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一种适用于dna扩增技术的中药材基因组dna提取方法

  • 专利名称
    一种适用于dna扩增技术的中药材基因组dna提取方法
  • 发明者
    黄璐琦, 袁媛, 蒋超
  • 公开日
    2014年3月12日
  • 申请日期
    2012年8月21日
  • 优先权日
    2012年8月21日
  • 申请人
    中国中医科学院中药研究所
  • 文档编号
    C12N15/10GK103627699SQ201210296810
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种快速提取中药材基因组DNA的方法,其特征包括以下步骤 (I)取供试品中药材20-50mg,置于粉碎机中研磨至可过40目筛,放入2.0mL的微量离心管内;(2)加入200-400 μ L、0.25-0.6mol/L的氢氧化钠溶液,混匀2-3min ;(3)加入1600 μ L> 100mmol/L 的 Tris-HCl 溶液(pH = 8.0),温和混匀;(4) 12000rpm 下离心 2min ;(5)取50 μ L上清至一新的1.5mL离心管,加入450 μ L、100mmol/L的Tris-HCl溶液(pH =8.0)取I μ L上清,加入PCR反应体系内进行PCR扩增2.如权利要求书I所述中药材基因组DNA快速提取方法,其中所述的供试品中药材包括动物类中药材和植物类中药材3.如权利要求书I所述中药材基因组DNA快速提取方法,其中所述的供试品中药材包括无霉变的新鲜植物药材,干性粉末,愈伤组织,饮片及炮制后的动植物药材4.如权利要求书I所述中药材基因组DNA快速提取方法,其中所述的氢氧化钠溶液浓度为 0.25-0.6mol/L, Tris-HCl 溶液的浓度为 100mmol/L,pH 为 8.0
  • 技术领域
    [0001]本发明涉及一种快速提取中药材基因组DNA的方法,属于分子生物学
  • 专利摘要
    本发明公开了一种适用于扩增技术的基因组DNA快速提取方法,仅采用氢氧化钠溶液和Tris-HCl溶液,极为简单经济。本发明采用的提取方法,15min就可以完成样品DNA提取的全过程,该法通用性强,对于植物药、动物药的饮片及其炮制品均具有良好的提取效果。所提取的DNA质量满足了下游PCR扩增的需要,解决了目前中药材普通PCR反应模板DNA提取时间长、工作量大的问题,适用于科研和生产过程中快速提取DNA的要求。
  • 发明内容
  • 专利说明
    —种适用于DNA扩增技术的中药材基因组DNA提取方法
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
一种适用于dna扩增技术的中药材基因组dna提取方法【技术领域】。[0002]1985年问世的PCR反应(聚合酶链式反应)是一种体外核酸扩增技术,因其具有敏感性高、特异性强、操作简便、重复性好,易于自动化的特点,已被广泛用于生命科学、医学、药学的各个领域,成为医药研究不可或缺的手段。除此之外,等温扩增技术包括Q复制酶反应(QBRA)、链置换扩增技术(SDA)、切口酶恒温扩增技术(NEMA)、转录依赖的扩增技术(TASTMA、3SR、NASBA)、解旋酶扩增技术(HAD)、滚环扩增技术(RCA)、环介导等温扩增技术(LAMP)、单引物等温扩增技术(SPIA)等简化了对仪器和实验室条件的要求、缩短了检测时间,在中药鉴定领域具有很好的发展前景。(Walker GT, Fraiser MS, Schram JL, etal.Strand displacement amplification 「is othermal, in vitro DNA amplificationtechnique.Nucleic Acids Research,1992,20 (7):1691-1696 ;Notomi T, Okayama H,Masubuchi H,ct al.Loop「mediated isothermal amplification of DNA.Nucleic AcidsResearch,2000,28(12):63.)[0003]DNA扩增技术的第一步是模板DNA的制备,即样品中DNA的提取。长期以来DNA的提取一直是PCR检测过程中最耗时,繁琐的步骤,严重影响了检测的速度。对于中药研究来说,中药材品种繁多,各品种差异大,基因组DNA提取的工作量非常巨大。传统的CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法或SDS (十二烷基硫酸钠)法通过使用CTAB或SDS裂解细胞,酚/氯仿抽提蛋白质,异丙醇沉淀DNA,乙醇洗涤,适用于大多数中药材基因组DNA的提取。然而,CTAB法或SDS法流程繁琐、操作复杂,一般需要5小时以上才能提取出DNA。并且操作过程中使用了大量的酚/氯仿、β_巯基乙醇、异丙醇的有机溶剂,有损于操作人员的身体健康。
[0004]本发明的目的是提供一种可大规模、简单快速的中药材基因组DNA提取方法,用于DNA扩增技术鉴别中药材及研究遗传多样性。本发明通过以下技术方案实现:[0005](I)取供试品中药材20-50mg,置于粉碎机中研磨至可过40目筛,放入2.0mL的微量离心管内。[0006](2)加入 200-400 μ L、0.25-0.6mol/L 的氢氧化钠溶液,混匀 2_3min。
[0007](3)加入 1600 μ LU00mmol/L 的 Tris-HCl 溶液(pH = 8.0),温和混匀。
[0008](4) 12000rpm 下离心 2min。
[0009](5)取 50 μ L 上清至一新的 1.5mL 离心管,加入 450 μ L、100mmol/L 的 Tris-HCl 溶液(pH = 8.0)。取I μ L上清,加入PCR反应体系内进行PCR扩增。
[0010]本发明的有益效果主要体现在:(I)本方法具有简单、快速、节约试剂及耗材、污染小等特点,可用于规模化提取。(2)本方法通用性强,对于植物药、动物药的饮片及炮制品均具有良好的提取效果。[0011]为了能更清晰地说明本发明的提取方法,下面结合具体实施案例,对本发明的提取方法进行进一步阐述。



[0012]图1:植物类中药材PsbA-trnH片段PCR扩增电泳图
[0013]1,金银花;2,红花;3,辛夷;4,藿香;5,人参;6,苍耳子;7,枸杞子;8,车前子;9,葶苈子;10,菟丝子;11,石楠叶;12,紫苏叶;13,苦参;14,葛根;15,当归;16,预知子;17,白芍;18,厚朴(发汗);19,竹叶;20,黄芩;21,丹皮;22,龙胆;23,大黄(酒制);24,吴茱萸(甘草制);25,大血藤;26,黄连;27,鸭趾草;28,草乌(煮制);29,苦参;30,山药(蒸制);31,槐米;33,草豆蘧;34,甘草(炙);35,姜黄;36,决明子。
[0014]图2:动物类中药材COI片段PCR扩增电泳图
[0015]M,DL2000DNA marker ;N,阴性对照;1,乌梢蛇;2,金钱白花蛇;3,土鳖虫;4,地龙;
[0016]图3:乌梢蛇特异性鉴别引物PCR扩增电泳图
[0017]M,DL2000DNA marker ;N,阴性对照;1,乌梢蛇;2,金钱白花蛇;3,地龙;4,全蝎;5,全蝎。
[0018]具体实施例1
[0019]1.材料和方法
[0020]1.1 材料
[0021]所用材料如表1所示,包括:
[0022]表1中药材相关样品基本情况
[0023]

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