴-4-氯-3-吲哚基-a -D-葡糖苷,浓度为25_500mg/ I,优选40-250mg/l,或者5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-甲基-a -D-葡糖苷,浓度为25_500mg/ 1,优选 40-250mg/l ; 至少第二种底物,其使得能够检测与α-葡糖苷的代谢不同的第二种活性,优选5-溴-4-氯-3-吲哚基- β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_250mg/l,或者6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_250mg/l,或者茜素-β -D-半乳糖苷,浓度为10-500mg/l,优选20-250mg/l,或者5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷, 浓度为25-500mg/l,优选40_250mg/l,或者5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷,浓度为25-500mg/l,优选40_250mg/l,或者6-氯-3-吲哚基-β -D-半乳糖苷,浓度为25_500mg/ 1,优选40-250mg/l。优选地,这第二种底物使得能够检测β -葡糖苷酶或β _半乳糖苷酶活性; 至少一种抗微生物剂,优选抗生素,例如万古霉素,浓度为O. 5_128mg/l,优选 2_32mg/l。当抗生素是万古霉素时,这种培养基优选用于区分 第一组微生物,包括粪肠球菌和屎肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第二组微生物,包括铅黄肠球菌(Enterococcus casseliflavus)和鹁鸡肠球菌 (Enterococcus gallinarum),其对万古霉素具有抗性; 第三组微生物,其对万古霉素没有抗性。在这种情况下,第一种底物优选为甲基-α-葡糖苷,第二种底物优选为
5-溴-4-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷或6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,并且抗微生物剂优选为万古霉素。这种培养基还优选用于区分 第一组微生物,包括粪肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第二组微生物,包括屎肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第三组微生物,其对万古霉素没有抗性或表现出天然抗性(铅黄肠球菌和鹑鸡肠球菌)。在这种情况下,第一种底物优选为5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-甲基-a -D-葡糖苷或5-溴-4-氯-3-吲哚基-a -D-葡糖苷,第二种底物优选为6-氯_3_吲哚基-β -D-葡糖苷或茜素-β -D-半乳糖苷或5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷或5-溴-6-氯-3-吲哚基_ β -D-半乳糖苷或6-氯-3- Π引哚基-β -D-半乳糖苷,并且抗微生物剂优选为万古霉素。这种培养基还优选用于区分 第一组微生物,包括粪肠球菌和屎肠球菌,其对万古霉素具有抗性; 第二组微生物,包括金黄色葡萄球菌,其处于中间状态或对万古霉素具有抗 第三组微生物,其对万古霉素没有抗性。 在这种情况下,第一种底物优选为5-溴-4-氯-3-吲哚基-N-甲基-a -D-葡糖苷或5-溴-4-氯-3-吲哚基-a -D-葡糖苷,第二种底物优选为6-氯_3_吲哚基-β _D_葡糖苷或5-溴-6-氯-3-吲哚基-β -D-葡糖苷,并且抗微生物剂优选为万古霉素。下表使得能够根据希望检测的物种来挑选底物和抗微生物剂的适当组合


本发明涉及两种培养基的组合用于区分生物样品中的至少3组微生物的用途,所述生物样品包含第一组微生物,属于第一个微生物分类群并包含针对第一种治疗的至少第一种抗性机制;第二组微生物,属于第二个微生物分类群并包含针对第二种治疗的至少第二种抗性机制;第三组微生物,其对所述第一种和第二种治疗没有抗性,所述两种培养基的组合包括a.至少第一种底物,其使得能够检测所述第一组微生物的至少第一种酶或代谢活性;b.至少两种标记,其使得能够区别所述第一组微生物和所述第二组微生物;c.至少一种抗微生物剂,其对所述第三组微生物具有活性。



查看更多专利详情

下载专利文献

下载专利