早鸽—汇聚行业精英
  • 联系客服
  • 帮助中心
  • 投诉举报
  • 关注微信
400-006-1351
您的问题早鸽都有答案
3000+专业顾问
搜索
咨询

炭疽芽孢杆菌检测试剂盒及其使用方法

  • 专利名称
    炭疽芽孢杆菌检测试剂盒及其使用方法
  • 发明者
    何宇平, 周蕾, 张继伦, 曹以诚, 杜正平, 王传现, 田桢干, 谭慧媚, 陆晔, 陈洵
  • 公开日
    2011年8月10日
  • 申请日期
    2011年2月24日
  • 优先权日
    2011年2月24日
  • 申请人
    中华人民共和国上海出入境检验检疫局, 广州华峰生物科技有限公司
  • 文档编号
    C12Q1/68GK102146470SQ20111004446
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,其特征在于,所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒包括 以炭疽芽孢杆菌/ 基因为靶基因、基于环介导恒温扩增技术设计的两对引物内引物FIP/ BIP和外引物F3/B32.根据权利要求1所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,其特征在于,所述的两对引物为 外引物F3 CTGATAGTCAAACGAGAACAA 外引物B3 AGTTCTTTCCCCTGCTAGA 内引物FIP CGCATGCACTTCTGCATTTCTTTTAATACTTCTACAAGTAGGACACAT 内引物BIP TCGTTCTTTGATATTGGTGGGAGTTTTTGATAGTGAATGATCAATTGCGAC3.根据权利要求1所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,其特征在于,所述的炭疽芽孢杆 菌检测试剂盒还包括fei DNA聚合酶、反应液、稳定液、样品预处理液、显色液和阳性对照 液4.根据权利要求3所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,其特征在于, 所述的fei DNA聚合酶酶浓度4-10 U/ μ L ;所述的反应液含1. 6 2mmol/L dNTP、20 25mmol/L Tris-HCl、10 12. 5mmol/L KCl、10 12. 5mmol/L (NH4)2SO4,8 10mmol/L MgS04、0. 1 0· 125 体积% TritonX-100、 0.8 lmol/L甜菜碱;所述的样品预处理液含10 20 mmol/L pH 8.0的Tris- HC1、1 2 mmol/L EDTA和 1 1. 2 体积 % Triton X-100 ;所述的显色液为SYBR Green I或Eva Green ; 所述稳定液为石蜡油;所述的阳性对照为炭疽芽孢杆菌基因组DNA ;所述的内引物FIP/BIP各为0. 2 0. 25 μ mol/L,外引物F3/B3的浓度各为1. 2 2. 0 μ mol/L5.根据权利要求4所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,其特征在于, 所述的fei DNA聚合酶酶浓度8 U/ μ L ;所述的反应液含2mmol/L dNTP、25mmol/L Tris-HCl、12. 5mmol/L KC1、12. 5mmol/L (NH4) 2S04UOmmol/L MgS04、0. 125 体积 % TritonX-100、lmol/L 甜菜碱;所述的样品预处理液含20 mmol/L pH 8. 0的Tris- HCl,2 mmol/L EDTA和1. 2体 积 % Triton X-100 ;所述的显色液为STOR Green I ;所述的内引物FIP/BIP的浓度为0. 2 μ mol/L ;所述的外引物F3/B3的浓度为1.6 μ mol/L6.根据权利要求3、4或5所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,其特征在于,所述的炭疽芽 孢杆菌检测试剂盒还包括反应管,所述的反应管由管体和管盖两部分组成,管体内腔的下 部设有将其分隔成A、B两个空腔的纵向延伸的隔板7.根据权利要求6所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,其特征在于,所述的A、B两个空 腔中分别装有工作液或显色液,两个空腔中的液体上层均由稳定液封存,所述工作液为反 应液和fei DNA聚合酶的混合而成8.一种使用如权利要求3所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的方法,其特征在于,该方 法包括如下步骤(1)将待测样品离心,去上清,得到沉淀;(2)将步骤(1)的沉淀加入样品预处理液,混合均勻,沸水浴灭活后冰上冷却,高速离 心,上清即为样品模板DNA;(3)在反应容器中加入feiDNA聚合酶0. 9 1. 8体积份数、反应液38 40体积份数、 稳定液52 54. 5体积份数、样品模板DNA 4. 5、体积份数、内引物FIP/BIP各2体积份数、 外引物F3/B3各4体积份数,恒温反应;(4)在上述反应容器和阳性对照中分别加入显色液,混勻,样品组显色与对照组相同则 为阳性,否则为阴性;所述步骤(3)中的内引物FIP/BIP和外引物F3/B3为以炭疽芽孢杆菌的/ 基因为靶 基因、基于环介导恒温扩增技术设计的两对引物9.根据权利要求8所述的使用炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的方法,其特征在于,所述的 两对引物为外引物F3 CTGATAGTCAAACGAGAACAA外引物B3 AGTTCTTTCCCCTGCTAGA内引物FIP CGCATGCACTTCTGCATTTCTTTTAATACTTCTACAAGTAGGACACAT内引物BIP TCGTTCTTTGATATTGGTGGGAGTTTTTGATAGTGAATGATCAATTGCGAC10.根据权利要求8或9所述的使用炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的方法,其特征在于,步骤(3)中,恒温反应的反应条件为温度63 65°C,反应时间45 90min
  • 技术领域
    本发明涉及生物检测试剂,具体涉及一种炭疽芽孢杆菌检测试剂盒及其使用方法
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    为使本发明更加容易理解,下面将进一步阐述本发明的具体实施例下列缩略语适用于本发明
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:炭疽芽孢杆菌检测试剂盒及其使用方法炭疽芽孢杆菌属于需氧芽胞杆菌属,能引起羊、牛、马等动物及人类的炭疽病,并 能造成环境的广泛污染。由于炭疽芽孢具有对外界环境极强的抵抗力,造成这种污染常持 续存在。因此准确、快速地检测炭疽芽孢杆菌具有十分重要的意义。传统炭疽芽孢杆菌检测方法,由于其检测周期长、程序复杂、所需试剂繁多等缺点 已远远不能满足现代检测要求。以聚合酶链式反应(PCR)技术为代表的病原核酸检测技术 在实际应用中存在一些问题,如普通聚合酶链式反应(PCR)技术需要专门的仪器,而且存在 容易交叉污染和操作过程烦琐的缺点。而荧光实时定量聚合酶链式反应(real time PCR) 技术虽然较好地解决了交叉污染的问题,并简化了操作过程,但却需要更复杂的定量测定 仪器,因此不适用于现场快速检测。而且实时定量聚合酶链式反应PCR技术中荧光探针的 成本较高,加大了推广应用的难度。免疫学检测技术快速简便成本低廉,但要求高质量高稳 定性的单克隆抗体,否则因准确性不够,目前只能是辅助检测手段。所以及时运用生物技 术发展的最新成果对满足病原微生物检测要求的不断提高具有重要意义。其中恒温扩增 (Isothermal Amplification)核酸快速检测技术是病原核酸检测技术上的长足进步,现已 建立起来的环介导恒温扩增技术(LAMP)具有很多的优越性。因此,需要一种检测效果更全面、特异性高、漏检率低的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒 及其使用方法以解决上述问题。
本发明的目的在于解决现有技术的不足之处而提供一种检测效果更全面、特异性 高、漏检率低的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒。本发明的目的可以通过以下技术措施实现一种炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,所述 的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒包括以炭疽芽孢杆菌的/ 基因为靶基因、基于环介导恒温扩 增技术设计的两对引物内引物FIP/BIP和外引物F3/B3。本发明检测的是/ 基因。该/ 基因是炭疽芽孢杆菌保护性抗原基因。与NCBI网站nt数据库的BLAST比对结果显示,除炭疽芽孢杆菌外,无其它菌带有 该基因。作为本发明炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的优选实施方式,所述的两对引物为 外引物 F3 :(SEQ ID NO 1)CTGATAGTCAAACGAGAACAA 外引物 B3 :(SEQ ID NO 2) AGTTCTTTCCCCTGCTAGA内引物 FIP (SEQ ID NO 3)CGCATGCACTTCTGCATTTCTTTTAATACTTCTACAAGTAGGACACAT 内引物 BIP :(SEQ ID NO 4)TCGTTCTTTGATATTGGTGGGAGTTTTTGATAGTGAATGATCAATTGCGAC。作为本发明炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的优选实施方式,所述的炭疽芽孢杆菌检测 试剂盒还包括ifeiDNA聚合酶、反应液、稳定液、样品预处理液、显色液和阳性对照液。作为本发明炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的更优选实施方式, 所述的fei DNA聚合酶酶浓度4-10 U/ μ L ;
所述的反应液含1. 6 2mmol/L dNTP、20 25mmol/L Tris-HCl、10 12. 5mmol/L KCl、10 12. 5mmol/L (NH4)2SO4,8 10mmol/L MgS04、0. 1 0· 125 体积% TritonX-100、 0.8 lmol/L甜菜碱;
所述的样品预处理液含10 20 mmol/L pH 8.0的Tris- HC1、1 2 mmol/L EDTA和 1 1. 2 体积 % Triton X-100 ;
所述的显色液为SYBR Green I或Eva Green ; 所述稳定液为石蜡油;
所述的阳性对照为炭疽芽孢杆菌基因组DNA ;
所述的内引物FIP/BIP各为0. 2 0. 25 μ mol/L,外引物F3/B3的浓度各为1. 2 2. 0 μ mol/L。作为本发明炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的最优选实施方式, 所述的fei DNA聚合酶酶浓度8 U/ μ L ;
所述的反应液含2mmol/L dNTP、25mmol/L Tris-HCl、12. 5mmol/L KC1、12. 5mmol/L (NH4) 2S04UOmmol/L MgS04、0. 125 体积 % TritonX-100、lmol/L 甜菜碱;
所述的样品预处理液含20 mmol/L pH 8. 0的Tris- HCl,2 mmol/L EDTA和1. 2体 积 % Triton X-100 ;
所述的显色液为STOR Green I ;
所述的内引物FIP/BIP的浓度为0. 2 μ mol/L ;
所述的外引物F3/B3的浓度为1.6 μ mol/L。作为本发明炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的优选实施方式,所述的炭疽芽孢杆菌检测 试剂盒还包括反应管,所述的反应管由管体和管盖两部分组成,管体内腔的下部设有将其 分隔成A、B两个空腔的纵向延伸的隔板。作为本发明炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的更优选实施方式,所述的A、B两个空腔中 分别装有工作液或显色液,两个空腔中的液体上层均由稳定液封存,所述工作液为反应液 和fei DNA聚合酶的混合而成。本发明还提供一种炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的使用方法,该方法包括如下步骤
(1)将待测样品离心,去上清,得到沉淀;
(2)将步骤(1)的沉淀加入样品预处理液,混合均勻,沸水浴灭活后冰上冷却,高速离 心,上清即为样品模板DNA;
(3)在反应容器中加入feiDNA聚合酶0. 9 1. 8体积份数、反应液38 40体积份数、 稳定液52 54. 5体积份数、样品模板DNA 4. 5、体积份数、内引物FIP/BIP各2体积份数、外引物F3/B3各4体积份数,恒温反应;
(4)在上述反应容器和阳性对照中分别加入显色液,混勻,样品组显色与对照组相同则 为阳性,否则为阴性;
所述步骤(3)中的内引物FIP/BIP和外引物F3/B3为以炭疽芽孢杆菌的/ 基因为靶 基因、基于环介导恒温扩增技术设计的两对引物。作为本发明使用炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的方法的优选实施方式,所述的两对引 物为
外引物 F3 :(SEQ ID NO 1) CTGATAGTCAAACGAGAACAA 外引物 B3 :(SEQ ID NO 2) AGTTCTTTCCCCTGCTAGA 内引物 FIP :(SEQ ID NO 3)
CGCATGCACTTCTGCATTTCTTTTAATACTTCTACAAGTAGGACACAT 内引物 BIP :(SEQ ID NO 4)
TCGTTCTTTGATATTGGTGGGAGTTTTTGATAGTGAATGATCAATTGCGAC。作为本发明使用炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的方法的优选实施方式,步骤(3)中,恒 温反应的反应条件为温度63 65°C,反应时间45 90min。本发明所说的基于环介导恒温扩增技术(loop-mediated isothermal amplication of DNA,简称LAMP)快速检测炭疽芽孢杆菌的方法,是利用feiDNA聚合酶和 根据靶基因序列设计的两对特殊的内、外引物(即内引物FIP/BIP和外引物F3/B3),特异性 识别靶序列上的六个独立区域,启动循环链置换反应,在靶标DNA区启动互补链合成,结果 在同一链上互补序列周而复始形成有很多环的花椰菜结构的茎-环DNA混合物。LAMP反 应过程中,从dNTP析出的焦磷酸根离子与反应溶液中的Mg2+结合,产生副产物——焦磷酸 镁乳白色沉淀,即可通过肉眼观察判定结果。LAMP反应是在恒温(63 65°C)条件下45 90分钟内完成。这种比较温和的温度条件以及没有温度循环使所需仪器简单化,克服了传 统PCR固有的检测时间长、容易污染及检测成本高等缺点。此外,这种检测方法对检测人员 的技术素质要求较低,实际操作极为简便,不需要特殊的试剂和仪器设备,有利于建立成本 低廉的快速筛选体系。LAMP法是一种简便、快速、高度特异性的基因扩增法。将恒温基因 扩增技术与PCR技术(包括荧光实时定量PCR技术)进行比较,可以发现该技术在灵敏度、特 异性和检测范围等方法学指标上相当于或优于PCR技术,且不依赖任何专门的仪器设备即 可实现现场高通量快速检测,而且检测成本远低于荧光定量PCR技术。目前国家标准中以 微生物分离培养和形态学鉴定为主、结合生化分析和血清学分型鉴定的通行方法,初步鉴 定需2 3天,完成鉴定报告需10 15天;采用本发明的检测试剂盒仅需2小时。并且, 本发明的反应体系中加入了显色液,鉴定结果更为直观清晰。与现有技术相比,本发明具有如下有益效果1.本发明的检测试剂盒只需一个恒 定温度就能扩增反应,不需要特殊试剂与设备,检测成本低;2.本发明的基因快速诊断试 剂盒应用六个区段,四条引物,根据是否扩增就能判断靶标物质的存在与否,因此具有高 特异性;3.本发明的检测试剂盒扩增快速且高效,在不到1小时即可完成扩增,且产率高; 4.本发明的检测试剂盒灵敏度高,扩增模板仅需10拷贝或更少;5.本发明的基因快速诊断试剂盒鉴定简便,从dNTP析出的焦磷酸根离子与反应溶液中的Mg2+结合,产生副产物—— 焦磷酸镁沉淀,可通过肉眼观察鉴定,并且加入显色液后,阴阳性结果显色差异显著,验证 率高,更加明显可靠;6.由于选择了高保守性的/ 基因作为靶基因设计引物,使得本发明 的检测试剂盒检测炭疽芽孢杆菌的准确率更高;7.在本发明检测试剂盒中采用特制的反 应管,减少了气溶胶污染的可能性,同时方便操作。

LAMP loop-mediated isothermal amplification,环介导恒温扩增
dNTP :deoxyribonucleoside triphosphate,脱氧核苷三憐酸
Bst 酶Bst DNA polymerase (large fragment), Bst DNA 聚合酶(大片段)
EDTA :ethylenediamine tetraacetic acid,乙二胺四乙酸
DNA deoxyribonucleic acid,脱氧核糖核酸
Betaine 甜菜碱
Triton X-100 聚乙二醇辛基苯基醚 PA基因炭疽芽孢杆菌保护性抗原基因 实施例1试剂盒的制备
(1)按以下序列经DNA合成仪合成寡聚脱氧核酸引物 外引物F3
CTGATAGTCAAACGAGAACAA 外引物B3
AGTTCTTTCCCCTGCTAGA 内引物FIP
CGCATGCACTTCTGCATTTCTTTTAATACTTCTACAAGTAGGACACAT 内引物BIP
TCGTTCTTTGATATTGGTGGGAGTTTTTGATAGTGAATGATCAATTGCGAC。(2)购置DNA聚合酶-.Bst DNA聚合酶置于容器;
(3)配制反应液和引物反应液含有2mmol/LdNTP、25mmol/L Tris-Cl、12. 5mmol/L KCl、12. 5mmol/L (NH4)2SO4UOmmo 1/L MgS04、0. 125 体积 % TritonX-100、lmol/L 甜菜碱、内 引物FIP/BIP各0· 2 μ mol/L和外引物F3/B3各0. 25 μ mol/L,置于容器;
(4)配制样品预处理液样品预处理液含有20mmol/L Tris- HCl (pH 8.0),2 mmol/ L EDTA 和 1. 2 体积 % Triton X-100,置于容器;
(5)购置稳定液石蜡油,置于容器;
(6)购置显色液STORGreen I,置于容器;
(7)提取阳性对照提取炭疽芽孢杆菌基因组DNA,置于容器;
(8)将上述7个容器装成试剂盒,封装。制备工艺简述如下
1、将内引物FIP/BIP和外引物F3/B3合成纯化后,定量配制,浓度检测,抽样质检;2、将上述(2广(4)步骤配制的液体无菌分装,并按照实验用进行浓度确定,抽样质检;
3、将稳定液分装,抽样质检;
4、将阳性对照标本制备,分装,抽样质检;
5、组装试剂盒。实施例2炭疽芽孢杆菌检测试剂盒的应用 1材料与方法
1. 1材料 1. 1. 1菌株
本发明采用菌株有16株,主要来源于军事医学科学院、临床分离菌株和环境分离菌 株。详见表1。表1菌株名称及来源
8


本发明提供一种炭疽芽孢杆菌检测试剂盒,所述的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒包括以炭疽芽孢杆菌PA基因为靶基因、基于环介导恒温扩增技术设计的两对引物内引物FIP/BIP和外引物F3/B3。本发明的炭疽芽孢杆菌检测试剂盒检测效果更全面、漏检率低。



查看更多专利详情

下载专利文献

下载专利