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乳腺癌分子标志物miR-139-5p制作方法

  • 专利名称
    乳腺癌分子标志物miR-139-5p制作方法
  • 发明者
    李同恩, 李启靖, 栗世铀
  • 公开日
    2012年9月19日
  • 申请日期
    2012年5月16日
  • 优先权日
    2012年5月16日
  • 申请人
    北京旷博生物技术有限公司
  • 文档编号
    C12N15/113GK102676523SQ201210153220
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种乳腺癌分子标志物miR-139-5p,其序列如SEQ ID NO 1所示2.权利要求I所述乳腺癌分子标志物miR-139-5p在制备诊断乳腺癌的诊断试剂中的用途3.权利要求2所述用途,其中,所述诊断试剂通过检测被试者血清中miR-139-5p的含量,并与正常水平相比较来诊断乳腺癌4.权利要求3所述用途,其中,使用定量PCR的方法来检测被试者血清中miR-139-5p含量5.一种诊断乳腺癌的诊断试剂盒,其包括 (1)血清总RNA提取试剂,(2)RNAjJP PolyA 试剂,(3)RT-PCR 试剂, (4)定量PCR试剂; 其中,定量PCR试剂中包括权利要求I所述乳腺癌分子标志物miR-139-5p的特异性正向引物6.权利要求5所述诊断试剂盒,其中,所述血清总RNA提取试剂中包括序列为SEQIDNO 2 的 External Control-17.权利要求5所述诊断试剂盒,其中,所述RNA加polyA试剂中包括序列为SEQID NO3 的 External Control-28.权利要求5所述诊断试剂盒,其中,所述RT-PCR试剂中包括序列为SEQID NO 4的RT-Primer09.权利要求5所述诊断试剂盒,其中,所述定量PCR试剂中包括序列分别为SEQID NO5和6的通用反向引物UPM-short和UPM-long10.权利要求5所述诊断试剂盒,其中,所述乳腺癌分子标志物miR-139-5p的特异性正向引物的序列如SEQ ID NO 7所示
  • 技术领域
    本发明涉及肿瘤诊断领域,具体来说涉及ー种乳腺癌分子标志物miR-139-5p,其可应用于乳腺癌高危人群的筛选、乳腺癌的鉴定、乳腺癌治疗状况的监测和乳腺癌预后的监测等领域
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    I.血清中总RNA的提取抽取5名乳腺癌患者术前及术后7天各2ml血液,同时抽取5名正常人血液各2ml作为正常对照,凝血后进行离心,最后取上层血清Iml置于I. 5ml的RNase/DNase-free离心管中使用RNA提取试剂盒(北京旷博生物技术有限公司)自血清中提取总RNA,每250 μ I 血清中加入 1μ I (20ηΜ)序列为 5’ -CAACCTCCTAGAAAGA-3’ (SEQ ID NO 2)的External Control-I (上海生エ生物工程技术有限公司合成)来监控血清中RNA的提取质量提取的总RNA使用Thermo NanoDrop 2000c测定浓度2.三步法定量检测血清中的miRNA(I)加 polyA 尾
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:乳腺癌分子标志物miR-139-5p的制作方法microRNA (miRNA)是近年来的研究热点,它是ー种广泛存在于真核生物中的单链小分子RNA,不具编码功能,但它能够结合于基因序列的侧翼区域阻遏或抑制靶mRNA的翻译,具有高度的保守性、时序性和组织特异性。2008年Mitchell等首先发现许多miRNA稳定存在于血浆中,其中miR-141的水平可作为前列腺癌诊断标志物。随后的研究又发现了结肠癌诊断标志物miR-92a和肝损伤监控标志物miR-122。乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,近50年来发病率在全球呈上升趋势,其发病率占全身各种恶性肿瘤的7-10%,且发病人群呈年轻化趋势。目前,乳腺癌的临床诊断方式主要有以下几种乳腺钥靶摄片、红外乳腺扫描、活组织病理检查、雌激素和孕激素受体測定及超声显像。乳腺钥靶摄片具有简单、方便、无创伤及费用低等特点,是乳腺癌检查的首选方法之一,它通过显示肿块的大小、数目、位置、密度、边缘、形态、有无钙化以及钙化的形态、大小、数目、分步以及周围的晕环、皮肤改变等提供定位及定性征象并判断病变的性质;其局限性是(1)当患者的乳腺腺体丰富时与病变重叠,不能显示病变的全貌,甚至出现假阴性,(2)对于接近胸壁和致密性乳腺的小癌灶容易漏诊,(3)有时不能提供明确的定性诊断。红外乳腺扫描操作简便、直观、无损伤,与钥靶摄片有互补的作用,能直接显示乳腺血管的走行分步及管径改变,但因其不能显示肿瘤的内部结构及周围组织所以诊断符合率很低,对乳腺上部及近胸壁的癌灶易于漏诊。活组织病理检查因其创伤性、复杂性不能作为初筛的手段,但是它是乳腺癌确诊的金标准,一般与影像学技术连用,在对患者进行治疗前均应获得病理学诊断依据。人乳腺癌组织中,有60 70%的组织存在雌激素受体(ER)和/或孕激素受体(PR),其存在状况与诊断、治疗及判断预后有夫,卫生部发布的乳腺癌诊断标准中所要求的乳腺癌病理报告至少应包括ER、PR和HER-2 (人类表皮生长因子受体_2);其局限性较大主要表现在(1)技术和设备要求高,标本量大,故对测定非切除标本或肿块较小的早期乳腺癌难以满足需要,(2)受体对温热极不稳定,标本必需新鮮,储存运输不便,(3)肿瘤组织中受体分布不均匀,边缘部位含量较中央部位高,故需混合取材。超声成像对一些缺乏典型征象的实性良恶性肿块有较高的误诊率,且不能发现5_以下的肿块。近年来的研究表明,乳腺癌和miRNA密切相关,它们可能參与肿瘤的生成,所以对肿瘤的治疗也可能有相应的作用。与乳腺癌相关的miRNA种类较多且作用不一,已有研究表明在乳腺癌患者中上调的miRNA包括miR-26a,miR-29b, miR-375, miR-92, mir-183,miR-197 等,下调的 miRNA 包括 miR-145,miR-497,miR-339-5p,miR-22,miR-125b 等。虽然已在该领域进行了ー些研究,但是现有的miRNA标志物的准确性、灵敏性方面均有不足,在临床和研究中仍然存在寻找更加准确和灵敏的乳腺癌miRNA标志物的需求。
本发明提供了一种新的乳腺癌相关的miRNA作为乳腺癌的分子标志物,该miRNA为 miR-139-5p,其序列为 5’ -UCUACAGUGCACGU⑶CUCCAG-3’ (SEQ IDNO :1)。发明人发现,miR-139_5p在乳腺癌患者血清中的含量相比在正常人血清中的含量升高,而在患者接受手术后,其血清中的miR-139-5p含量回落到正常水平,由此可见,増加的miR-139-5p与肿瘤的存在密切相关。在上述发现的基础上,本发明提供了 miR-139_5p在制备诊断乳腺癌的诊断试剂中的用途。具体地,所述诊断试剂通过检测被试者血清中miR-139_5p的含量,并与正常水平相比较来诊断乳腺癌。在ー个特定的实施方案中,使用定量PCR的方法来检测被试者血清中 miR-139-5p 含量。 本发明还提供了一种诊断乳腺癌的诊断试剂盒,其包括(I)血清总RNA提取试剂,(2) RNA 加 polyA 试剂,(3) RT-PCR 试剂,(4)定量 PCR 试剂。其中,定量PCR试剂中包括乳腺癌分子标志物miR-139_5p的特异性正向引物,优选地,其序列为 5’ -TCTACAGTGCACGTGTCTC-3’ (SEQ ID NO :7)。在ー个特定的实施方案中,所述血清总RNA提取试剂中包括序列为5,-CAACCTCCTAGAAAGA-3’ (SEQ ID NO :2)的 External Control-1 ;所述 RNA 加 polyA 试剂中包括序列为 5’-TGAGCAACGCGAACAA-3’ (SEQ ID NO :3)的 External Control-2 ;所述RT-PCR 试剂中包括序列为 5’ -CAGTGGTATCAACGCACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVN-3’ (SEQ ID NO :4)的RT-Primer (其中,V为A或C或G,N为A或T或C或G);所述定量PCR 试剂中包括序列分别为 5,-CTCACACGACTCACGACAC-3,(SEQ IDNO :5)和 5,-CTCACACGACTCACGACACCAGTGGTATCAACGCACTC-3’(SEQ IDNO :6)的通用反向引物UPM-short和UPM-long。使用本发明的乳腺癌分子标志物miR-139_5p诊断乳腺癌具有操作简单,取材方便,安全无创伤,高特异性,高灵敏性以及易于大量筛查的特点。i.在无RNA酶的PCR管(Axygen公司,200 μ I)中配制加polyA尾的反应液,体系为 20 μ I。姆 20 μ I 体系中加入 I μ I (20ηΜ)序列为 5’ -TGAGCAACGCGAACAA-3’ (SEQ IDNO 3)的External Control-2 (上海生エ生物工程技术有限公司合成)来监控miRNA的加尾及反转录质量。

本发明提供了一种乳腺癌分子标志物miR-139-5p及其在制备诊断乳腺癌的诊断试剂中的用途。miR-139-5p在乳腺癌患者血清中的含量比在正常人血清中的含量升高,而在患者接受手术后,其血清中的miR-139-5p含量回落到正常水平。本发明还提供了一种诊断乳腺癌的诊断试剂盒。使用本发明的乳腺癌分子标志物miR-139-5p诊断乳腺癌具有操作简单,取材方便,安全无创伤,高特异性,高灵敏性以及易于大量筛查的特点。



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