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一种转基因大米Bt63检测试剂盒及其检测方法

  • 专利名称
    一种转基因大米Bt63检测试剂盒及其检测方法
  • 发明者
    周赞虎, 郑天凌
  • 公开日
    2012年8月1日
  • 申请日期
    2012年4月25日
  • 优先权日
    2012年4月25日
  • 申请人
    厦门大学
  • 文档编号
    C12Q1/68GK102618661SQ20121012529
  • 关键字
  • 权利要求
    1.一种转基因大米Bt63检测试剂盒,其特征在于包括 .1)环介导等温扩增反应液A 所述环介导等温扩增反应液A含有IOXBst DNA聚合酶反应缓冲液、300 μ M dNTP、2mM硫酸镁和转基因大米引物I ;所述转基因大米引物I包括O. 8 μ M上游内引物FIP-I、0. 8 μ M下游内引物ΒΙΡ-1、0. 2μΜ上游外引物F3-1和O. 2 μ M下游外引物Β3-1 ; 其中, 上游外引物 F3-1 GTTACTTTGAAAGTGCCAATG 下游外引物 Β3-1 GAAACTTTATTGCCAAATGTTTG 上游内引物 FIP-I ACTCCAGCAGTCCCACTAAAGCTTTTACATCTTCACTCGGTAA 下游内引物 BIP-I ATCGACAGATTCGAGTTCATTCCAGAACGATCGGGGAAATTCG .2)环介导等温扩增反应液B 所述环介导等温扩增反应液B含有IOXBst DNA聚合酶反应缓冲液、300 μ M dNTP、2mM硫酸镁和大米内源基因引物2 ;所述大米内源基因引物2包括O. 8 μ M上游内引物FIP-2、O. 8μΜ下游内引物ΒΙΡ-2、0. 2μΜ上游外引物F3-2和O. 2 μ M下游外引物Β3-2 ; 其中, 上游外引物 F3-2 GGAAAGCCGATGGCATCAG 下游外引物 Β3-2 TCTCCATTGTCCTCCTCTGC 上游内引物 FIP-2 GCAAAACGCTCACCAGCTTCAAGACATTGAGGCGTTGCATCT下游内引物 BIP-2 ATGTTGTGCTGCCAATGTGGCCCAGTATTGCCTGCACTGAT其中IOXBst DNA聚合酶反应缓冲液含有200mM pH8. 8的三羟基甲基氨基甲烷-盐酸、IOOmM氯化钾、IOOmM硫酸铵、20mM硫酸镁和I %曲拉通X-100 ; .3)BstDNA聚合酶C 含8个活性单位/ μ L ; .4)显色剂D10% SYBR GREEN I荧光染料; 在装有环介导等温扩增反应液A的反应管加入转基因大米引物I的上游外引物F3-1和下游外引物Β3-1各0.2 μ mol/L,加入转基因大米引物I的上游内引物FIP-I和下游内引物BIP-I各至O. 8 μ mol/L ;在装有环介导等温扩增反应液B的反应管加入大米内源基因引物2的上游外引物F3-2和下游外引物B3-2至O. 2 μ mol/L,加入大米内源基因引物2的上游内引物FIP-2和下游内引物BIP-2至O. 8 μ mol/L2.转基因大米Bt63的检测方法,其特征在于包括以下步骤 .1)提取模板DNA; .2)环介导等温扩增 a.在装有23μ L LAMP反应液A的反应管A中加入I μ L待检模板DNA,同时在装有23 μ LLAMP反应液B的反应管B中加入I μ L待检模板DNA,95°C恒温水浴.5min,立即置于冰上 Imin ; b.分别在反应管A和反应管B中各加入Iμ L Bst DNA聚合酶; c.60 65°C恒温水浴Ih ; d.80°C恒温3min,中止反应; .3)显色检测 在反应管B中加入I μ L显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,如果颜色为黄色,说明样品DNA提取失败,整个实验必需重做;如颜色为绿色,说明样品DNA提取成功,进行下一步实验;在验证了样品DNA提取成功的前提下,在反应管A中加入I μ L显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,若颜色为黄色,则说明样品为非转基因大米;若颜色为绿色,则判定样品为转基因大米3.如权利要求2所述的转基因大米Bt63的检测方法,其特征在于在步骤I)中,所述提取模板DNA的方法按常规方法或商品化的大米DNA提取试剂盒提取大米DNA
  • 技术领域
    本发明涉及转基因大米,尤其是涉及一种转基因大米Bt63检测试剂盒及其检测方法
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    下列实施例是进一步对本发明的说明,不应当作对本发明的限制1、按下列配方制作Bt63转基因大米的环介导等温扩增检测试剂盒(I)环介导等温扩增反应液A 含有IOXThermopol反应缓冲液、IOmM dNTP、IOOmM硫酸镁、O. 8 μ M转基因大米上游内引物、O. 8 μ M转基因大米下游内引物、O. 2 μ M转基因大米上游外引物、O. 2 μ M转基因大米下游外引物;(2)环介导等温扩增反应液B 含有IOXThermopol反应缓冲液、IOmM dNTP、IOOmM硫酸镁、O. 8 μ M大米内源基因上游内引物、O. 8μ M大米内源基因下游内引物、O. 2μ M大米内源基因上游外引物、O. 2μ M 大米内源基因下游外引物;(3) BstDNA 聚合酶 C 浓度 8U/ML ;(4)显色剂 D 10% SYBR GREEN I 荧光染料2、按以下程序检测使用上述环介导等温扩增试剂盒检测Bt63转基因大米,包含下列步骤(I)模板DNA的提取按常规方法(SN/T 2584-2010)提取大米DNA 每个样品提取2个平行管称取200mg粉碎的样品,加入ImL预冷至4°C的抽提液, 剧烈摇动混匀后,在冰上静置5min,4°C条件下IOOOOg离心15min,弃上清液;加入600 μ L 预热到65°C的裂解液,充分重悬沉淀,在65°C恒温保持40min,期间颠倒混匀5次;室温条件下,IOOOOg离心lOmin,取上清液转至另一新离心管中,加入5 μ L RNase A,37°C恒温保持 30min分别用I)苯酚、2)异戊醇溶液和三氯甲炕、3)异戊醇溶液各抽提一次,所述I)苯酚、2)异戊醇溶液和三氯甲炕、3)异戊醇溶液等体积,在室温条件下,IOOOOg离心lOmin,取上清液转至另一新离心管中;加入三分之二体积异丙醇,十分之一体积3mol/L乙酸钠溶液 (pH5. 6),-20°C放置2 3h ;在4°C条件下,IOOOOg离心15min,弃上清液,用70%乙醇洗涤沉淀一次,倒出乙醇,晾干沉淀;加入50 μ L TE (ρΗ8. 0)溶解沉淀,所得溶液即为样品DNA溶液注也可使用等效的其他商品化DNA提取试剂盒(2)环介导等温扩增a.在装有23 μ L LAMP反应液A的反应管A中加入I μ L待检模板DNA,同时在装有23 μ LLAMP反应液B的反应管B中加入I μ L待检模板DNA,95°C恒温水浴5min,立即置于冰上Imin ;b.分别在反应管A和反应管B中各加入I μ L Bst DNA聚合酶;c. 60 65 °C 恒温水浴 Ih ;d.80°C恒温3min,中止反应
  • 专利详情
  • 全文pdf
  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:一种转基因大米Bt63检测试剂盒及其检测方法Bt63转基因大米是含有抗虫基因的大米,能够抵抗病害,增加稻产量,但用这种大米制成的儿童食品可能影响婴儿健康。2008年4月15日起,欧盟要求所有从中国进口的米制品接受欧盟认可实验室的检验,并附上确定未含“Bt63”的卫生证书(http://eUr-leX· europa. eu/Lex UriServ/LexUriServ. do uri = OJ L :2008 :096 :0029 :0034 EN PDF)。 以往检测Bt63转基因大米主要有普通PCR法和荧光定量PCR法(徐颖.转基因大米的安全性与核酸检测技术的进展.安徽农业科学,2009,37 (33) : 16240-16242 ;吴孝槐,路勇.利用实时荧光PCR方法检测转Bt基因大米[J]现代食品科技,2009 (25) :211-216.),普通PCR 法需要相对昂贵的PCR仪及凝胶成像系统,荧光定量PCR法则需要昂贵的荧光定量PCR仪, 基层检测机构以及广大食品加工企业很难普及该检测方法。目前尚未见到用环介导等温扩增扩增技术检测Bt63转基因大米的报道
本发明的第一目的在于提供一种转基因大米Bt63检测试剂盒。本发明的第二目的在于提供一种转基因大米Bt63的检测方法。所述转基因大米Bt63检测试剂盒包括I)环介导等温扩增反应液A所述环介导等温扩增反应液A含有IOXBst DNA聚合酶反应缓冲液、300 μ M dNTP、2mM硫酸镁和转基因大米引物I ;所述转基因大米引物I包括0.8μΜ上游内引物 FIP-1、0. 8μΜ下游内引物ΒΙΡ-1、0. 2μΜ上游外引物F3-1和O. 2 μ M下游外引物Β3-1 ;其中,上游外弓I 物 F3-1 GTTACTTTGAAAGTGCCAATG下游外引物Β3-1 GAAACTTTATTGCCAAATGTTTG上游内引物 FIP-I ACTCCAGCAGTCCCACTAAAGCTTTTACATCTTCACTCGGTAA下游内引物BIP-I ATCGACAGATTCGAGTTCATTCCAGAACGATCGGGGAAATTCG2)环介导等温扩增反应液B所述环介导等温扩增反应液B含有IOXBst DNA聚合酶反应缓冲液、300 μ M dNTP、2mM硫酸镁和大米内源基因引物2 ;所述大米内源基因引物2包括0.8μΜ上游内引物 FIP-2、0. 8μΜ下游内引物ΒΙΡ-2、0· 2μΜ上游外引物F3-2和O. 2 μ M下游外引物Β3-2 ;其中,上游外弓I 物 F3-2 GGAAAGCCGATGGCATCAG下游外引物Β3-2 TCTCCATTGTCCTCCTCTGC上游内引物FIP-2 GCAAAACGCTCACCAGCTTCAAGACATTGAGGCGTTGCATCT下游内引物BIP-2 ATGTTGTGCTGCCAATGTGGCCCAGTATTGCCTGCACTGAT其中IOXBst DNA聚合酶反应缓冲液含有200mM pH8. 8的三羟基甲基氨基甲烷-盐酸(Tris-HCl)、IOOmM 氯化钾(KCl)、IOOmM 硫酸铵((NH4) 2S04)、20mM 硫酸镁(MgSO4) 和 1% 曲拉通 X-100 (Triton X-100);3) Bst DNA聚合酶C :含8个活性单位/ μ L 4)显色剂D :10% SYBR GREEN I荧光染料(SYBR GREEN I荧光染料是一种DNA荧光染料,国内商品名为SYBR GREEN I,该称谓也可见中国专利200710026390. X);在装有环介导等温扩增反应液A的反应管加入转基因大米引物I的上游外引物 F3-1和下游外引物Β3-1各O. 2ymol/L,加入转基因大米引物I的上游内引物FIP-I和下游内引物BIP-I各至O. 8 μ mol/L ;在装有环介导等温扩增反应液B的反应管加入大米内源基因引物2的上游外引物F3-2和下游外引物B3-2至O. 2 μ mol/L,加入大米内源基因引物 2的上游内引物FIP-2和下游内引物BIP-2至O. 8 μ mol/L。所述转基因大米Bt63的检测方法包括以下步骤I)提取模板DNA ;在步骤I)中,所述提取模板DNA的方法可按常规方法或商品化的大米DNA提取试剂盒提取大米DNA ;2)环介导等温扩增a.在装有23 μ L LAMP反应液A的反应管A中加入I μ L待检模板DNA,同时在装有23 μ LLAMP反应液B的反应管B中加入I μ L待检模板DNA,95°C恒温水浴5min,立即置于冰上Imin ;b.分别在反应管A和反应管B中各加入IyL Bst DNA聚合酶;c. 60 65 °C 恒温水浴 Ih ;d. 80°C恒温3min,中止反应;3)显色检测在反应管B中加入IyL显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,如果颜色为黄色,说明样品DNA提取失败,整个实验必需重做;如颜色为绿色,说明样品DNA提取成功,进行下一步实验。在验证了样品DNA提取成功的前提下,在反应管A中加入I μ L显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,如果颜色为黄色,说明样品为非转基因大米;如颜色为绿色,则可判定样品为转基因大米。本发明的优点本发明依据欧盟联合研究中心(JRC)确认的CRL方法的检测原理,采用环介导等温扩增技术建立了 Bt63转基因大米的环介导等温扩增检测试剂盒和检测方法,此技术特异性强,与PCR方法有相同的灵敏度,但不需要昂贵的PCR仪或荧光定量PCR仪,只需普通的水浴锅即可,且结果不必用凝胶电泳方法来检验,加入荧光染料目测观察即可,简单快速,特别适合于基层食品检测机构和食品加工企业自检。本发明利用4条特殊设计的引物及具有链置换活性的Bst DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效、快速扩增DNA,在Ih内能达到IO9靶序列拷贝。可通过荧光染料来观察扩增效果。本发明提供了一种快速、特异性强、成本低的环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification, LAMP)方法用于检测Bt63转基因大米,可以替代欧盟联合研究中心(JRC)确认的CRL方法,为食品安全监控提供新的科学依据。(3)显色检测在反应管B中加入IyL显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,如果颜色为黄色,说明样品DNA提取失败,整个实验必需重做;如颜色为绿色,说明样品DNA提取成功,进行下一步实验。 在验证了样品DNA提取成功的前提下,在反应管A中加入I μ L显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,如果颜色为黄色,说明样品为非转基因大米;如颜色为绿色,则可判定样品为转基因大米。
一种转基因大米Bt63检测试剂盒及其检测方法,涉及转基因大米。试剂盒包括环介导等温扩增反应液A、环介导等温扩增反应液B、Bst DNA聚合酶C和显色剂D。提取模板DNA;环介导等温扩增;显色检测。利用4条特殊设计的引物及具有链置换活性的Bst DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效、快速扩增DNA,在1h内能达到109靶序列拷贝。可通过荧光染料来观察扩增效果。提供一种快速、特异性强、成本低的环介导等温扩增方法用于检测Bt63转基因大米,可以替代欧盟联合研究中心确认的CRL方法,为食品安全监控提供新的科学依据。



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