专利名称:Apoe基因检测试剂盒及扩增方法和检测方法载脂蛋白E(apolipoproteinE, apoE)是血衆载脂蛋白一个重要组成部分,是1973年首先在正常人的极低密度脂蛋白(VLDL)中发现的,由299个氨基酸组成的单一多肽链,相对分子量为34kD的糖蛋白。人类apoE主要存在于VLDL、LDL、CM和CM残骸(Chy1micronremm-ants)中,也存在于β -VLDL和HDL的亚类HDL1和HDLc中。它主要在肝脏合成,约占血浆apoE的2/3-3/4。ApoE是血浆中重要的载脂蛋白之一,对血脂代谢起重要的调节作用,近年来研究发现,APOE基因多态与冠心病、老年性痴呆(Alzheimer’ s, AD)及老化等疾病有关。Apo E是一个多态性蛋白,有三个常见的异构体,即E2、E3和E4,其基因APOE上存在 2 个 SNP 位点:Cysl 12Arg(rs429358)和 Argl58Cys (rs7412),野生型基因为 Cysll2、Argl58,表达为E3蛋白;E4蛋白为rs429358突变,即Argl 12 ;E2蛋白为rs7412突变,即Cysl58。ApoE的主要生理功能是通过与LDL受体结合并参与LDL代谢过程,APOE基因的变异可影响LDL受体结合活性而影响脂质代谢,进而影响疾病的发生。
APOE基因上两个中国人常见SNP直接影响APOE酶的活性,影响多疾病的发生。本发明提供一种利用多重PCR结合分子开关技术对APOE基因进行基因检测的试剂盒及其多重PCR扩增方法和检测 方法。本发明采用的技术方案:一种APOE基因检测试剂盒,所述试剂盒包括检测基因APOE rs429358位点和rs7412位点的引物及内参引物。所述试剂盒包括检测APOE基因rs429358位点的两个正向引物、APOE基因rs7412位点的两个正向引物、APOE基因内参上游引物及一个反向共用引物。所述检测APOE基因rs429358位点的引物碱基序列如下所示:正向野生型引物:TGGGCGCGGACATGGAGGACGTGT正向突变型引物:TGGGCGCGGACATGGAGGACGTGC所述检测APOE基因rs7412位点的引物碱基序列如下所示:正向野生型引物:TCCGCGATGCCGATGACCTGCAGAAGC正向突变型引物:TCCGCGATGCCGATGACCTGCAGAAGT所述APOE基因内参上游引物和共用下游引物:正向内参引物:CCGCAGGGCGCTGATGGACGAGACCATG反向共用弓I物:CCCGCACGCGGCCCTGTTCCACCA。所述的APOE基因检测试剂盒所采用的检测方法,对受检样本DNA分别用野生型和突变扩增缓冲液进行扩增,在每个反扩增反应中同时对2个目的片段和I个内参片段进行扩增,扩增片段由大到小依次是:内对照398bp,rs429358264bp,rs7412129bp ;扩增后经凝胶电泳在紫外光下见到根据片段大小区分开的产物条带,根据条带的有无判断2个SNP位点的基因型。所述的APOE基因检测试剂盒的多重PCR扩增方法,包括以下步骤:预变性由1次循环构成,其条件为:温度为94°C,时间为5分钟;PCR扩增由30次循环构成,其条件为:变性:温度为94 °C,时间为30秒;退火:温度为65°C,时间为30秒;延伸:温度为72°C,时间为90秒;扩增结束后于4°C保存至电泳检测。本发明与现有技术相比具有下列优点和效果:(I)本发明采用多重PCR扩增技术,在一次PCR反应中对2个包含SNP位点的DNA片段和I个内参片段同时进行扩增,提高检测效率降低检测成本。(2)本发明采用SNP敏感性分子开关技术,使3’端不能与模板互补的引物所引发的扩增非成熟性终止,无法形成产物,避免假阳性结果的产生。(3)引入内参,为阴性结果的判读提供依据,避免假阴性结果的产生。(4)本发明扩增后只需通过DNA凝胶电泳及凝胶成像系统即可完成检测,不需添置贵重设备,快速,准确,灵敏,特异,重复性好,大幅降低了检测成本和操作复杂程度,适合临床和科研使用。(5)无需DNA提取,只需裂解全血细胞,将细胞裂解后的悬液加入反应体系即可完成扩增,免去DNA提取的步骤和成本并避免气溶胶污染。(6)本发明的试剂盒,分别提供野生型和突变型的2X扩增缓冲液,使用者只要全血裂解悬液和聚合酶即可进行扩增,减少了操作步骤,提高劳动速率,可以实现高效率检测。(7)本发明的试剂盒所提供的野生型和突变型2X扩增缓冲液,使用了不同颜色的扩增指示染料,方便加样时区分,避免人为错误。扩增后即可直接进行凝胶电泳,无需加A loading buffer,操作方便快捷。本发明公开了一种APOE基因检测试剂盒及扩增方法和检测方法。所述试剂盒对APOE基因上明显改变其产物活性的两个常见的多态性位点进行分型,包括rs429358SNP位点和rs7412SNP位点。试剂盒包含野生型2×扩增缓冲液、突变型2×扩增缓冲液、聚合酶,两种缓冲液中分别含有对应SNP野生型和突变型表型的序列特异性引物和内参引物,可在两个多重PCR反应中完成对上述两个SNP位点的分型,从而对APOE基因进行基因分型,为该基因所表达的酶的活性的预测提供分子生物学依据。
Apoe基因检测试剂盒及扩增方法和检测方法
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