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转基因玉米Bt11液相芯片检测方法

  • 专利名称
    转基因玉米Bt11液相芯片检测方法
  • 发明者
    韩雪清, 梅琳, 王慧煜, 林祥梅
  • 公开日
    2014年3月26日
  • 申请日期
    2012年9月6日
  • 优先权日
    2012年9月6日
  • 申请人
    中国检验检疫科学研究院
  • 文档编号
    C12Q1/68GK103667426SQ201210328256
  • 关键字
  • 权利要求
    1.用于检测转基因玉米Btll的引物对和探针,其特征在于, 所述引物对为正向引物 Bt IIF 5 ’ -TATCATCGACTTCCATGACCA-3,,反向引物 BtllRBiotin-5’ -AGCCAGTTACCTTCGGAAAA-3’ ; 所述探针为NH2-C12-5’ -TGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAG-3’2.含有权利要求1所述引物对和探针的用于检测转基因玉米Btll的试剂盒3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、TaqDNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液中的一种或多种4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括标准阳性模板5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性验证探针Biotin-5’ -CTTTTCTACGGGGTCTGACGCTCA-3’6.一种转基因玉米Btll液相芯片检测方法,其特征在于,包括以下步骤 1)提取待测玉米的总DNA; 2)以步骤I)中提取的DNA为模板,以权利要求1中所述的BtllF和BtllR为引物,进行PCR扩增反应; 3)将PCR产物与包被有权利要 求1中所述探针的微球混合孵育,反应结束后,置于液相芯片检测仪上进行分析7.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于,PCR反应体系以50μ L计为 8.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于,PCR反应条件为95°C预变性3min;95°C变性 30s, 58°C退火 30s, 72°C延伸 30s,共 35 个循环;72°C延伸 IOmin9.根据权利要求6-8任一项所述的检测方法,其特征在于,步骤3)中所述微球为羧基化荧光磁性微球10.根据权利要求6-8任一项所述的检测方法,其特征在于,步骤3)中混合孵育的条件为95V 5min,58°C 15min
  • 技术领域
    [0001]本发明涉及转基因玉米Btll的检测,具体地说,涉及一种转基因玉米Btll液相芯片检测方法
  • 专利摘要
    本发明提供一种转基因玉米Bt11液相芯片检测方法,根据转基因玉米Bt11中外源基因3’端与玉米基因组DNA连接区的序列,设计出可快速检测转基因玉米Bt11的特异性引物对和探针(如Seq?ID?No.1-3所示),并在此基础上建立了液相芯片检测方法,可快速、准确地检测出转基因玉米Bt11品系。根据该方法构建的检测试剂盒操作简便,特异性好,灵敏度高,对边境口岸的物种监测具有重要意义。
  • 发明内容
  • 专利说明
    转基因玉米Bt11液相芯片检测方法
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
转基因玉米Bt11液相芯片检测方法[0002]转基因玉米Btll为兼具抗虫害及耐除草剂两种特性的品系,其转入的抗虫基因为Bt系列毒蛋白基因的CrylAb抗虫基因,转入的耐草丁膦除草剂基因是草丁膦乙酰转移酶基因,在我国已批准进口用作加工原料,是转基因玉米中的代表性品系。目前,一些国家要求检测进口产品中是否含有转基因成分,有的还要求查明来自哪个转基因品系,该品系是否获准进入本国,例如,中国、欧盟、日本、韩国等国家和组织要求对其进行标识。因此,针对性的检测转基因玉米品系就显得非常重要。目前,在基因水平上检测转基因作物的技术已有很多,如PCR、基因芯片(Microarrays)和Real-time PCR等。这些检测方法已经在日常检测工作中广泛应用。但由于转基因作物的种类多、数量大,一些转基因产品经过深加工、各种条件处理与保存后,转基因成分部分或完全降解,所以检测难度大。因此,需要建立更加特异和灵敏的高通量检测方法。[0003]Luminex液相芯片检测技术是一种全新的快速高通量检测技术,也是唯一被美国食品与药物管理局(FDA)批准用于临床诊断的新型生物芯片产品。该技术集流式细胞技术、荧光编码微球、激光、数字信号处理和传统的生化技术于一体,具有独特的优点:检测需要样本少;相对于固相芯片,反应在液态体系中进行,大大缩短检测时间;关键是可灵活检测上百种分子,满足高通量检测需要。
[0004]本发明的目的是提供一种新型、准确、特异性强,灵敏度高的转基因玉米Btll液相芯片检测方法。[0005]为了实现本发明目的,本`发明提供一种用于检测转基因玉米Btll的引物对和探针,所述引物对为:[0006]正向引物Bt IIF: 5,-TATCATCGACTTCCATGACCA-3 ’,[0007]反向引物BtllR:Biotin-5,-AGCCAGTTACCTTCGGAAAA-3’ ;
[0008]所述探针为BtllProbe:
[0009]NH2-C12-5,-TGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAG-3,。
[0010]本发明还提供一种含有上述引物对和探针的用于检测转基因玉米Btll的试剂盒。
[0011]优选地,所述试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液中的一种或多种。更优选地,所述试剂盒还包括标准阳性模板。
[0012]更优选地,所述试剂盒还包括阳性验证探针:Biotin-5’ -CTTTTCTACGGGGTCTGACGCTCA-3,。[0013]本发明进一步提供一种转基因玉米Btll液相芯片检测方法,包括以下步骤:1)提取待测玉米的总DNA ;2)以步骤I)中提取的DNA为模板,以上述BtllF和BtllR为引物,进行PCR扩增反应;同时以水为模板设置空白对照;3)将PCR产物与包被有探针BtllProbe的微球混合孵育,反应结束后,置于液相芯片检测仪上进行分析。若检测的中位荧光值(MFI)大于空白对照的中位荧光值3倍以上,则判定该待测玉米为转基因玉米Btll品系。
[0014]PCR反应体系以50 μ L计为:
[0015]

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