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一种通用多重pcr方法

  • 专利名称
    一种通用多重pcr方法
  • 发明者
    张春庆, 温大兴
  • 公开日
    2012年11月14日
  • 申请日期
    2012年6月13日
  • 优先权日
    2012年6月13日
  • 申请人
    山东农业大学
  • 文档编号
    C12Q1/68GK102776172SQ20121019335
  • 关键字
  • 权利要求
    1.ー种通用多重PCR方法,其特征在于先在每对特异性上游引物和下游引物的5’端都分别加上通用 PCR接头 Universal adapter-F 5’-CTCGTAGACTGCGTACCA-3’和 universaladapter-R 5’ -TACTCAGGACTCATCGTC-3’ ;再采用两段循环模式PCR扩增程序进行PCR扩増,PCR扩增程序为①预变性94°C,5min 第一段循环为“逐一退火循环”,循环数3 变性94°C,40s ;按照未加通用接头前的多对引物的退火温度从高到低的顺序逐一分别退火,每个退火温度的退火时间为20s ;延伸72°C,30s 第二段循环循环数28-32 ;变性94°C,40s ;退火和延伸过程合并70°C,50s ;④终延伸72°C, IOmin0
  • 技术领域
    本发明涉及ー种通用多重PCR方法,具体涉及ー种多重PCR技术的引物设计方法和相应的PCR扩增 程序的建立,尤其是能提高多重PCR的通用性ニ背景技术多重PCR(Multiplex PCR)是在普通PCR的基础上加以改进的,在ー个PCR反应体系中加入多对特异性引物,针对多个DNA模板或同一个模板的不同区域扩增多个目的片段的PCR技术,这ー概念由Chambercian J. S.等(1988)率先提出多重PCR具有节省时间、降低成本、提高效率等优点,被提出以后便迅速发展,现已应用于生命科学的多个领域(如多态性分析、突变分析、定量分析和物种鉴定等),成为ー项重要的应用技木传统的多重PCR也具有诸多不足,如复杂的扩增体系、扩增效率低、不同的模板扩增效率不一致、通用性差等由于在多重PCR反应体系中加入了多对引物,因此增加了引物设计的难度,而且使不同引物的最佳退火温度、延伸时间和循环次数等诸多因素的协调变得困难传统的多重PCR极易导致非特异性扩增反应的发生,从而导致多重PCR的通用性受到影响多重PCR的引物设计是ー个关键环节,如果能在引物设计这一关键环节降低非特异性扩增反应的发生,那么就有可能显著提高多重PCR的通用性为了突破多重PCR的通用性差这个瓶颈,国内外很多研究者加入了提高多重PCR的通用性研究的行列,并取得了ー些成绩近年来有一些提高多重PCR的通用性的研究报道,部分方法有所改善,但有待进ー步提高
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  • 法律状态
专利名称:一种通用多重pcr方法
为了提高多重PCR的通用性,本发明提供了ー种通用多重PCR方法,该方法不仅能一次扩增多个目的片段,而且能显著降低非特异性扩增。本发明解决其技术问题所采用的技术方案是首先,在筛选或设计好的每对特异性上游引物和下游引物的5’端都分别加上通用PCR接头Universal adapter-F (5’-CTCGTAGACTGCGTACCA-3,),(其序列如 SEQ ID NO : I 所示)和 universal adapter-R (5’-TACTCAGGACTCATCGTC-3’)(SEQ ID NO :2所示),引物加上接头后命名为通用PCR接头引物;然后采用两段循环模式PCR扩增程序进行PCR扩增,该PCR扩增程序为①预变性(94°C,5min)。②第一段循环(循环数3)命名为“逐一退火循环”变性(94°C,40s);按照未加通用接头前的多对引物的退火温度从高到低的顺序逐一分别退火(未加通用接头前的多对引物的退火温度应根据Tm值进行优化;在设定退火温度时,退火温度相近的可以合并为ー个温度),每个退火温度的退火时间为20s ;延伸(72°C,30s)。③第二段循环(循环数28-32,通常为30个循环)变性(94°C,40s);将退火和延伸过程合并(70°C,50s)。④终延伸(72°C,lOmin)。详细的通用多重PCR扩增程序见表I。表I通用多重PCR程序(两段循环模式)本发明涉及一种通用多重PCR方法,是通过增加通用接头序列,使引物间退火温度的差异变小,且增加接头后的引物的退火温度(70℃左右)与延伸温度相近,可以合并退火和延伸阶段,缩短PCR时间;并根据引物退火温度从高到低的逐一退火循环,利用两段循环模式提高PCR产物的特异性和产量。本发明能显著提高多重PCR的通用性,可应用于多个领域,如种子纯度鉴定、品种真实性鉴定、多态性分析、突变分析、定量分析和物种鉴定等。
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