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用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒制作方法

  • 专利名称
    用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒制作方法
  • 发明者
    刘振勇, 巩伟, 张少华, 才学鹏, 郭爱疆, 闫鸿斌, 骆学农
  • 公开日
    2012年4月25日
  • 申请日期
    2011年12月9日
  • 优先权日
    2011年12月9日
  • 申请人
    中国农业科学院兰州兽医研究所
  • 文档编号
    C12Q1/68GK102424837SQ201110410050
  • 关键字
  • 权利要求
    1.用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒,其特征在于试剂盒内包括有两对人工序列 SEQ No. 1和 SEQ No. 22.权利要求1所述的用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒使用方法,其特征在于从检材中提取DNA,然后用试剂盒内的两条引物进行聚合酶链式反应得到产物,将反应产物用琼脂糖凝胶电泳回收后进行本科切反应,然后再在玉脂糖中进行电泳,获得PCR-RFLP指纹图谱,根据PCR-RFLP指纹图谱中是否存在特定条带区分鉴别出检材属于何种带绦虫
  • 技术领域
    本发明涉及一种寄生虫分类检测试剂盒,以及这种试剂盒的使用方法,确切讲本发明是一种用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒及这种试剂盒的使用方法
  • 背景技术
  • 具体实施例方式
    DNA基因组的提取分别取液氮保存罐中存储的牛带绦虫、猪带绦虫、亚洲带绦虫虫体各20mg左右的,移入冰水浴冷的研钵中,倒入液氮快速用力研磨成勻浆按照AXYGEN公司动植物组织基因组提取试剂盒步骤操作,具体步骤为加入350ul的Buffer PBS (购自AXYGEN公司) 和0. 9ul RNase A后温和的研磨30s,收集研磨好的组织勻浆350ul中加入150ul的Buffer C-L和20ul的蛋白酶K,漩涡振荡Imin混勻,置56 °C水浴30min_60min加入350ul的 Buffer P-D,漩涡振荡30s混勻,12000 X g离心lOmin收集上清入DNA制备管中,12000 X g 离心lmin,弃滤液;加入500ul的Buffer Wl,12000 Xg离心lmin,弃滤液;加入700ul的 Buffer W2洗涤,12000Xg离心lmin,弃滤液,重复洗涤一次;将DNA制备管于12000Xg离心lmin,加入40ul的Eluent, 12000Xg离心lmin,即为DNA提取液PCR 扩增PCR反应体系为50ul,包含2XPremix LA Taq溶液缓冲液25ul (购自TaKaRa公司)、浓度为40μπιΟ1/1的上游引物2ul、浓度为40μπιΟ1/1的下游引物2ul (上海生工生物工程公司合成)、上述DNA提取液2ul、ddH20 19ul ;扩增反应条件为95°C预变性5min ; 94°C变性30s,55°C退火40s,72°C延伸anin30S,共;35个循环;最后一个循环结束后,72°C 延伸10min,4°C保存,得到PCR产物;琼脂糖凝胶电泳回收目的条带酶切反应将上述PCR产物6ul、10XH Buffer溶液lul、去离子水2ul、Nde I酶Iul (购自 TaKaRa公司)置于PCR管中,37°C水浴,酶切反应证,然后进行2. O%琼脂糖凝胶电泳,在紫外灯下观察、拍照,获得PCR-RFLP带谱;琼脂糖凝胶电泳条件10ul酶解液加入Iul的6X 上样缓冲液混勻,上样于2.0%的琼脂糖凝胶中(含5ul/100ml EB),于IlOV稳压下电泳, 电泳缓冲液为1XTAE,电泳时间为30min,电泳结束后紫外灯下观察、拍照带谱鉴别如表1、图1所示,上述PCR-RFLP谱带中若最大条带为1396bp,则为猪带绦虫;若存在586bp和662bp两条带,则为牛带绦虫;若只存在586bp的条带,则为亚洲带绦虫表1.三种带科绦虫限制性内切酶Nde I酶切带谱对比表(bp)
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  • 权力要求
  • 说明书
  • 法律状态
专利名称:用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒的制作方法猪带绦虫(Taeniasolium)、牛带绦虫(Taenia saginata)和亚洲带绦虫(Taenia asiatica)是3种重要的人兽共患寄生虫病病原,且其成虫均寄生于人小肠内。三种成虫, 尤其亚洲带绦虫与牛带绦虫的成虫特征几乎完全一致,依靠形态特征很难加以鉴别,况且很多情况下仅能得到成熟节片,所以导致主要依赖头节形态的显微镜观察显得无能为力。 而幼虫形态、中间宿主种类和人体感染途径等却存在明显差别。人体感染猪带绦虫主要因生食含有囊尾蚴的猪肉引起,感染牛带绦虫主要因生食含有囊尾蚴的牛肉引起,人体感染亚洲带绦虫主要因生食含有囊尾蚴的猪肝或野猪等野生动物的内脏引起。绦虫病严重影响人们的身体健康和畜牧业经济的发展,因此加强人体带绦虫病流行区带绦虫的虫种鉴定及流行病学调查,明确各地区带绦虫的优势虫种,指导有关部门制定正确的预防、控制和净化措施,以及对临床患者进行科学有效的治疗均具有重要意义。现有技术可以利用DNA探针进行三种虫种的鉴定,但成本相对较高。 Yamasaki等利用多重PCR扩增线粒体coxl基因,对3种带绦虫进行鉴别,参见“DNA differential diagnosis of taeniasis and cysticercosis by multiplex PCR. J Clin Microbiol" 2004 ;42 548-553. MULTIPLEX PCR DIAGNOSIS FOR TAENIASIS AND CYSTICERCOSIS, SOUTHEAST ASIAN J TROP MED PUBLIC HEALTHVol 35(Suppl 1)2004 275-279,"Molecular Identification of Taenia Tapeworms by Coxl Gene in Koh Kong, Cambodia", Korean J Parasitol Vol. 49, No. 2 :195-197, June 2011。 {Sg— 中在PCR反应体系里需同时加入3对引物,并且对模板纯度和浓度要求较高,同时还需要摸索不同引物之间的比例,另外采用该方法对各DNA样品进行扩增时不容易获得扩增产物。有学者用细胞色素C氧化酶l(mt C0XI)基因片段PCR产物进行PCR反应后鉴别两虫种,或三种虫种,但PCR扩增产物需要测序,时间长,参见“用coxl基因片段的PCR鉴别亚洲带绦虫和牛带绦虫”贵阳医学院学报2009,34(3) :239-261,“云南6地域带绦虫mtCOX I片段序列测定分析”中国人兽共患病学报(2009)25) 12) :1199_1201。另外,现有技术中也有利用PCR产物限制性片段多态性技术,参见“云贵两省三地带绦虫的分子鉴定_核糖体DNA第一内转录间隔区(ITSl)限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析”,中国寄生虫病防治杂志 2005,18(5) 330-332JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, Jan. 2000,38 133-137,"Differentiating Taenia solium and Taenia saginata Infections by Simple Hematoxylin-Eosin Staining and PCR-Restriction Enzyme Analysis,,,用多个酶切对绦虫进行鉴定,但这种方法增加了成本和鉴定的时间
本发明提供一种能同时区分鉴别出检材属于猪带绦虫、牛带绦虫和亚洲带绦虫这三带绦虫的具体种类的试剂盒,以及具体的鉴别方法。本发明的用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒内包括有两对人工序列,即序列表中记载的SEQ No. 1和SEQ No. 2。为方便具体使用,本发明的试剂盒内还可以放置提取 DNA用试剂、PCR扩增用试剂与缓冲液、酶切酶等、本发明的用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒使用方法,其特征在于从检材中提取DNA,然后用试剂盒内的两条引物进行聚合酶链式反应得到产物,将反应产物用琼脂糖凝胶电泳回收后进行酶切反应,然后再在琼脂糖中进行电泳,获得PCR-RFLP指纹图谱,根据PCR-RFLP指纹图谱中是否存在特定条带区分鉴别出检材属于何种带绦虫。本发明的具体操作如下首先进行DNA基因组的提取取20mg左右的绦虫虫体,移入冰水浴冷的研钵中,快速用力研磨成勻浆。加入 350ul的Buffer PBS (购自AXYGEN公司)和0. 9ul RNase A后温和的研磨30s,收集研磨好的组织勻浆350ul中加入150ul的Buffer C-L和20ul的蛋白酶K,漩涡振荡Imin混勻, 置 56°C水浴 30min-60min。然后加入!350ul 的 Buffer P_D,漩涡振荡 30s 混勻,12000 X g 离心lOmin。收集上清入DNA制备管中,12000 Xg离心lmin,弃滤液;加入500ul WBuffer Wl,12000 Xg离心lmin,弃滤液;加入700ul的Buffer W2洗涤,12000 X g离心lmin,弃滤液,重复洗涤一次;将DNA制备管于12000 Xg离心lmin,加入40ul的Eluent,12000 X g离心lmin,即为DNA提取液。进行PCR扩增以DNA基因组为模板,采用上游引物为5,-TTGTGAAGTTACTGCTAATAATTTCGTGT-3,,下游引物为5,-ACGTCAAACCATTCAAACAAGCC-3’,进行聚合酶链式反应,具体参数为PCR扩增为50ul反应体系,包含2 X Premix LA Taq溶液缓冲液25ul (购自TaKaRa公司)、浓度为40 μ mol/L的上游引物2ul、浓度为40 μ mol/L的下游引物2ul、上述DNA提取液2ul、ddH20 19ul ;扩增反应条件为:95°C预变性5min ;94°C变性30s,55°C退火40s,72°C 延伸anin30s,共35个循环;最后一个循环结束后,72°C延伸lOmin,得到PCR产物;琼脂糖凝胶电泳回收目的条带。进行酶切反应将上述PCR 产物 6ul、10XH Buffer 溶液 lul、去离子水 2ul、Nde I 酶 Iul 于 PCR 管中,37°C水浴酶切反应池,然后进行2.0%琼脂糖凝胶电泳,在紫外灯下观察、拍照,获得 PCR-RFLP指纹图谱。谱带鉴别上述PCR-RFLP谱带中若最大条带为1396bp,则为猪带绦虫,若存在586bp和 662bp两条带,则为牛带绦虫,若只存在586bp的条带,则为亚洲带绦虫。本发明的试剂盒成本低廉,检测操作简便,可以精确区分出三种带绦虫的种类可为疫区有关部门制定正确的预防措施以及后续研究工作提供了保障。图1为使用本发明的试剂盒对检材进行检测的琼脂糖凝胶电泳图,图中1为猪带绦虫酶切电泳条带;2为.牛带绦虫酶切电泳条带;3.为DL5000Marker ;4.亚洲带绦虫酶切电泳条带;其中由于846bp和807bp相差不大,故两条带重叠。
本发明涉及一种用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒及使用方法。本发明的用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒内包括有两对人工序列SEQ No.1和SEQ No.2。本发明的用于鉴别区分人带绦虫病种类的试剂盒使用方法是首先从检材中提取DNA,然后用试剂盒内的两条引物进行聚合酶链式反应得到产物,将反应产物用琼脂糖凝胶电泳回收后进行本科切反应,然后再在玉脂糖中进行电泳,获得PCR-RFLP指纹图谱,根据PCR-RFLP指纹图谱中是否存在特定条带区分鉴别出检材属于何种带绦虫。



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