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Pdk3基因及其表达产物的应用制作方法

  • 专利名称
    Pdk3基因及其表达产物的应用制作方法
  • 发明者
    王群, 邓庆, 韩泽广
  • 公开日
    2012年9月26日
  • 申请日期
    2011年3月23日
  • 优先权日
    2011年3月23日
  • 申请人
    上海人类基因组研究中心
  • 文档编号
    A61K45/00GK102690868SQ20111006992
  • 关键字
  • 权利要求
    1.ー种roK3基因及其表达产物的应用,其特征在于所述roK3基因及其表达产物在制备治疗肝癌的药物中的应用2.如权利要求I所述的应用,其特征在于,所述治疗肝癌的药物包括通过RNA干扰抑制TOK3基因表达的双链核糖核酸、DNA载体、腺病毒或腺相关病毒载体;能够抑制TOK3蛋白激酶活性的化合物、多肽或单克隆抗体3.如权利要求2所述的应用,其特征在于所述双链核糖核酸,还包括该双链核糖核酸的不同修饰状态或不同递送方式4.用于制备治疗肝癌药物的ー对TOK3基因的siRNA,其特征在于该siRNA的正义链具有如SEQ ID NO 1所示的序列,反义链具有如SEQ ID NO 2所示的序列5.用于制备治疗肝癌药物的ー对TOK3基因的siRNA,其特征在于该siRNA的正义链具有如SEQ ID NO 3所示的序列,反义链具有如SEQ ID NO 4所示的序列6.用于制备治疗肝癌药物的ー对TOK3基因的siRNA,其特征在于该siRNA的正义链具有如SEQ ID NO 5所示的序列,反义链具有如SEQ ID NO 6所示的序列
  • 技术领域
    本发明涉及基因治疗技术领域,特别是涉及一种TOK3基因及其表达产物的应用
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    下面结合附图和实施例,对本发明作进一步详细的说明以下实施例仅用于说明本发明,而不用于限制本发明的范围实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如Sambrook等人,分子克隆实验室手册(NewYork Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件实施例I全激酶组范围内RNAi筛选肝癌细胞生长必需激酶基因针对人类基因组上所有激酶及激酶相关基因的siRNAs库通过商业化途径获得(Stealth RNAi Human Kinase Collection, Invitrogen, Catalog no. 12938-200)每套Stealth RNAi Collection 由若干 96 孔板组成2nmoles 的 Stealth RNAi 溶解在 100 U I的 IX RNA 退火 / 稀释溶液中(IOmM Tris-HCl,pH 8. 0 ;20mM NaCl ;lmM EDTA, pH 8. 0),终浓度为20 u Mo使用CellCounting Kit-8 (细胞活性检测试剂盒,简称CCK-8)测定细胞活性,实验步骤如图I所示,用美国BioTek酶标仪测定吸光度,产生原始细胞活性数据,原始数据经过标准化、数据校正、Z值评估等步骤,如图2所示,得到siRNA库对肝癌细胞生长影响的数据(见图3 6)如图6所示,siRNAs干扰TOK3基因对四株肝癌细胞生长活性的影响结果显示RNA干扰TOK3基因能够显著抑制肝癌细胞Huh-7、H印3B、MHCC-97H的生长实施例2RNA干扰TOK3基因抑制肝癌细胞生长将构建好的质粒pSUPER质粒转染肝癌细胞后48小时后抽提细胞株RNA,定量PCR鉴定RNA干扰的效果,确认质粒能够发挥RNAi效应后,与pcDNA3. I (质粒质量比5 I)共转染,将细胞重新接种于IOcm大盘中培养,同时培养液中加入新霉素G418进行筛选培养4 6周,去除培养液,I XPBS漂洗两遍,结晶紫染色后拍照计数
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:Pdk3基因及其表达产物的应用的制作方法肝癌的治疗在过去20年里取得了很大的进展,出现了一些局部非手术治疗方案。例如,经导管动脉内化疗栓塞(TACE),是中晚期肝癌治疗的重要手段,可使90%以上的肝癌患者受益;经皮肝穿刺瘤内无水乙醇治疗(PEI),也是常用的局部化疗方法,对癌直径小于3厘米的肝癌及门静脉癌栓有一定疗效。但是,由于目前肝癌的化疗药物基本沿用其他肿瘤的治疗药物,针对性较差,因此,总体疗效不佳,迫切需要寻找新的作用靶点,研究和开发肝癌特异的新药物,以提高化疗的特异性和有效性。 蛋白激酶是由人类基因组中最大的一类基因所编码的,其作用是通过将磷酸基团转移至底物蛋白上,来调控各种蛋白的活性、信号转导通路及细胞生物学过程。目前已知的原癌基因中,大约有55%编码蛋白激酶,其余的多数编码可激活蛋白质激酶或被激酶磷酸化的特异蛋白。制药公司已认识到了蛋白激酶抑制剂的重要性,正在积极研发新的蛋白激酶抑制剂,用于治疗包括肿瘤在内的各种疾病。丙酮酸盐脱氢酶(TOH)复合物是一种细胞核内编码的线粒体多酶复合物,催化丙酮酸盐完全转化为acetyl-CoA and C0(2),它提供了糖酵解与三羧酸循环之间的关键联系,因此也是负责调控葡萄糖代谢的主要酶之一。PDH的酶活性受到磷酸化/去磷酸化的调控,磷酸化导致PDH的失活。PDK3(丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶3)基因编码的蛋白是三种丙酮酸盐脱氢酶激酶之一,通过El alpha亚基的磷酸化抑制PDH复合物。
本发明要解决的技术问题之一是提供一种TOK3基因及其表达产物在制备治疗肝癌的药物中的应用。本发明要解决的技术问题之二是提供三对TOK3基因的siRNAs,用于制备治疗肝癌的药物。为解决上述技术问题,本发明通过如下技术方案实现在本发明的一个方面,提供了一种TOK3基因及其表达产物在制备治疗肝癌的药物中的应用。所述治疗肝癌的药物包括通过RNA干扰抑制TOK3基因表达的双链核糖核酸(包括该双链核糖核酸的不同修饰状态及不同递送方式)、DNA载体、腺病毒或腺相关病毒载体;能够特异性抑制TOK3基因激酶活性的化合物、多肽或单克隆抗体。在本发明的另一方面,提供了三对用于制备治疗肝癌药物的TOK3基因的siRNAs,其中,第一对siRNA的正义链具有如SEQ ID NO 1所示的序列,反义链具有如SEQ ID NO 2所示的序列;第二对siRNA的正义链具有如SEQ ID NO 3所示的序列,反义链具有如SEQID NO :4所示的序列;第三对siRNA的正义链具有如SEQ ID NO :5所示的序列,反义链具有如SEQ ID NO 6所示的序列。本发明实验证实,通过TOK3基因序列特异性siRNA干扰可以显著抑制肝癌细胞的生长,因此,PDK3基因可作为肝癌治疗药物的靶基因,为肝癌的防治提供新的途径。图I是实施例I的RNAi筛选步骤示意图;图2是实施例I的RNAi筛选数据处理过程图;图3是实施例I中,激酶siRNAs库对四株肝癌细胞H印3B、Huh-7, MHCC-97H、MHCC-97L生长活性影响分布图;图4是实施例I中,通过对四株肝癌细胞H印3B、Huh-7、MHCC-97H、MHCC-97L分别确定5%可信区间和10%分析区间,获得抑制、促进细胞生长的siRNAs及对应的激酶基因 的结果图;图5是实施例I中四株肝癌细胞H印3B、Huh-7、MHCC-97H、MHCC-97L全激酶组范围内RNAi对细胞活性影响的统计图;图6是实施例I的RNAi筛选体系鉴定干扰TOK3基因能够抑制肝癌细胞H印3B、Huh-7、MHCC-97H的生长示意图。实施例3免疫检测I.抗原蛋白获得从美国基因库Genebank中获得人TOK3基因的cDNA序列,通过PCR扩增获得编码框,插入原核生物或真核生物表达载体中,表达TOK3蛋白,并按基因工程表达产物的纯化体系纯化蛋白。2.抗体制备可采用以下几种方法制备抗体(I)细胞融合法用上述制备的TOK3蛋白免疫动物(包括兔子、山羊等),获得脾脏细胞,再与骨髓瘤细胞融合,并按常规单克隆抗体制备技术制备单克 隆抗体。(2)利用噬菌体表面展示库,克隆免疫动物的脾脏IgG可变区并表达成基因工程单克隆抗体。(3)利用纯化的蛋白免疫动物,制备多抗血清。3.检测(I)用制备的抗体(多抗或单抗),用组织化学方法进行肝癌的病理检测,阳性信号为肝癌。(2)取患者血清,用ELISA方法检测,阳性反应为肝癌可疑病人。(3)将TOK3抗体作为蛋白质芯片的探针之一,用于多种肿瘤诊断。实施例4TOK3基因的小干扰核糖核酸(siRNA)针对TOK3基因mRNA序列,设计并体外化学合成三对siRNAs,对应的靶序列分别如下sil-正义链CCGCAUCUCUUUCCGCAUGCUUAUU(SEQ ID NO: I);sil-反义链AAUAAGCAUGCGGAAAGAGAUGCGG(SEQ ID NO 2);si2-正义链AGAUCUGAAACUGUAUUCCAUGGAA(SEQ ID NO 3);si2-反义链UUCCAUGGAAUACA⑶UUCAGAUCU(SEQ ID NO 4);si3-正义链GCCUGAAGCCGAUGAUUGGAGCAAU(SEQ ID NO 5);si3-反义链AUUGCUCCAAUCAUCGGCUUCAGGC(SEQ ID NO 6);另外,设置无关序列作为阴性对照s i RNA :正义链5’-UUCUCCGAACGUGUCACGUdTdT-3’ (SEQ ID NO :7);反义链5’-ACGUGACACGUUCGGAGAAdTdT-3’ (SEQ ID NO :8)。在96孔板中每孔接种3 X IO3个Huh_7,H印3B,MHCC_97H和MHCC-97L细胞(无血清培养液)。待细胞密度达到40%左右时,利用脂质体(LipOfectamine2000)转染试剂,分别将上述3种siRNAs按终浓度50nmol/L转染进Huh_7、H印3B、MHCC_97H和MHCC-97L细胞中,4小时后换成含10%胎牛血清的DMEM。以24小时为I个检测单位,培养7天,每天检测I次该细胞密度。每孔待测细胞液中加IOy L CCK-8,37°C孵育I小时。利用酶标仪在450nm波长下检测其吸光度,以代表细胞存活能力,绘制生长曲线。实验结果表明特异性干扰TOK3表达的siRNA能够抑制肝癌细胞系Huh-7,H印3B,MHCC-97H的生长,肝癌细胞的存活率明显低于对照组的细胞,说明人TOK3基因的表达下调能在一定程度上抑制肝癌细胞生长。


本发明公开了一种PDK3基因及其表达产物的应用,用于制备治疗肝癌的药物。本发明的PDK3基因及其表达产物可作为制备治疗肝癌药物的靶基因,为肝癌的治疗提供新的途径。



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