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一种质粒提取纯化柱的回收方法

  • 专利名称
    一种质粒提取纯化柱的回收方法
  • 发明者
    韩寒
  • 公开日
    2011年10月19日
  • 申请日期
    2010年4月19日
  • 优先权日
    2010年4月19日
  • 申请人
    韩寒
  • 文档编号
    C12N15/10GK102220308SQ20101014981
  • 关键字
  • 权利要求
    1. 一种质粒提取纯化柱的回收方法,其方法如下步骤1,质粒DNA的制备按常规方法挑选已构建并经鉴定的anti-senseTSK质粒进行转化、涂板,每瓶200ml摇菌、收菌然后采用碱裂解法,用试剂Pl (EDTA、DNA抑制酶)IOml 悬浮菌后混合摇勻,-20度保存使用时取出后先解冻0. 5小时,至菌液变为液体时两管中各加入P2 (NaOH SDS 纯水=1 1 8) IOml轻微摇勻几下后放置几分钟至裂解充分 (菌液呈半透明),然后加入P3 (乙酸钾)IOml摇动使混勻,此时产生大量白色蛋白沉淀,放置冰中15分钟后再用力振荡至混勻,平衡后5000rpm离心30分钟后取上清液步骤2,质粒DNA的纯化取纯化柱,30mLQBT液平衡柱床,然后将步骤1制取的上清液加入到纯化柱内待上清液完全流经柱体后,加20mLQC液洗柱两次15mLQF液洗脱DNA 至放有0.7倍体积(10.5ml)异丙醇的管中,放置-20度中过夜第二天取出,两管平衡后5000rpm离心30分钟后用吸去上清400ul70%乙醇洗涤沉淀三次至1. 5ml离心管中, 12000rpm离心10分钟,吸去上清后室温干燥沉淀,最后用水溶解质粒DNA所形成的沉淀 步骤3,纯化柱再生对纯化柱做好标记,每次大抽回收时分别用IM HCl (方法1)、 3MNaCl (方法2),30ml/次洗脱上述使用过的纯化柱两次,然后分别浸泡在盛有IM HCl、3M NaCl的管中封口膜封口,浸泡24-48h,再次使用时用去离子水(MQ) 30ml/次,洗涤五次至流出液为中性再用QC液30ml/次,过柱一次(洗脱蛋白等杂质)QBT液30ml/次,过柱一次(平衡柱子)步骤4,鉴定回收是否彻底采用PCR、电泳法再次使用纯化柱时,当再次做大量抽提质粒前使纯化柱过QF液各两次,按上述收集质粒方法各收集两次后与之前收集的质粒(稀释到50ng/ul)通过PCR和琼脂糖凝胶电泳法比较看是否含有质粒步骤5,质粒DNA的纯度、含量测定及鉴定紫外分光光度仪测定两方法回收的柱子每次提取的样品DNA的0D260/0D280比值水溶后的样品取6ul加入到594ul灭菌水中,稀释 100倍后拿到紫外分光光度仪测定OD值,根据lug/ul = 0D260值X 5,将质粒稀释至Iug/ ul,再根据加水体积即总体机,算产量(产量=浓度X体积)
  • 技术领域
    本发明涉及一 种物品的回收方法,尤其涉及实验用的质粒提取纯化柱的回收方法
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    下面对本发明做具体实施例分析步骤1质粒DNA的制备按常规方法挑选已构建并经鉴定的anti-senseTSK质粒进行转化、涂板,20瓶 (200ml/瓶)摇菌、收菌然后采用碱裂解法,每瓶用试剂Pl (EDTA、DNA抑制酶)IOml悬浮菌后混合摇勻,均装在20个管中,-20度保存(保证每次抽提质粒时所用菌液相同)每次取两管做大量抽提质粒实验,做十次每次取出两管后先解冻0. 5时,至菌液变为液体时两管中各加入P2 (NaOH SDS 纯水=1 1 8) IOml轻微摇勻几下后放置几分钟至裂解充分(菌液呈半透明),然后加入P3(乙酸钾)IOml摇动使混勻,此时产生大量白色蛋白沉淀,放置冰中15分钟后再用力振荡至混勻,最后两管平衡后5000rpm离心30分钟后取上清液步骤2,质粒DNA的纯化取两支QIAGEN2tip2500纯化柱,依照其说明书所述步骤进行30mLQBT液平衡柱床,然后将上述上清液分别加入到两纯化柱内待上清液完全流经柱体后,加20mLQC液洗柱两次15mLQF液洗脱DNA至放有0. 7倍体积(10. 5ml)异丙醇的管中,放置-20度中过夜第二天取出,两管平衡后5000rpm离心30分钟后用小心吸去上清400ul70%乙醇洗涤沉淀三次至1. 5ml离心管中,12000rpm离心10分钟,吸去上清后室温干燥沉淀,最后用水溶解质粒DNA所形成的沉淀步骤3,纯化柱再生根据阴离子交换树脂的再生原理[2],对两柱子做好标记,每次大抽回收时分别用IM HCl (方法1)、3M NaCl (方法2),30ml/次洗脱上述使用过的纯化柱两次,然后分别浸泡在盛有IM HC1、3M NaCl的管中封口膜封口,浸泡24-48h,再次使用时用去离子水 (MQ)30ml/次,洗涤五次至流出液为中性再用QC液30ml/次,过柱一次(洗脱蛋白等杂质)QBT液30ml/次,过柱一次(平衡柱子),此柱即可再次使用,方法同前述步骤4,鉴定回收是否彻底PCR、电泳法再次使用两柱子时,当再次做大量抽提质粒前使两柱子过QF液各两次,按上述收集质粒方法各收集两次后与之前收集的质粒(稀释到50ng/ul)通过PCR和琼脂糖凝胶电泳法比较看是否含有质粒步骤5,质粒DNA的纯度、含量测定及鉴定紫外分光光度仪测定两方法回收的柱子每次提取的样品DNA的0D260/0D280比值水溶后的样品取6ul加入到594ul灭菌水中,稀释100倍后拿到紫外分光光度仪测定OD 值,根据lug/ul = ( 260值乂5,将质粒稀释至lug/ul,再根据加水体积即总体机,算产量(产量=浓度X体积)两方法回收的柱子十次提取的质粒取Iug跑琼脂糖凝胶电泳看条带表1为两方法回收的柱子所提取的质粒产量变化,通过表1可以看出十次产量变化不大;表2为两方法回收的柱子所提取的质粒产量变化,可以看出水溶后纯度变化在允许的范围内
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  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:一种质粒提取纯化柱的回收方法细菌质粒是一些双链闭环的DNA分子,这些质粒独立于细菌染色体之外进行复制,稳定可靠和操作简便是其优点,因此成为分子克隆的常用工具。质粒DNA提取更是分子生物学实验室最常规的操作之一。目前常见的质粒大量抽提方法有PEG沉淀法、溴化乙锭_氯化铯梯度离心法以及试剂盒法,其中试剂盒法较前两种方法快速并且提取的纯度高。近几年各种商业性纯化试剂盒应运而生,由于这些产品使用便捷,效果好,因此倍受科研人员的青睐。然而,因其是一次性产品,价格昂贵,这又成为人们不得不考虑的问题。
为降低实验成本,解决现有试剂盒不能反复使用的问题,本发明提出了一种试剂盒的回收方法。本发明的方法具体如下步骤1,质粒DNA的制备。按常规方法挑选已构建并经鉴定的anti-senseTSK质粒进行转化、涂板,每瓶200ml摇菌、收菌。然后采用碱裂解法,用试剂Pl (EDTA、DNA抑制酶)IOml悬浮菌后混合摇勻,-20度保存。使用时取出后先解冻0. 5小时,至菌液变为液体时两管中各加入P2 (NaOH SDS 纯水=1 1 8) IOml轻微摇勻几下后放置几分钟至裂解充分(菌液呈半透明),然后加入P3(乙酸钾)IOml摇动使混勻,此时产生大量白色蛋白沉淀,放置冰中15分钟后再用力振荡至混勻,平衡后5000rpm离心30分钟后取上清液。步骤2,质粒DNA的纯化。取纯化柱,30mLQBT液平衡柱床,然后将步骤1制取的上清液加入到纯化柱内。待上清液完全流经柱体后,加20mLQC液洗柱两次。15mLQF液洗脱 DNA至放有0.7倍体积(10. 5ml)异丙醇的管中,放置_20度中过夜。第二天取出,两管平衡后5000rpm离心30分钟后用小心吸去上清。400ul70%乙醇洗涤沉淀三次至1. 5ml离心管中,12000rpm离心10分钟,吸去上清后室温干燥沉淀,最后用水溶解质粒DNA所形成的沉淀。步骤3,纯化柱再生。对纯化柱做好标记,每次大抽回收时分别用IM HCl (方法1)、 3MNaCl (方法2),30ml/次洗脱上述使用过的纯化柱两次,然后分别浸泡在盛有IM HC1、3M NaCl的管中封口膜封口,浸泡24-48h,再次使用时用去离子水(MQ) 30ml/次,洗涤五次至流出液为中性。再用QC液30ml/次,过柱一次(洗脱蛋白等杂质)。QBT液30ml/次,过柱一次(平衡柱子)。步骤4,鉴定回收是否彻底。采用PCR、电泳法再次使用纯化柱时,当再次做大量抽提质粒前使纯化柱过QF液各两次,按上述收集质粒方法各收集两次后与之前收集的质粒(稀释到50ng/ul)通过PCR和琼脂糖凝胶电泳法比较看是否含有质粒。步骤5,质粒DNA的纯度、含量测定及鉴定。紫外分光光度仪测定两方法回收的柱子每次提取的样品DNA的0D260/0D280比值水溶后的样品取6ul加入到594ul灭菌水中, 稀释100倍后拿到紫外分光光度仪测定OD值,根据lug/ul = 0D260值X 5,将质粒稀释至 lug/ul,再根据加水体积即总体机,算产量(产量=浓度X体积)。本发明实现了质粒提取纯化柱更彻底的回收方法,避免了由于再生不彻底所造成的质粒交叉污染现象。使质粒提取纯化柱得以再生至少10次,成本降低至原价的1/10。本发明涉及一种物品的回收方法,尤其涉及实验用的质粒提取纯化柱的回收方法。目前常见的质粒大量抽提方法有PEG沉淀法、溴化乙锭-氯化铯梯度离心法以及试剂盒法,其中试剂盒法较前两种方法快速并且提取的纯度高。然而,因其是一次性产品,价格昂贵,这又成为人们不得不考虑的问题。本发明一种质粒提取纯化柱的回收方法,具体如下步骤1,质粒DNA的制备。步骤2,质粒DNA的纯化。步骤3,纯化柱再生。步骤4,鉴定回收是否彻底。步骤5,质粒DNA的纯度、含量测定及鉴定。本发明实现了质粒提取纯化柱更彻底的回收方法,避免了由于再生不彻底所造成的质粒交叉污染现象。使质粒提取纯化柱得以再生至少10次,成本降低至原价的1/10。



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