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一种三角帆蚌幼蚌dna活体取样方法

  • 专利名称
    一种三角帆蚌幼蚌dna活体取样方法
  • 发明者
    李家乐, 白志毅, 罗明, 郭诗照
  • 公开日
    2012年4月25日
  • 申请日期
    2011年12月30日
  • 优先权日
    2011年12月30日
  • 申请人
    上海海洋大学
  • 文档编号
    C12N15/10GK102424824SQ20111045565
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种三角帆蛘幼蛘DNA活体取样方法,其特征在于,包括以下步骤1)幼蛘外套膜组织的剥离选取脱苗后50天的幼蛘20只,分成实验组和对照组,每组各10只,对幼蛘进行标记, 并记录每只幼蛘的体长和体重;用刀片轻轻撬开实验组幼蛘蛘壳2 3mm,沿边缘划取外套膜组织,取样ang,用镊子夹取至离心管中;2)剥离组织基因组DNA的提取a.在上述离心管中加入200μ 1裂解液,55°C水浴消化至澄清,轻轻摇勻数次;b.之后加入200μ1苯酚,轻微翻转混合IOmin后,12000r/min离心20min,用前端剪掉 Icm的粗口枪头吸取上清液至新的离心管;c.重复步骤b,之后加入200μ 1苯酚-氯仿-异丙醇混合液,其中苯酚、氯仿和异丙醇的体积比为25 24 1,轻微翻转混合10min,12000r/min离心20min,吸取上清液至新的离心管;d.之后加入200μ1氯仿-异丙醇混合液,其中氯仿和异丙醇的体积比为M 1,轻微翻转混合lOmin,12000r/min离心20min,吸取上清液至新的离心管;e.之后加入两倍于离心管中溶液体积的无水乙醇,其中无水乙醇的温度为-20°C,然后于-20°C冰箱中静置至少30min,12000r/min离心20min,倒掉溶液;f.在离心管中加入70%乙醇200μ 1,洗涤两次,之后倒掉离心管中的液体,室温晾干;g.待酒精挥发完全后,加入80μ 1无菌水,4°C冰箱中溶解至少4小时;3)提取DNA的检测用0. 8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA片段大小,DNA大分子条带清晰明亮;分光光度计检测DNA的浓度和纯度,DNA的浓度在42 130ng/y 1,DNA含量在3360ng以上,OD260/OD280 值在1.8以上;4)幼蛘培育将取样后的幼蛘放入IL浓度为0. Olmg/L的金霉素消毒液中,浸泡30分钟后与对照组幼蛘均勻洒在底部铺有2cm细泥沙的培育池中,将富含浮游生物的水注入培育池中对幼蛘进行流水培育,并保持水流平稳以减少刺激,直至幼蛘达到稳定生长状态,一个月后,对实验组和对照组幼蛘生长数据进行T检验和SNK检验,结果均显示实验组和对照组幼蛘的生长无显著差异2.根据权利要求1所述的一种三角帆蛘幼蛘DNA活体取样方法,其特征在于,步骤1) 中所述幼蛘的体长为1. 7 2. 1cm,体重为243 391mg3.根据权利要求1所述的一种三角帆蛘幼蛘DNA活体取样方法,其特征在于,步骤a中所述裂解液的成分如下Imol/L Tris-HCL10 μ 1,0. 5mol/L EDTA40 μ 1,10% SDS20 μ 1,10mg/ml Proteinase K2 μ 14.根据权利要求3所述的一种三角帆蛘幼蛘DNA活体取样方法,其特征在于,所述 lmol/L Tris-HCL 的 pH 为 8. 05.根据权利要求1所述的一种三角帆蛘幼蛘DNA活体取样方法,其特征在于,步骤2)中抽提DNA时均采用粗口枪头
  • 技术领域
    本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及一种三角帆蛘幼蛘DNA的取样方法
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    为了使本发明实现的技术手段、创作特征、达成目的与功效易于明白了解,下面结合具体实施例进一步阐述本发明
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:一种三角帆蚌幼蚌dna活体取样方法三角帆蛘是中国特有的淡水育珠母蛘,选育出品质优良的三角帆蛘是当前需要解决的关键问题之一。利用分子生物学手段(如分子标记技术等)能有效对三角帆蛘进行遗传育种和种质改良。提取一定质量的高浓度基因组DNA是进行分子生物学研究的基础和前提,成体三角帆蛘活体提取DNA比较简便,但小规格三角帆蛘幼蛘活体提取DNA操作非常困难,目前均采用处死幼蛘,收集组织,进而提取DNA的方式,但这样会导致大量含有足够遗传信息的优良个体损失,所获得的个体遗传信息在选种上来说已经没有实际意义。因此,亟待建立一种提取三角帆蛘幼蛘活体DNA的方法。三角帆蛘繁殖存在一雌多雄受精的现象,在对亲本的遗传背景缺乏了解的情况下,可以利用幼蛘活体提取DNA技术鉴定幼蛘的遗传多态性及个体间的亲缘关系,进而选留优良个体单独培育,可以节省大量财力物力;利用幼蛘活体提取DNA技术可以进行目标经济性状的早期预选、基因筛选、养殖状况监测等多项研究工作。
本发明所要解决的技术问题在于,克服现有技术中的不足,提供一种获取三角帆蛘幼蛘活体微量组织提取DNA的方法。为了解决上述问题本发明的技术方案是这样的一种三角帆蛘幼蛘DNA活体取样方法,包括以下步骤1)幼蛘外套膜组织的剥离选取脱苗后50天的幼蛘20只,分成实验组和对照组,每组各10只,对幼蛘进行标记,并记录每只幼蛘的体长和体重;用刀片轻轻撬开实验组幼蛘蛘壳2 3mm,沿边缘划取外套膜组织,取样ang,用镊子夹取至离心管中;2)剥离组织基因组DNA的提取a.在上述离心管中加入200μ 1裂解液,55°C水浴消化至澄清,轻轻摇勻数次;b.之后加入200μ 1苯酚,轻微翻转混合IOmin后,12000r/min离心20min,用前端剪掉Icm的粗口枪头吸取上清液至新的离心管;c.重复步骤b,之后加入200 μ 1苯酚-氯仿-异丙醇混合液,其中苯酚、氯仿和异丙醇的体积比为25 24 1,轻微翻转混合10min,12000r/min离心20min,吸取上清液至新的离心管;d.之后加入200μ1氯仿-异丙醇混合液,其中氯仿和异丙醇的体积比为M 1, 轻微翻转混合lOmin,12000r/min离心20min,吸取上清液至新的离心管;e.之后加入两倍于离心管中溶液体积的无水乙醇,其中无水乙醇的温度为-20°C,然后于_20°C冰箱中静置至少30min,12000r/min离心20min,倒掉溶液;f.在离心管中加入70%乙醇200μ 1,洗涤两次,之后倒掉离心管中的液体,室温晾干;g.待酒精挥发完全后,加入80μ 1无菌水,4°C冰箱中溶解至少4小时;3)提取DNA的检测用0. 8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA片段大小,DNA大分子条带清晰明亮;分光光度计检测DNA的浓度和纯度,DNA的浓度在42 130ng/ μ 1, DNA含量在3360ng以上,OD260/ OD280值在1. 8以上;4)幼蛘培育将取样后的幼蛘放入IL浓度为0. 01mg/L的金霉素消毒液中,浸泡30分钟后与对照组幼蛘均勻洒在底部铺有2cm细泥沙的培育池中,将富含浮游生物的水注入培育池中对幼蛘进行流水培育,并保持水流平稳以减少刺激,直至幼蛘达到稳定生长状态,一个月后, 对实验组和对照组幼蛘生长数据进行T检验和SNK检验,结果均显示实验组和对照组幼蛘的生长无显著差异。步骤1)中所述幼蛘的体长为1. 7 2. Icm,体重M3 391mg。步骤a中所述裂解液的成分如下Imol/L Tris-HCL10 μ 1,0. 5mol/L EDTA40 μ 1,10% SDS20 μ 1,10mg/ml ProteinaseK2 μ 1。所述lmol/L Tris-HCL 的 pH 为 8. 0。步骤2)中抽提DNA时均采用粗口枪头。有益效果如下1>现有技术中提取DNA的组织材料用量一般为20 50mg,本发明中用量为2mg 左右,用量极少;2>提取的DNA质量好,能满足生物学研究需求,且剥离微量组织对幼蛘的生长无影响;3>研究对象规格小,有利于科研工作提前开展,可以缩短研究周期;4>研究对象无需处死,有利于收集优良个体;5>早期选育目标经济性状,鉴定小规格幼蛘的遗传多态性及个体间的亲缘关系, 选留优良个体,提高育种效率。下面结合附图和来详细说明本发明;图1为本发明提取DNA的电泳图。
本实施例中三角帆蛘幼蛘DNA活体取样方法,包括以下步骤1>幼蛘外套膜组织的剥离选取脱苗后50天左右,体长为1. 7 2. Icm,体重为243 391mg的幼蛘20只,分为实验组和对照组,每组各10只,用油性记号笔对幼蛘一一对应标记,用游标卡尺测量记录体长,并测量记录体重;用宽度为5mm左右且有一定韧度的刀片轻轻撬开实验组幼蛘蛘壳2 3mm,沿着边缘划割外套膜组织2mg左右,将割离的外套膜组织划出,用镊子夹取至离心管中用于提取基因组DNA。2>采用酚氯仿法提取上述剥离组织的基因组DNA a.加入 200 μ 1 裂解液(lmol/L Tris_HCL,pH 8.0,10 μ 1 ;0. 5mol/L EDTA,40y 1 ; 10% SDS,20y 1 ;lOmg/ml Proteinase K,2 μ 1),55°C水浴消化至澄清,轻轻摇勻数次;b.加入200 μ 1苯酚,轻微翻转混合lOmin,12000r/min离心20min,用前端剪掉 Icm左右的粗口枪头吸取上清液至新的离心管;C.重复步骤b,之后加入200 μ 1苯酚-氯仿-异丙醇(苯酚-氯仿-异丙醇的体积比为25 24 1)混合液,轻微翻转混合10min,12000r/min离心20min,吸取上清液至新的离心管;d.加入200 μ 1氯仿-异丙醇(氯仿-异丙醇的体积比为M 1)混合液,轻微翻转混合lOmin,12000r/min离心20min,吸取上清液至新的离心管;e.加入两倍于离心管中溶液体积的无水乙醇(_20°C ),_20°C冰箱中静置至少 30min, 12000r/min 离心 20min,倒掉溶液;f.用70 %乙醇洗涤两次,每次用200 μ 1,倒掉溶液,室温晾干;g.待酒精挥发完全后加入80 μ 1无菌水,4°C冰箱中溶解至少4小时;h.如图1,用0. 8%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA片段大小,得到的DNA大分子条带清晰明亮;如表1,分光光度计检测DNA浓度和纯度,得到其浓度在42 130ng/y 1,DNA含量在3360ng以上,0D26Q/0D28Q值在1. 8以上,结果表明所提取的基因组DNA总量能满足亲子鉴定研究至少10对多态微卫星分子标记的需求。 表1分光光度计检测DNA结果


本发明公开了一种三角帆蚌幼蚌DNA活体取样方法,这种方法的研究对象规格小,研究对象无需处死,可早期选育目标经济性状,提高育种效率,且提取DNA的组织材料的用量极少,提取的DNA质量好,能满足生物学研究需求;其技术要点是这种三角帆蚌幼蚌DNA活体取样方法包括以下步骤1)幼蚌外套膜组织的剥离;2)剥离组织基因组DNA的提取;3)提取DNA的检测;4)幼蚌培育。



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