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一种人乳头瘤病毒(hpv)的分型定量检测方法及试剂盒制作方法

  • 专利名称
    一种人乳头瘤病毒(hpv)的分型定量检测方法及试剂盒制作方法
  • 发明者
    吴勇, 孙婷婷
  • 公开日
    2013年3月27日
  • 申请日期
    2012年6月21日
  • 优先权日
    2012年6月21日
  • 申请人
    宁波海尔施基因科技有限公司
  • 文档编号
    C12Q1/68GK102994647SQ20121020656
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种人乳头瘤病毒(HPV)的分型定量检测方法,包括如下步骤 (1)收集宫颈样品; (2)样品DNA提取; (3)以提取的DNA样品为模板进行PCR反应; (4)以毛细电泳的方法分离样品2.根据权利要求1所述的检测方法,所述步骤(2)包括如下子步骤 1)取500μ L细胞保存液于1. 5mL EP管中,13000g离心5分钟,去掉上清液,底部为宫颈脱落细胞; 2)向含有宫颈脱落细胞的EP管中加入500μ L裂解液,裂解10分钟; 3)向裂解液中加入100μ L磁珠吸附游离的DNA ; 4)用清洗液将磁珠清洗两次; 5)100 μ L洗脱液洗脱DNA3.根据权利要求1所述的检测方法,所述步骤(3)包括按比例在样品板上加入试剂和样品、以及混匀后按一定温度进行热循环反应的子步骤4.根据权利要求3所述的检测方法,所述步骤(3)的子步骤中的热循环温度分别为94、60、70、45.根据权利要求1所述的检测方法,所述步骤(4)包括制备GeXP遗传分析仪样品、准备分离液、毛细电泳分离样品、结果分析的步骤6.一种用于前述权利要求中的任一项所述的方法的试剂盒,包括以下试剂引物管、溶液X、PCR缓冲剂、25mM氯化镁、聚合酶以及阳性对照
  • 技术领域
    本发明涉及一种检测方法,尤其是一种灵敏度高、重复性好、准确性强、灵活性强、成本低的人乳头瘤病毒(HPV)的分型定量检测方法及试剂盒
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    下面根据实施例对本发明作进一步详细说明本发明创立了一种一次性检测25种HPV亚型,包括6种低危型6、11、42、43、44、81和 19 种高危型 HPV 亚型 16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73、82、83
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:一种人乳头瘤病毒(hpv)的分型定量检测方法及试剂盒的制作方法人乳头瘤病毒(Human Papillomavirus,简称HPV)是一种嗜上皮性病毒,有高度的特异性。根据致病力强弱,HPV被分为高危型和低危型两种,“是否能致癌”是危险度大小的主要标志。全世界每年宫颈癌的新发病例大约有500,000,是除乳腺癌之外威胁女性生命健康的第二大恶性肿瘤。HPV和宫颈癌的病因学关系已经明确,从HPV感染到宫颈癌发生需要较长时间,在此期间通过检测可以了解是否感染HPV,早发现早治疗,从而有效预防宫颈 癌的发生。目前主要的技术方法如下1.原位杂交优点是特异性好;缺点是操作繁琐费时耗力、需要大量较纯的DNA。2. DNA直接捕捉法优点是有大量的数据支持该技术的应用,能检测高危型别;缺点是灵敏度低于PCR ;不能确定具体的HPV亚型。3.亚型特异性PCR :优点是特异性较好;缺点是劳动强度大。4.通用引物PCR:优点是灵敏度高,一次可以扩增多种亚型;缺点是不能区分确定具体HPV的亚型。5. PCR产物直接测序优点是在确定目前尚未知道的HPV亚型感染以及突变研究时尤其有用;缺点是不是十分灵敏,特别是对HPV混合感染的临床样本更是如此,不宜作为体外诊断方法。6. PCR-酶联免疫分析法优点是灵敏度高;缺点是样本消耗大。7. PCR-固相反向杂交法优点是效率高、一次实验可分出多个HPV亚型;缺点是重复性较差。8.荧光定量PCR:优点是灵敏度高、操作方便、耗时短;缺点是通量少、一次只能检测1-2个亚型、且不能确切分型。9.优点是成本相对较低,操作简单;缺点是可以观察到细胞形态的变化,但不能确定发生细胞形态变化的病因;取样的部位决定检测的结果。综上,目前的人乳头瘤病毒(HPV)的主要检测方法存在操作繁琐费时耗力、灵敏度低、劳动强度大、样本消耗大、重复性较差、通量少的缺点。
本发明的目的是提供一种灵敏度高、重复性好、准确性强、灵活性强、成本低的人乳头瘤病毒(HPV)的分型定量检测方法。本发明采用如下技术方案本发明的一个方面涉及一种人乳头瘤病毒(HPV)的分型定量检测方法,包括如下步骤⑴收集宫颈样品;⑵样品DNA提取;(3)以提取的DNA样品为模板进行PCR反应;(4)以毛细电泳的方法分离样品。优选地,所述步骤(2)包括如下子步骤I)取500 μ L细胞保存液于1. 5mL EP管中,13000g离心5分钟,去掉上清液,底部为宫颈脱落细胞;2)向含有宫颈脱落细胞的EP管中加入500 μ L裂解液,裂解10分钟;3)向裂解液中加入100 μ L磁珠吸附游离的DNA ;4)用清洗液将磁珠清洗两次;5) 100 μ L 洗脱液洗脱 DNA。优选地,所述步骤(3)包括按比例在样品板上加入试剂和样品、以及混匀后按一定温度进行热循环反应的子步骤。优选地,所述步骤⑶的子步骤中的热循环温度分别为94°C、60°C、70°C、4°C。优选地,所述步骤(4)包括制备GeXP遗传分析仪样品、准备分离液、毛细电泳分离样品、结果分析的步骤。 本发明的另一方面涉及一种用于上述方法的试剂盒,包括以下试剂引物管、溶液X、PCR缓冲剂、25mM氯化镁、聚合酶以及阳性对照。本发明的有益效果为1.灵敏度高、重复性好采用激光诱导荧光-PMT,具有超高灵敏度。2.准确性强=GeXP采用毛细管电泳对PCR产物进行分离检测,可将非特异性扩增产物、引物二聚体和特异性扩增产物分离,最大程度降低假阳性。3.高通量本系统采用双(96孔)板、自动加样和样品追踪技术,实现单个反应检测30-40个位点,可同时做192个反应(如192个患者样品,每个样品检测19种呼吸道病毒,22个位点),一天出结果;对于交叉感染患者,本方法可一次性给出准确报告,避免漏检。4.精确定量可精确定量病原体基因拷贝数。5.灵活性强可随时根据需求增加或删减HPV亚型。6.成本低利于大规模推广。的分型定量检测方案,具体亚型见表I。本发明的25种HPV亚型的特异性引物是针对各亚型基因组上的致癌基因E6/E7设计的,再通过多重PCR和毛细电泳的方法,根据扩增片段长度的不同将各亚型分辨出来。建立了可靠的样品质量及反应过程的对照(表I)a)人DNA完整性的对照内参β -globin :确保在检验过程中对样品质量的判断,避免假阴性。b)正常反应对照内参pcDNA3.1 (+):监控PCR反应效率,避免假阴性。2.通过人为加入反应内参pcDNA3. 1(+)对HPV亚型的拷贝数进行定量。3. 25种HPV分型检测的引物序列(见表2)。表1.检测的HPV亚型和反应参照

本发明公开了一种人乳头瘤病毒(HPV)的分型定量检测方法,包括如下步骤(1)收集宫颈样品;(2)样品DNA提取;(3)以提取的DNA样品为模板进行PCR反应;(4)以毛细电泳的方法分离样品。本发明具有灵敏度高、重复性好、准确性强、灵活性强、成本低的优点。



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